More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0823 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0823  polysaccharide deacetylase family protein  100 
 
 		 305 aa  622  1e-177  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000472378  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0810  polysaccharide deacetylase family protein  98.03 
 
 		 305 aa  610  9.999999999999999e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00210366  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1582  polysaccharide deacetylase family protein  37.9 
 
 		 324 aa  200  3e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00773707  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1488  polysaccharide deacetylase  39.03 
 
 		 319 aa  192  4e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.373553  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1758  polysaccharide deacetylase family protein  38.14 
 
 		 320 aa  192  6e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00010235  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1863  polysaccharide deacetylase family protein  41.46 
 
 		 324 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00543619  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1802  polysaccharide deacetylase family protein  42.03 
 
 		 332 aa  172  7.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.12203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1521  polysaccharide deacetylase family protein  41.06 
 
 		 332 aa  169  6e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0654867  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0950  polysaccharide deacetylase  38.39 
 
 		 331 aa  136  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.942837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4727  polysaccharide deacetylase  37.44 
 
 		 357 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000111297  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3126  polysaccharide deacetylase  36.15 
 
 		 276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000165534  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  39.13 
 
 		 300 aa  123  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0538  polysaccharide deacetylase  34.93 
 
 		 323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0863369  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  35.21 
 
 		 372 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24870  predicted xylanase/chitin deacetylase  36.2 
 
 		 503 aa  108  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  33.62 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2699  polysaccharide deacetylase  34.09 
 
 		 274 aa  106  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000565788  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  33.33 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5051  polysaccharide deacetylase  32.23 
 
 		 245 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5436  polysaccharide deacetylase  32.23 
 
 		 245 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5312  polysaccharide deacetylase, putative  32.23 
 
 		 254 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2833  polysaccharide deacetylase  31.51 
 
 		 273 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120678  hitchhiker  0.0000000454714 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4996  polysaccharide deacetylase  32.38 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5292  putative polysaccharide deacetylase  32.23 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000730048 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1456  polysaccharide deacetylase family protein  30.92 
 
 		 238 aa  97.1  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0998463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4881  polysaccharide deacetylase  32.23 
 
 		 245 aa  96.7  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4896  polysaccharide deacetylase  31.75 
 
 		 245 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.434213  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  32.58 
 
 		 321 aa  96.3  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  30.37 
 
 		 244 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3747  polysaccharide deacetylase  31.92 
 
 		 245 aa  95.5  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000014318  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  32.08 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5636  putative polysaccharide deacetylase  31.28 
 
 		 245 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000255185 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5323  putative polysaccharide deacetylase  31.28 
 
 		 245 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1728  polysaccharide deacetylase family protein  30.92 
 
 		 238 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000179283  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  31.86 
 
 		 247 aa  94.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5368  putative polysaccharide deacetylase  31.28 
 
 		 245 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000675459  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  32.57 
 
 		 479 aa  93.6  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1500  polysaccharide deacetylase  30.88 
 
 		 273 aa  93.2  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000768102  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04760  predicted xylanase/chitin deacetylase  30 
 
 		 573 aa  92.8  7e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000622168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5592  polysaccharide deacetylase  31.78 
 
 		 272 aa  92  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  29.9 
 
 		 320 aa  91.7  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  34.07 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3178  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  32.06 
 
 		 280 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2175  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  33.18 
 
 		 221 aa  92  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1579  polysaccharide deacetylase  25.89 
 
 		 251 aa  91.7  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3591  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0292  polysaccharide deacetylase  29.24 
 
 		 317 aa  90.5  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  32.27 
 
 		 481 aa  90.1  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1840  polysaccharide deacetylase  29.25 
 
 		 273 aa  90.1  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000153578  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  30.18 
 
 		 417 aa  90.1  5e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2070  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  31.58 
 
 		 280 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2734  polysaccharide deacetylase  31.49 
 
 		 275 aa  89.4  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000154127  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  27.97 
 
 		 302 aa  89.4  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2685  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  31.49 
 
 		 275 aa  89.4  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.97841e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2943  polysaccharide deacetylase  31.49 
 
 		 275 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.02279e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2944  polysaccharide deacetylase  31.49 
 
 		 275 aa  89.4  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000517931  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2661  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  31.49 
 
 		 275 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000138252  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  31.75 
 
 		 291 aa  89.4  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  28.7 
 
 		 217 aa  89.4  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2990  polysaccharide deacetylase  31.49 
 
 		 275 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000426534  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  29.13 
 
 		 264 aa  89  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2008  polysaccharide deacetylase  30.51 
 
 		 275 aa  89  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000244714  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2979  hypothetical protein  31.06 
 
 		 275 aa  89  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000165918  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3196  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase A  31.65 
 
 		 280 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.220844  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  31.88 
 
 		 258 aa  88.6  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2948  polysaccharide deacetylase  32.04 
 
 		 275 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000275955  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01375  polysaccharide deacetylase  31.43 
 
 		 218 aa  87.8  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2294  polysaccharide deacetylase  32.52 
 
 		 260 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000000923024  unclonable  2.97243e-26 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  32.54 
 
 		 373 aa  87.8  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  30.33 
 
 		 387 aa  88.2  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  31.43 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  29.95 
 
 		 279 aa  87.4  3e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  30.99 
 
 		 479 aa  87.4  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  33.19 
 
 		 1120 aa  87  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  30.41 
 
 		 1118 aa  87.4  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2061  polysaccharide deacetylase, putative  29.91 
 
 		 273 aa  87  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219038  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2080  putative polysaccharide deacetylase  29.91 
 
 		 273 aa  87  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000146273  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2908  polysaccharide deacetylase  31.1 
 
 		 280 aa  86.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.850515  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  30.48 
 
 		 275 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1834  polysaccharide deacetylase  29.91 
 
 		 273 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000185073  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2012  putative polysaccharide deacetylase  29.91 
 
 		 273 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.46073e-43 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1808  polysaccharide deacetylase  29.91 
 
 		 273 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000183162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1791  polysaccharide deacetylase  29.91 
 
 		 273 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000907429  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  27.04 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1977  polysaccharide deacetylase  29.91 
 
 		 273 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000478204  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0336  polysaccharide deacetylase  27.23 
 
 		 284 aa  85.5  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5017  polysaccharide deacetylase family protein  27.83 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2736  polysaccharide deacetylase  31.88 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000182255  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.62 
 
 		 1115 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  27.71 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  27.73 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1979  putative polysaccharide deacetylase  29.91 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00191884  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1959  putative polysaccharide deacetylase  30.97 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.29961  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  30.48 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  31.07 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  27.73 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  30.58 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.62 
 
 		 1115 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  28.47 
 
 		 1115 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2789  xylanase/chitin deacetylase  29.13 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>