77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0615 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0615  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
843 aa  1685    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00286732 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  63.34 
 
 
835 aa  434  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1231  polysaccharide deacetylase  48.33 
 
 
630 aa  414  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.534738  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2882  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  60.55 
 
 
939 aa  408  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1227  polysaccharide deacetylase  52.16 
 
 
657 aa  409  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3554  polysaccharide deacetylase  51.86 
 
 
630 aa  392  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1230  polysaccharide deacetylase  44.75 
 
 
482 aa  358  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3348  hypothetical protein  52.91 
 
 
913 aa  358  2.9999999999999997e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3555  polysaccharide deacetylase  41.36 
 
 
487 aa  322  9.999999999999999e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6409  Peptidase S53 propeptide  39.59 
 
 
1027 aa  232  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.276013 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2337  polysaccharide deacetylase  40.3 
 
 
500 aa  190  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00797389  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0377  hypothetical protein  48.1 
 
 
210 aa  178  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0880  polysaccharide deacetylase  39.39 
 
 
271 aa  157  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1639  polysaccharide deacetylase domain protein  32.38 
 
 
269 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1454  polysaccharide deacetylase  34.15 
 
 
201 aa  73.9  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0891104  hitchhiker  0.0000678514 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  34.15 
 
 
598 aa  72.4  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  29.69 
 
 
270 aa  70.9  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2794  polysaccharide deacetylase  29.64 
 
 
597 aa  63.5  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0412434 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0440  polysaccharide deacetylase  28.19 
 
 
283 aa  58.5  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  29.32 
 
 
233 aa  57.8  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2795  polysaccharide deacetylase  24.6 
 
 
600 aa  57  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0146758 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  32.09 
 
 
239 aa  57.4  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  32.09 
 
 
239 aa  57  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 
251 aa  56.6  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1686  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 
255 aa  55.8  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.0457798 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0894  parallel beta-helix repeat protein  27.02 
 
 
755 aa  55.5  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0924  polysaccharide deacetylase  30.88 
 
 
173 aa  55.5  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  28.57 
 
 
233 aa  55.5  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  30.83 
 
 
233 aa  54.3  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  29.46 
 
 
321 aa  54.3  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3200  polysaccharide deacetylase  26.29 
 
 
594 aa  53.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000473135  hitchhiker  0.00151321 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  25.81 
 
 
319 aa  53.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 
1015 aa  52.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  33.13 
 
 
264 aa  52.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2642  polysaccharide deacetylase  36.84 
 
 
397 aa  52.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.149181  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0900  polysaccharide deacetylase  28.5 
 
 
246 aa  52  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.479614 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  26.62 
 
 
645 aa  52  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  34.92 
 
 
510 aa  51.6  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2823  polysaccharide deacetylase  34.69 
 
 
400 aa  51.6  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.42622  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3874  polysaccharide deacetylase  29.13 
 
 
281 aa  51.2  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0175  polysaccharide deacetylase  28.39 
 
 
378 aa  51.2  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.122625  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2945  polysaccharide deacetylase  34.78 
 
 
398 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1536  polysaccharide deacetylase  26.29 
 
 
257 aa  50.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3917  polysaccharide deacetylase  29.71 
 
 
259 aa  50.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  27.07 
 
 
249 aa  50.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2853  polysaccharide deacetylase  34.78 
 
 
398 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2728  polysaccharide deacetylase  34.69 
 
 
400 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2876  polysaccharide deacetylase  27.03 
 
 
257 aa  49.7  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  30.37 
 
 
244 aa  49.7  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  29.55 
 
 
234 aa  50.1  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2761  polysaccharide deacetylase  34.78 
 
 
398 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0205212  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  27.59 
 
 
257 aa  49.3  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1907  polysaccharide deacetylase  25.11 
 
 
282 aa  48.5  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  29.77 
 
 
590 aa  48.5  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0677  chitooligosaccharide deacetylase-like  26.46 
 
 
267 aa  48.1  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.457424  unclonable  0.0000000136805 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  25.97 
 
 
291 aa  48.1  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4358  polysaccharide deacetylase  28.29 
 
 
265 aa  47.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  35.64 
 
 
1748 aa  47  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0853  polysaccharide deacetylase  31.41 
 
 
318 aa  47.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000296204  normal  0.358313 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  29.32 
 
 
253 aa  47.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0146  polysaccharide deacetylase  27.45 
 
 
266 aa  47  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 
322 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  28.46 
 
 
274 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2730  polysaccharide deacetylase  24.6 
 
 
274 aa  46.6  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  25.56 
 
 
282 aa  47  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3076  polysaccharide deacetylase  30.69 
 
 
258 aa  45.8  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18670  predicted xylanase/chitin deacetylase  23.88 
 
 
289 aa  46.2  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  34.12 
 
 
316 aa  46.2  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3339  polysaccharide deacetylase  30.16 
 
 
434 aa  45.8  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00946214 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  26.71 
 
 
261 aa  45.4  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3089  polysaccharide deacetylase  28.87 
 
 
239 aa  45.4  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  25.38 
 
 
289 aa  45.4  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0673  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
249 aa  45.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.250144  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4355  polysaccharide deacetylase  22.98 
 
 
251 aa  44.7  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.409612  normal  0.738025 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  24.82 
 
 
316 aa  44.7  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  28.33 
 
 
542 aa  44.3  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1587  polysaccharide deacetylase  24.86 
 
 
626 aa  44.3  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0605374  normal  0.689393 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>