25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3917 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3917  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 259 aa  535  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3505  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2795  polysaccharide deacetylase  24.8 
 
 		 600 aa  52.4  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0146758 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1686  polysaccharide deacetylase  20.89 
 
 		 255 aa  52  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.0457798 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0181  polysaccharide deacetylase  27.15 
 
 		 353 aa  51.6  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0615  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 		 843 aa  48.9  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00286732 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1231  polysaccharide deacetylase  31.43 
 
 		 630 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.534738  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 		 291 aa  47  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0880  polysaccharide deacetylase  31.13 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  24.82 
 
 		 348 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0161  polysaccharide deacetylase  26.35 
 
 		 342 aa  45.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1454  polysaccharide deacetylase  25.15 
 
 		 201 aa  44.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0891104  hitchhiker  0.0000678514 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  29.82 
 
 		 261 aa  43.9  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  33.93 
 
 		 417 aa  43.5  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3179  polysaccharide deacetylase  40 
 
 		 295 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  24.65 
 
 		 348 aa  42.7  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  24.65 
 
 		 348 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1639  polysaccharide deacetylase domain protein  28.26 
 
 		 269 aa  42.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  24.65 
 
 		 348 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3339  polysaccharide deacetylase  26.17 
 
 		 434 aa  42.7  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00946214 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  33.56 
 
 		 271 aa  42.4  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1446  polysaccharide deacetylase  26.47 
 
 		 280 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.781341  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  24.65 
 
 		 348 aa  42.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  24.65 
 
 		 348 aa  42.4  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  24.65 
 
 		 348 aa  42  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>