More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1863 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1863  polysaccharide deacetylase family protein  100 
 
 		 324 aa  655    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00543619  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1582  polysaccharide deacetylase family protein  95.37 
 
 		 324 aa  605  9.999999999999999e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00773707  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1488  polysaccharide deacetylase  52.81 
 
 		 319 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.373553  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1758  polysaccharide deacetylase family protein  50.78 
 
 		 320 aa  309  5e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00010235  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1802  polysaccharide deacetylase family protein  45 
 
 		 332 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.12203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1521  polysaccharide deacetylase family protein  44.9 
 
 		 332 aa  276  3e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0654867  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0823  polysaccharide deacetylase family protein  41.46 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000472378  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0810  polysaccharide deacetylase family protein  41.87 
 
 		 305 aa  188  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00210366  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4727  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 357 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000111297  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  35.98 
 
 		 300 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0950  polysaccharide deacetylase  35.35 
 
 		 331 aa  129  7.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.942837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3126  polysaccharide deacetylase  36.14 
 
 		 276 aa  119  6e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000165534  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  34.39 
 
 		 372 aa  117  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3196  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase A  36.89 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.220844  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2070  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  32.09 
 
 		 280 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2908  polysaccharide deacetylase  36.89 
 
 		 280 aa  106  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.850515  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0538  polysaccharide deacetylase  32.35 
 
 		 323 aa  105  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0863369  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5051  polysaccharide deacetylase  35.41 
 
 		 245 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5436  polysaccharide deacetylase  35.41 
 
 		 245 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1456  polysaccharide deacetylase family protein  30.42 
 
 		 238 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0998463  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3178  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  36.54 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5292  putative polysaccharide deacetylase  34.93 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000730048 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5368  putative polysaccharide deacetylase  34.08 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000675459  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5312  polysaccharide deacetylase, putative  34.42 
 
 		 254 aa  103  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5636  putative polysaccharide deacetylase  34.45 
 
 		 245 aa  102  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000255185 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4881  polysaccharide deacetylase  35.82 
 
 		 245 aa  102  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1728  polysaccharide deacetylase family protein  29.58 
 
 		 238 aa  102  8e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000179283  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4896  polysaccharide deacetylase  35.32 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.434213  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5323  putative polysaccharide deacetylase  34.45 
 
 		 245 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4996  polysaccharide deacetylase  34.88 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3747  polysaccharide deacetylase  32.87 
 
 		 245 aa  100  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000014318  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  28.18 
 
 		 277 aa  99.8  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 		 264 aa  95.9  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  29.52 
 
 		 353 aa  94  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 321 aa  93.2  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  31.73 
 
 		 522 aa  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  29.52 
 
 		 413 aa  89.4  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5592  polysaccharide deacetylase  32.7 
 
 		 272 aa  88.6  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  26.57 
 
 		 273 aa  88.6  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  33.33 
 
 		 279 aa  88.2  2e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2699  polysaccharide deacetylase  31.92 
 
 		 274 aa  87.8  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000565788  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24870  predicted xylanase/chitin deacetylase  27.41 
 
 		 503 aa  86.3  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  30.23 
 
 		 302 aa  85.9  8e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  28.85 
 
 		 542 aa  84.7  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  33.94 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4661  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.708136  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  27.73 
 
 		 264 aa  82  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  28.71 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  30.56 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2008  polysaccharide deacetylase  30.13 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000244714  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  28.22 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0080  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  38.57 
 
 		 162 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1834  polysaccharide deacetylase  29.11 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000185073  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1808  polysaccharide deacetylase  29.11 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000183162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1791  polysaccharide deacetylase  29.11 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000907429  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1977  polysaccharide deacetylase  29.11 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000478204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2012  putative polysaccharide deacetylase  29.11 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.46073e-43 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5017  polysaccharide deacetylase family protein  29.3 
 
 		 211 aa  79  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1840  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000153578  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1979  putative polysaccharide deacetylase  29.25 
 
 		 273 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00191884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2061  polysaccharide deacetylase, putative  29.3 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219038  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  29.49 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2080  putative polysaccharide deacetylase  29.3 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000146273  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  30.62 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3341  polysaccharide deacetylase  26.87 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  30.29 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  29.96 
 
 		 417 aa  76.6  0.0000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  28.16 
 
 		 468 aa  76.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2734  polysaccharide deacetylase  29.73 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000154127  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2685  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  29.73 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.97841e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2661  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  29.73 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000138252  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2944  polysaccharide deacetylase  29.73 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000517931  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2943  polysaccharide deacetylase  29.73 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.02279e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2990  polysaccharide deacetylase  29.73 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000426534  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1541  polysaccharide deacetylase  25.48 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0577624  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02423  acetylxylan esterase  25.49 
 
 		 260 aa  75.5  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1500  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 273 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000768102  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  27.4 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3350  putative polysaccharide deacetylase  29.19 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  hitchhiker  0.00000000000000655968 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  30.24 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2979  hypothetical protein  29.6 
 
 		 275 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000165918  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1579  polysaccharide deacetylase  26.96 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2736  polysaccharide deacetylase  29.95 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000182255  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3558  xylanase/chitin deacetylase-like protein  23.61 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00485145  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3076  polysaccharide deacetylase  28.85 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112381  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01940  predicted xylanase/chitin deacetylase  28.17 
 
 		 571 aa  73.9  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000016994  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  28.3 
 
 		 522 aa  74.3  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6669  polysaccharide deacetylase  26.03 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.422259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2294  polysaccharide deacetylase  28.46 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000000923024  unclonable  2.97243e-26 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3574  polysaccharide deacetylase  25.42 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.845428  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2948  polysaccharide deacetylase  29.25 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000275955  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  29.27 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2417  polysaccharide deacetylase  25.24 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  31.7 
 
 		 372 aa  72.8  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10670  predicted xylanase/chitin deacetylase  30.1 
 
 		 440 aa  72.8  0.000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2833  polysaccharide deacetylase  27.62 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120678  hitchhiker  0.0000000454714 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  29.02 
 
 		 1120 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  26.07 
 
 		 364 aa  72  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  30.41 
 
 		 373 aa  72.4  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  28.1 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>