More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2175 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2175  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  100 
 
 		 221 aa  465  9.999999999999999e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0661  polysaccharide deacetylase  40.99 
 
 		 205 aa  192  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2237  polysaccharide deacetylase  40.27 
 
 		 215 aa  190  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5477  polysaccharide deacetylase  42.01 
 
 		 206 aa  189  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0244  polysaccharide deacetylase  41.43 
 
 		 208 aa  189  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1625  polysaccharide deacetylase  41.89 
 
 		 212 aa  187  9e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.679944  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2145  polysaccharide deacetylase  39.05 
 
 		 201 aa  174  9.999999999999999e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01375  polysaccharide deacetylase  41.67 
 
 		 218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 		 264 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  33.97 
 
 		 302 aa  120  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  34.3 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  33.79 
 
 		 251 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  32.84 
 
 		 405 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  33.66 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  32.37 
 
 		 321 aa  112  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  34.52 
 
 		 241 aa  109  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  32.82 
 
 		 221 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0643  polysaccharide deacetylase  34.12 
 
 		 425 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  32.49 
 
 		 213 aa  105  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  32.99 
 
 		 259 aa  104  8e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  32.99 
 
 		 241 aa  105  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  32.49 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  32.49 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  32.49 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  32.49 
 
 		 241 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0200  polysaccharide deacetylase  30.16 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  35.5 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  33.17 
 
 		 276 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  28.86 
 
 		 430 aa  103  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  35.1 
 
 		 479 aa  102  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  33.17 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  33.85 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  34.24 
 
 		 243 aa  102  6e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  31.48 
 
 		 372 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  30.04 
 
 		 247 aa  102  7e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  33.17 
 
 		 275 aa  101  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  32.99 
 
 		 244 aa  100  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  32.66 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  32.66 
 
 		 275 aa  100  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  32.66 
 
 		 275 aa  100  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  32.66 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  31.63 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  32.99 
 
 		 217 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  32.16 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  32.99 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1579  polysaccharide deacetylase  28.9 
 
 		 251 aa  99.8  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  31.91 
 
 		 275 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1081  polysaccharide deacetylase  31.41 
 
 		 242 aa  99.8  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  33.65 
 
 		 479 aa  99.8  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5017  polysaccharide deacetylase family protein  33.8 
 
 		 211 aa  99  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3931  polysaccharide deacetylase  30.45 
 
 		 224 aa  99  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  31.79 
 
 		 258 aa  97.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  30.19 
 
 		 481 aa  96.3  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  31.66 
 
 		 275 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6669  polysaccharide deacetylase  27.94 
 
 		 240 aa  96.3  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.422259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  27.72 
 
 		 413 aa  95.9  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1185  polysaccharide deacetylase  28.71 
 
 		 236 aa  95.9  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 		 258 aa  95.9  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 		 294 aa  96.3  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  31.94 
 
 		 373 aa  95.5  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  30.1 
 
 		 320 aa  95.5  5e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1515  polysaccharide deacetylase  28.3 
 
 		 222 aa  95.1  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.416831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  30.26 
 
 		 244 aa  95.1  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1978  polysaccharide deacetylase  30.85 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 368 aa  94.4  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  29.85 
 
 		 317 aa  94  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  29.82 
 
 		 488 aa  93.6  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  33.7 
 
 		 752 aa  93.2  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0810  polysaccharide deacetylase family protein  33.18 
 
 		 305 aa  92.8  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00210366  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0900  polysaccharide deacetylase  30.63 
 
 		 246 aa  92.8  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.479614 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  30.88 
 
 		 264 aa  92.8  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  32.16 
 
 		 468 aa  92.8  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  31.6 
 
 		 300 aa  92.4  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0800  polysaccharide deacetylase  31.47 
 
 		 520 aa  92.4  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0823  polysaccharide deacetylase family protein  33.18 
 
 		 305 aa  92  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000472378  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  28.65 
 
 		 229 aa  91.7  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  32.66 
 
 		 372 aa  91.7  9e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  31.41 
 
 		 387 aa  90.9  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  30.57 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2789  xylanase/chitin deacetylase  28.8 
 
 		 244 aa  90.1  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  29.11 
 
 		 927 aa  89.7  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  29.11 
 
 		 1115 aa  89.7  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  29.11 
 
 		 1119 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  29.65 
 
 		 299 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  27.52 
 
 		 272 aa  89.7  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  29.11 
 
 		 1115 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  29.8 
 
 		 522 aa  89.7  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  31.63 
 
 		 250 aa  89.7  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  29.11 
 
 		 1115 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  29.41 
 
 		 1099 aa  89.4  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 		 404 aa  89.4  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  30.05 
 
 		 291 aa  89  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  30.35 
 
 		 301 aa  88.6  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  29.59 
 
 		 242 aa  88.6  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  32.56 
 
 		 217 aa  88.6  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1847  polysaccharide deacetylase  31.03 
 
 		 286 aa  88.2  9e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4727  polysaccharide deacetylase  29.56 
 
 		 357 aa  88.2  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000111297  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  27.5 
 
 		 413 aa  87.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>