219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0146 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0146  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
266 aa  557  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0232  polysaccharide deacetylase  55.77 
 
 
265 aa  317  2e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.621532  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2723  polysaccharide deacetylase  54.28 
 
 
265 aa  295  6e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2730  polysaccharide deacetylase  49.81 
 
 
274 aa  265  4e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0880  polysaccharide deacetylase  32.28 
 
 
271 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1639  polysaccharide deacetylase domain protein  32.82 
 
 
269 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1231  polysaccharide deacetylase  27.87 
 
 
630 aa  72.8  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.534738  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  30.28 
 
 
319 aa  69.7  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  26.49 
 
 
270 aa  68.2  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3554  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 
630 aa  66.2  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  30.89 
 
 
199 aa  64.3  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2795  polysaccharide deacetylase  27.43 
 
 
600 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0146758 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  28.76 
 
 
224 aa  63.5  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  24.42 
 
 
258 aa  63.9  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  28.97 
 
 
590 aa  63.9  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  29.79 
 
 
282 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2320  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 
313 aa  60.1  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  30.16 
 
 
289 aa  59.7  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1228  polysaccharide deacetylase  32.43 
 
 
327 aa  59.7  0.00000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  29.46 
 
 
259 aa  59.3  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  23.78 
 
 
239 aa  58.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2337  polysaccharide deacetylase  28.33 
 
 
500 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00797389  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  27.41 
 
 
261 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0658  xylanase/chitin deacetylase-like protein  27.88 
 
 
221 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  23.78 
 
 
239 aa  57.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3555  polysaccharide deacetylase  27.45 
 
 
487 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  29.51 
 
 
255 aa  57  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  28.15 
 
 
316 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1230  polysaccharide deacetylase  25.62 
 
 
482 aa  56.6  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8504  polysaccharide deacetylase  27.54 
 
 
223 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  0.0143221 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3066  polysaccharide deacetylase  26.77 
 
 
283 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00688884  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2458  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  25.84 
 
 
299 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0476664  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  30.43 
 
 
292 aa  55.8  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  29.33 
 
 
278 aa  55.5  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3904  putative polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
299 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1729  polysaccharide deacetylase  32.22 
 
 
316 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3339  polysaccharide deacetylase  30.71 
 
 
434 aa  55.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00946214 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01800  chitin deacetylase, putative  32.73 
 
 
470 aa  53.9  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.61842  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  24.29 
 
 
306 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  24.29 
 
 
306 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0684  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  26.77 
 
 
283 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.934486 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1340  putative polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
299 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.236296 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  26.85 
 
 
234 aa  53.1  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3657  polysaccharide deacetylase  27.73 
 
 
299 aa  53.1  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3547  polysaccharide deacetylase  27.73 
 
 
299 aa  53.1  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3565  polysaccharide deacetylase  27.73 
 
 
299 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3943  polysaccharide deacetylase  27.73 
 
 
299 aa  53.1  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3817  putative polysaccharide deacetylase  27.73 
 
 
299 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.2968800000000001e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3628  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  27.73 
 
 
299 aa  52.8  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  25.55 
 
 
322 aa  52.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3853  putative polysaccharide deacetylase  27.73 
 
 
299 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114111  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3844  polysaccharide deacetylase, putative  27.73 
 
 
299 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  25.83 
 
 
279 aa  52  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  30.69 
 
 
238 aa  52  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  25.64 
 
 
244 aa  52  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  27.97 
 
 
273 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1162  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  25.48 
 
 
321 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00597989  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  29.27 
 
 
263 aa  51.6  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  29.66 
 
 
274 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  25.36 
 
 
253 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2473  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  30 
 
 
279 aa  50.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  32.2 
 
 
352 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  30.43 
 
 
417 aa  50.1  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0351  polysaccharide deacetylase  32.35 
 
 
176 aa  50.4  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172222 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  22.5 
 
 
251 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  24.39 
 
 
238 aa  50.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1057  polysaccharide deacetylase  26.87 
 
 
241 aa  50.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00359721  hitchhiker  0.000209945 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  30 
 
 
542 aa  50.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1172  polysaccharide deacetylase  30.09 
 
 
281 aa  50.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1774  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  29 
 
 
279 aa  50.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  24.39 
 
 
238 aa  50.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0189593 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06518  polysaccharide deacetylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G05030)  28.95 
 
 
295 aa  49.3  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  25.64 
 
 
598 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4674  polysaccharide deacetylase  24.24 
 
 
234 aa  49.3  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2360  polysaccharide deacetylase  26 
 
 
293 aa  49.3  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1121  polysaccharide deacetylase  22.67 
 
 
294 aa  49.3  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  28.95 
 
 
645 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  26.47 
 
 
276 aa  48.9  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  25 
 
 
274 aa  48.9  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  26.13 
 
 
254 aa  48.9  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  28.12 
 
 
244 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  27.52 
 
 
267 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1878  polysaccharide deacetylase family protein  28.16 
 
 
261 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117322  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1536  polysaccharide deacetylase  24.79 
 
 
257 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10670  predicted xylanase/chitin deacetylase  24.37 
 
 
440 aa  47.4  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3669  polysaccharide deacetylase  30.51 
 
 
250 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  27.5 
 
 
247 aa  47.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 
242 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  32.39 
 
 
322 aa  47.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  27.59 
 
 
321 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4982  polysaccharide deacetylase  22.45 
 
 
292 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560219  normal  0.0180335 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  25.97 
 
 
275 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  25.97 
 
 
275 aa  47  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  25.97 
 
 
275 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1443  polysaccharide deacetylase  27.68 
 
 
320 aa  47  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  26.17 
 
 
1002 aa  47.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1227  polysaccharide deacetylase  25.83 
 
 
657 aa  47  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 
413 aa  47  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0503  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 
705 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0309  polysaccharide deacetylase  25 
 
 
361 aa  47.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>