More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1582 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1582  polysaccharide deacetylase family protein  100 
 
 
324 aa  656    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00773707  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1863  polysaccharide deacetylase family protein  95.37 
 
 
324 aa  628  1e-179  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00543619  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1488  polysaccharide deacetylase  51.97 
 
 
319 aa  317  2e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.373553  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1758  polysaccharide deacetylase family protein  51.68 
 
 
320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00010235  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1802  polysaccharide deacetylase family protein  44.69 
 
 
332 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.12203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1521  polysaccharide deacetylase family protein  44.87 
 
 
332 aa  276  3e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0654867  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0823  polysaccharide deacetylase family protein  37.9 
 
 
305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000472378  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0810  polysaccharide deacetylase family protein  38.22 
 
 
305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00210366  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4727  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
357 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000111297  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  34.64 
 
 
300 aa  138  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0950  polysaccharide deacetylase  34.88 
 
 
331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.942837  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  34.84 
 
 
372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3126  polysaccharide deacetylase  35.96 
 
 
276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000165534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3196  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase A  37.38 
 
 
280 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.220844  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2070  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  30.93 
 
 
280 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2908  polysaccharide deacetylase  31.49 
 
 
280 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.850515  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5051  polysaccharide deacetylase  35.55 
 
 
245 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5436  polysaccharide deacetylase  35.55 
 
 
245 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  29 
 
 
277 aa  106  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5368  putative polysaccharide deacetylase  34.53 
 
 
245 aa  106  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000675459  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5292  putative polysaccharide deacetylase  35.07 
 
 
245 aa  106  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000730048 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5312  polysaccharide deacetylase, putative  34.88 
 
 
254 aa  105  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4881  polysaccharide deacetylase  35.96 
 
 
245 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5636  putative polysaccharide deacetylase  34.6 
 
 
245 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000255185 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0538  polysaccharide deacetylase  32.35 
 
 
323 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0863369  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3178  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  36.54 
 
 
280 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4896  polysaccharide deacetylase  35.47 
 
 
245 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.434213  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5323  putative polysaccharide deacetylase  34.6 
 
 
245 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4996  polysaccharide deacetylase  35.35 
 
 
245 aa  103  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1456  polysaccharide deacetylase family protein  32.7 
 
 
238 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0998463  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3747  polysaccharide deacetylase  32.87 
 
 
245 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000014318  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1728  polysaccharide deacetylase family protein  31.75 
 
 
238 aa  99.8  6e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000179283  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  29.52 
 
 
353 aa  95.1  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  31.51 
 
 
264 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  33.78 
 
 
321 aa  94.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 
522 aa  92.4  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  25.64 
 
 
413 aa  92  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  31.35 
 
 
279 aa  91.3  2e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  26.57 
 
 
273 aa  89.7  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24870  predicted xylanase/chitin deacetylase  27.47 
 
 
503 aa  88.2  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2699  polysaccharide deacetylase  32.39 
 
 
274 aa  88.2  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000565788  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  29.52 
 
 
302 aa  87.4  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5592  polysaccharide deacetylase  32.23 
 
 
272 aa  86.7  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  28.85 
 
 
542 aa  85.9  8e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  34.15 
 
 
221 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  28.71 
 
 
242 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  29.19 
 
 
305 aa  83.2  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  31.02 
 
 
251 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  28.18 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4661  polysaccharide deacetylase  31.1 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.708136  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  30.62 
 
 
354 aa  80.1  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  30.29 
 
 
244 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  31.55 
 
 
244 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  29.95 
 
 
261 aa  79.7  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5017  polysaccharide deacetylase family protein  29.3 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  30.4 
 
 
417 aa  79  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2008  polysaccharide deacetylase  29.71 
 
 
275 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000244714  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2734  polysaccharide deacetylase  30.19 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000154127  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2943  polysaccharide deacetylase  30.19 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.02279e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2685  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  30.19 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.97841e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10670  predicted xylanase/chitin deacetylase  29.55 
 
 
440 aa  78.2  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2661  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  30.19 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000138252  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2944  polysaccharide deacetylase  30.19 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000517931  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2990  polysaccharide deacetylase  30.19 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000426534  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1541  polysaccharide deacetylase  25.48 
 
 
280 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0577624  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1834  polysaccharide deacetylase  28.44 
 
 
273 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000185073  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1808  polysaccharide deacetylase  28.44 
 
 
273 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000183162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1791  polysaccharide deacetylase  28.44 
 
 
273 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000907429  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  27.88 
 
 
320 aa  77.4  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1977  polysaccharide deacetylase  28.44 
 
 
273 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000478204  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3341  polysaccharide deacetylase  26.27 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732984  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2012  putative polysaccharide deacetylase  28.44 
 
 
273 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.46073e-43 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1979  putative polysaccharide deacetylase  28.44 
 
 
273 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00191884  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0080  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  37.14 
 
 
162 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2979  hypothetical protein  30.84 
 
 
275 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000165918  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2736  polysaccharide deacetylase  30.29 
 
 
275 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000182255  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1840  polysaccharide deacetylase  29.52 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000153578  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3558  xylanase/chitin deacetylase-like protein  23.61 
 
 
321 aa  75.9  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00485145  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  30.24 
 
 
373 aa  75.9  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3076  polysaccharide deacetylase  27.23 
 
 
265 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112381  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2061  polysaccharide deacetylase, putative  28.64 
 
 
273 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219038  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1579  polysaccharide deacetylase  26.96 
 
 
262 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2080  putative polysaccharide deacetylase  28.64 
 
 
273 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000146273  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  28.37 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  29.46 
 
 
1120 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3574  polysaccharide deacetylase  27.36 
 
 
267 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.845428  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2948  polysaccharide deacetylase  29.58 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000275955  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02423  acetylxylan esterase  25 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2294  polysaccharide deacetylase  29.58 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000000923024  unclonable  2.97243e-26 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2417  polysaccharide deacetylase  24.76 
 
 
280 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  27.83 
 
 
522 aa  74.3  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  27.96 
 
 
307 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  32.52 
 
 
294 aa  73.6  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  27.18 
 
 
468 aa  73.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1683  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  29.31 
 
 
234 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.381461  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  29.27 
 
 
229 aa  73.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1500  polysaccharide deacetylase  28.1 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000768102  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01940  predicted xylanase/chitin deacetylase  26.76 
 
 
571 aa  73.2  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000016994  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  31.7 
 
 
372 aa  73.6  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  26.92 
 
 
387 aa  73.6  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>