More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1488 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1488  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 319 aa  642    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.373553  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1758  polysaccharide deacetylase family protein  87.5 
 
 		 320 aa  526  1e-148  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00010235  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1863  polysaccharide deacetylase family protein  51.85 
 
 		 324 aa  323  3e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00543619  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1582  polysaccharide deacetylase family protein  50.93 
 
 		 324 aa  319  3e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00773707  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1521  polysaccharide deacetylase family protein  45.54 
 
 		 332 aa  256  3e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0654867  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1802  polysaccharide deacetylase family protein  44.22 
 
 		 332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.12203  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0823  polysaccharide deacetylase family protein  39.03 
 
 		 305 aa  192  5e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000472378  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0810  polysaccharide deacetylase family protein  38.71 
 
 		 305 aa  188  9e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00210366  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  38.57 
 
 		 300 aa  149  7e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4727  polysaccharide deacetylase  37.02 
 
 		 357 aa  139  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000111297  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0950  polysaccharide deacetylase  32.54 
 
 		 331 aa  127  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.942837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3126  polysaccharide deacetylase  32.78 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000165534  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 		 372 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2070  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  38.57 
 
 		 280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2908  polysaccharide deacetylase  36.77 
 
 		 280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.850515  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3178  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  37.14 
 
 		 280 aa  109  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  31.96 
 
 		 277 aa  106  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  35.68 
 
 		 302 aa  105  7e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3196  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase A  36.41 
 
 		 280 aa  105  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.220844  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  31.63 
 
 		 264 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  32.85 
 
 		 522 aa  98.6  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1728  polysaccharide deacetylase family protein  30.29 
 
 		 238 aa  98.2  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000179283  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1456  polysaccharide deacetylase family protein  30.77 
 
 		 238 aa  99  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0998463  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2979  hypothetical protein  35 
 
 		 275 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000165918  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2661  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  35 
 
 		 275 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000138252  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  32.05 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2990  polysaccharide deacetylase  35 
 
 		 275 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000426534  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0538  polysaccharide deacetylase  31.47 
 
 		 323 aa  98.2  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0863369  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2734  polysaccharide deacetylase  35 
 
 		 275 aa  97.4  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000154127  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2685  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  35 
 
 		 275 aa  97.4  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.97841e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2944  polysaccharide deacetylase  35 
 
 		 275 aa  97.4  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000517931  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2943  polysaccharide deacetylase  35 
 
 		 275 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.02279e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2948  polysaccharide deacetylase  34.86 
 
 		 275 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000275955  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  33.33 
 
 		 251 aa  97.1  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2294  polysaccharide deacetylase  34.86 
 
 		 260 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000000923024  unclonable  2.97243e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2736  polysaccharide deacetylase  34.4 
 
 		 275 aa  95.9  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000182255  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  29.58 
 
 		 413 aa  95.5  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2008  polysaccharide deacetylase  35.16 
 
 		 275 aa  95.5  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000244714  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3747  polysaccharide deacetylase  30.99 
 
 		 245 aa  94.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000014318  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5636  putative polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 245 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000255185 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2699  polysaccharide deacetylase  31.03 
 
 		 274 aa  94.7  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000565788  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5312  polysaccharide deacetylase, putative  31.4 
 
 		 254 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5051  polysaccharide deacetylase  31.55 
 
 		 245 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5436  polysaccharide deacetylase  31.55 
 
 		 245 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  31.46 
 
 		 244 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5323  putative polysaccharide deacetylase  29.57 
 
 		 245 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24870  predicted xylanase/chitin deacetylase  30.99 
 
 		 503 aa  92  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1500  polysaccharide deacetylase  32.3 
 
 		 273 aa  92  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000768102  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  33.49 
 
 		 354 aa  91.7  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5292  putative polysaccharide deacetylase  31.07 
 
 		 245 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000730048 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 353 aa  91.3  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4881  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 245 aa  91.3  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  33.49 
 
 		 244 aa  90.9  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4661  polysaccharide deacetylase  31.22 
 
 		 273 aa  91.3  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.708136  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4896  polysaccharide deacetylase  30.58 
 
 		 245 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.434213  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5368  putative polysaccharide deacetylase  30.58 
 
 		 245 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000675459  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  32.86 
 
 		 321 aa  90.5  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  31.11 
 
 		 279 aa  89.7  5e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5592  polysaccharide deacetylase  32.13 
 
 		 272 aa  89.7  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4996  polysaccharide deacetylase  31.53 
 
 		 245 aa  89.7  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  31.8 
 
 		 247 aa  89  9e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  27.98 
 
 		 264 aa  88.6  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2061  polysaccharide deacetylase, putative  30.77 
 
 		 273 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2833  polysaccharide deacetylase  32.16 
 
 		 273 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120678  hitchhiker  0.0000000454714 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2080  putative polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 273 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000146273  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1834  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000185073  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1808  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000183162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1791  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000907429  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1977  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000478204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2012  putative polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.46073e-43 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  30.09 
 
 		 320 aa  87  4e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  28.1 
 
 		 273 aa  87  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1979  putative polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 273 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00191884  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  31.94 
 
 		 871 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  30.14 
 
 		 221 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10670  predicted xylanase/chitin deacetylase  31.94 
 
 		 440 aa  84.3  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01940  predicted xylanase/chitin deacetylase  31.16 
 
 		 571 aa  84  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000016994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1840  polysaccharide deacetylase  30.09 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000153578  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04760  predicted xylanase/chitin deacetylase  29.73 
 
 		 573 aa  83.6  0.000000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000622168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3350  putative polysaccharide deacetylase  27.71 
 
 		 273 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  hitchhiker  0.00000000000000655968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  30.41 
 
 		 468 aa  82.8  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  31.31 
 
 		 927 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  31.31 
 
 		 1115 aa  82  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  31.31 
 
 		 1115 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  31.31 
 
 		 1119 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  31.78 
 
 		 1115 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0661  polysaccharide deacetylase  28.37 
 
 		 205 aa  82.4  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  31.31 
 
 		 872 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0080  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  38.13 
 
 		 162 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  28.77 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  28.84 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  31.9 
 
 		 352 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3341  polysaccharide deacetylase  28.44 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  31.86 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  27.91 
 
 		 542 aa  79.3  0.00000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5017  polysaccharide deacetylase family protein  28.23 
 
 		 211 aa  78.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  29.81 
 
 		 261 aa  79  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  29.38 
 
 		 256 aa  79  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  31.6 
 
 		 465 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4792  putative polysaccharide deacetylase  29.03 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>