More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0661 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0661  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
205 aa  430  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5477  polysaccharide deacetylase  54.11 
 
 
206 aa  238  4e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947661  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0244  polysaccharide deacetylase  54.31 
 
 
208 aa  231  8.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2237  polysaccharide deacetylase  54.41 
 
 
215 aa  230  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01375  polysaccharide deacetylase  47.25 
 
 
218 aa  211  5.999999999999999e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1625  polysaccharide deacetylase  46.67 
 
 
212 aa  211  5.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.679944  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2175  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  40.99 
 
 
221 aa  192  4e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_002950  PG2145  polysaccharide deacetylase  43.43 
 
 
201 aa  184  8e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  34.39 
 
 
277 aa  112  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0643  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 
425 aa  108  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  33.01 
 
 
264 aa  107  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  35.48 
 
 
305 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  35.83 
 
 
302 aa  106  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  33 
 
 
199 aa  105  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  34 
 
 
251 aa  102  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  32.99 
 
 
279 aa  100  1e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  29.69 
 
 
244 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1551  polysaccharide deacetylase  37.27 
 
 
243 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  32.02 
 
 
372 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  29.74 
 
 
241 aa  99.8  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  34.41 
 
 
229 aa  99.8  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  32.81 
 
 
321 aa  99  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  29.74 
 
 
241 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  29.23 
 
 
213 aa  98.2  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  29.17 
 
 
241 aa  97.4  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  29.74 
 
 
220 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  29.23 
 
 
241 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  29.23 
 
 
213 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  29.23 
 
 
213 aa  97.1  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  32.64 
 
 
373 aa  96.7  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  29.23 
 
 
213 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0650  polysaccharide deacetylase  32.47 
 
 
233 aa  96.7  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  35.98 
 
 
259 aa  97.1  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  33.18 
 
 
368 aa  96.3  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  31.09 
 
 
244 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1834  polysaccharide deacetylase  32.54 
 
 
273 aa  95.9  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000185073  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1808  polysaccharide deacetylase  32.54 
 
 
273 aa  95.9  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000183162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1791  polysaccharide deacetylase  32.54 
 
 
273 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000907429  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  30.57 
 
 
217 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1977  polysaccharide deacetylase  32.54 
 
 
273 aa  95.9  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000478204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2012  putative polysaccharide deacetylase  32.54 
 
 
273 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.46073e-43 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3178  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  32.46 
 
 
280 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1979  putative polysaccharide deacetylase  32.54 
 
 
273 aa  95.1  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00191884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2061  polysaccharide deacetylase, putative  32.54 
 
 
273 aa  95.1  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219038  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2080  putative polysaccharide deacetylase  32.54 
 
 
273 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000146273  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  32.11 
 
 
255 aa  94  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  32.97 
 
 
261 aa  94  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1500  polysaccharide deacetylase  33.85 
 
 
273 aa  94.4  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000768102  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  32.24 
 
 
468 aa  93.2  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  30.61 
 
 
258 aa  93.6  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3350  putative polysaccharide deacetylase  33.49 
 
 
273 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  hitchhiker  0.00000000000000655968 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  29.1 
 
 
291 aa  92.8  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  28.93 
 
 
300 aa  92.8  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  29.76 
 
 
258 aa  93.2  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 
256 aa  92.4  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  35.8 
 
 
204 aa  92  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0408  peptidoglycan GlcNAc deacetylase  31.31 
 
 
240 aa  91.7  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2070  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  31.94 
 
 
280 aa  91.3  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1185  polysaccharide deacetylase  28.88 
 
 
409 aa  90.5  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1728  polysaccharide deacetylase family protein  33.51 
 
 
238 aa  90.9  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000179283  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  32.6 
 
 
413 aa  90.5  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  25.64 
 
 
221 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 
204 aa  90.1  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1840  polysaccharide deacetylase  32.64 
 
 
273 aa  90.1  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000153578  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1579  polysaccharide deacetylase  29.35 
 
 
251 aa  90.5  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3591  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5592  polysaccharide deacetylase  32.82 
 
 
272 aa  90.5  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  30.43 
 
 
344 aa  90.1  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1456  polysaccharide deacetylase family protein  32.47 
 
 
238 aa  90.1  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0998463  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  27.4 
 
 
247 aa  89.4  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  31.35 
 
 
276 aa  89  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  32.09 
 
 
488 aa  89  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2833  polysaccharide deacetylase  32.99 
 
 
273 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120678  hitchhiker  0.0000000454714 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4661  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
273 aa  89  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.708136  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  29 
 
 
413 aa  88.6  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2908  polysaccharide deacetylase  30.89 
 
 
280 aa  88.6  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.850515  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  29.95 
 
 
522 aa  88.6  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6669  polysaccharide deacetylase  25.93 
 
 
240 aa  88.6  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.422259  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5017  polysaccharide deacetylase family protein  31.67 
 
 
211 aa  88.2  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  31.35 
 
 
275 aa  88.2  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  31.35 
 
 
275 aa  88.2  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  32.43 
 
 
275 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  31.35 
 
 
275 aa  88.2  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  31.35 
 
 
275 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  31.35 
 
 
275 aa  88.2  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  31.44 
 
 
373 aa  87.8  9e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  31.41 
 
 
275 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  31.05 
 
 
307 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  28.99 
 
 
289 aa  87.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  30.37 
 
 
264 aa  87.8  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2866  polysaccharide deacetylase  32.64 
 
 
382 aa  87.8  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  29.84 
 
 
387 aa  87.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2948  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 
275 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000275955  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1924  polysaccharide deacetylase, putative  30.46 
 
 
234 aa  87  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.267114  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3218  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 
465 aa  86.7  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.578565  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  31.05 
 
 
275 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0200  polysaccharide deacetylase  28.18 
 
 
240 aa  86.3  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4727  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
357 aa  86.3  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000111297  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  27.62 
 
 
324 aa  85.9  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  30 
 
 
258 aa  86.3  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>