More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1521 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1521  polysaccharide deacetylase family protein  100 
 
 		 332 aa  677    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0654867  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1802  polysaccharide deacetylase family protein  95.48 
 
 		 332 aa  622  1e-177  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.12203  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1863  polysaccharide deacetylase family protein  45.57 
 
 		 324 aa  291  8e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00543619  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1582  polysaccharide deacetylase family protein  44.95 
 
 		 324 aa  288  7e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00773707  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1488  polysaccharide deacetylase  45.07 
 
 		 319 aa  266  4e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.373553  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1758  polysaccharide deacetylase family protein  45.31 
 
 		 320 aa  259  3e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00010235  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0810  polysaccharide deacetylase family protein  34.85 
 
 		 305 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00210366  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0823  polysaccharide deacetylase family protein  34.85 
 
 		 305 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000472378  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4727  polysaccharide deacetylase  41.06 
 
 		 357 aa  142  8e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000111297  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  31.06 
 
 		 300 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0950  polysaccharide deacetylase  31.65 
 
 		 331 aa  123  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.942837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3126  polysaccharide deacetylase  29.21 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000165534  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1728  polysaccharide deacetylase family protein  31.91 
 
 		 238 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000179283  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1456  polysaccharide deacetylase family protein  31.49 
 
 		 238 aa  106  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0998463  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1500  polysaccharide deacetylase  29.93 
 
 		 273 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000768102  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3178  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  35.61 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2070  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  35.12 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2908  polysaccharide deacetylase  35.12 
 
 		 280 aa  102  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.850515  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3196  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase A  35.58 
 
 		 280 aa  100  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.220844  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1840  polysaccharide deacetylase  29.25 
 
 		 273 aa  97.4  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000153578  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2008  polysaccharide deacetylase  34.5 
 
 		 275 aa  97.1  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000244714  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0538  polysaccharide deacetylase  28.85 
 
 		 323 aa  97.1  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0863369  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5312  polysaccharide deacetylase, putative  32.69 
 
 		 254 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5592  polysaccharide deacetylase  32.88 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5368  putative polysaccharide deacetylase  32.04 
 
 		 245 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000675459  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2061  polysaccharide deacetylase, putative  32.52 
 
 		 273 aa  94  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219038  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4881  polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 		 245 aa  93.6  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5051  polysaccharide deacetylase  32.04 
 
 		 245 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5436  polysaccharide deacetylase  32.04 
 
 		 245 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2699  polysaccharide deacetylase  29.67 
 
 		 274 aa  93.6  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000565788  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5292  putative polysaccharide deacetylase  32.04 
 
 		 245 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000730048 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2080  putative polysaccharide deacetylase  32.52 
 
 		 273 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000146273  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5323  putative polysaccharide deacetylase  32.04 
 
 		 245 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1834  polysaccharide deacetylase  32.52 
 
 		 273 aa  92.8  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000185073  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1808  polysaccharide deacetylase  32.52 
 
 		 273 aa  92.8  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000183162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1791  polysaccharide deacetylase  32.52 
 
 		 273 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000907429  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1977  polysaccharide deacetylase  32.52 
 
 		 273 aa  92.8  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000478204  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  34.25 
 
 		 522 aa  92.8  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2012  putative polysaccharide deacetylase  32.52 
 
 		 273 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.46073e-43 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  29.27 
 
 		 372 aa  92.4  9e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2948  polysaccharide deacetylase  31.35 
 
 		 275 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000275955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5636  putative polysaccharide deacetylase  32.37 
 
 		 245 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000255185 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1979  putative polysaccharide deacetylase  32.52 
 
 		 273 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00191884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4896  polysaccharide deacetylase  31.55 
 
 		 245 aa  92  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.434213  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3747  polysaccharide deacetylase  32.69 
 
 		 245 aa  91.3  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000014318  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4996  polysaccharide deacetylase  32.37 
 
 		 245 aa  91.3  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2979  hypothetical protein  36.67 
 
 		 275 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000165918  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2833  polysaccharide deacetylase  29.2 
 
 		 273 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120678  hitchhiker  0.0000000454714 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2294  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 		 260 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000000923024  unclonable  2.97243e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2943  polysaccharide deacetylase  36.1 
 
 		 275 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.02279e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2734  polysaccharide deacetylase  36.1 
 
 		 275 aa  89.7  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000154127  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2685  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  36.1 
 
 		 275 aa  89.7  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.97841e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2661  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  35.58 
 
 		 275 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000138252  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2944  polysaccharide deacetylase  36.1 
 
 		 275 aa  89.7  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000517931  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2990  polysaccharide deacetylase  35.58 
 
 		 275 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000426534  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3350  putative polysaccharide deacetylase  32.02 
 
 		 273 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  hitchhiker  0.00000000000000655968 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2736  polysaccharide deacetylase  34.76 
 
 		 275 aa  88.6  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000182255  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  31.31 
 
 		 277 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  30.59 
 
 		 264 aa  87  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  31.43 
 
 		 373 aa  86.7  6e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  31.14 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24870  predicted xylanase/chitin deacetylase  28.1 
 
 		 503 aa  84.7  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  29.26 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  31.22 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4661  polysaccharide deacetylase  35.15 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.708136  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01940  predicted xylanase/chitin deacetylase  31.92 
 
 		 571 aa  83.6  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000016994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04760  predicted xylanase/chitin deacetylase  30.14 
 
 		 573 aa  81.3  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000622168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  28.17 
 
 		 413 aa  80.9  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  30.52 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2943  polysaccharide deacetylase  30.81 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.519142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  27.23 
 
 		 353 aa  79.3  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  28.37 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  30.81 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  30.48 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1710  polysaccharide deacetylase  29.56 
 
 		 427 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190308  normal  0.343412 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1625  polysaccharide deacetylase  29.67 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.679944  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2107  polysaccharide deacetylase  30.24 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.471515  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01375  polysaccharide deacetylase  27.65 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  31.1 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  30.54 
 
 		 320 aa  75.9  0.0000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3574  polysaccharide deacetylase  24.89 
 
 		 267 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.845428  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0080  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  39.09 
 
 		 162 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3449  polysaccharide deacetylase  31.22 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282005  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10670  predicted xylanase/chitin deacetylase  30.24 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2067  polysaccharide deacetylase  31.03 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  30.13 
 
 		 1115 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2500  polysaccharide deacetylase  30.33 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2343  polysaccharide deacetylase  30.1 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  32.02 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2435  polysaccharide deacetylase  27.7 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1696  polysaccharide deacetylase  28.44 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.847499  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0282  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  29.52 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  24.79 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0470  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  34.11 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0398  polysaccharide deacetylase  34.11 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  28.71 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4834  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  34.11 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0540  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  34.11 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0217877  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0489  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  34.11 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>