48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3555 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3555  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 487 aa  990    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1230  polysaccharide deacetylase  63.62 
 
 		 482 aa  570  1e-161  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1231  polysaccharide deacetylase  53.38 
 
 		 630 aa  412  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.534738  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3554  polysaccharide deacetylase  50.75 
 
 		 630 aa  391  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0615  polysaccharide deacetylase  41.25 
 
 		 843 aa  318  1e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00286732 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1227  polysaccharide deacetylase  43.85 
 
 		 657 aa  310  4e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2337  polysaccharide deacetylase  45.35 
 
 		 500 aa  224  3e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00797389  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0880  polysaccharide deacetylase  39.74 
 
 		 271 aa  160  6e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1639  polysaccharide deacetylase domain protein  36.52 
 
 		 269 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  38.4 
 
 		 598 aa  70.5  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1454  polysaccharide deacetylase  29.58 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0891104  hitchhiker  0.0000678514 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3874  polysaccharide deacetylase  31.79 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2795  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 600 aa  60.1  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0146758 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  34.65 
 
 		 321 aa  58.9  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0853  polysaccharide deacetylase  32.8 
 
 		 318 aa  59.3  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000296204  normal  0.358313 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0146  polysaccharide deacetylase  27.45 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1536  polysaccharide deacetylase  29.47 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  28.99 
 
 		 233 aa  57  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  27.12 
 
 		 233 aa  56.2  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  28.26 
 
 		 233 aa  54.7  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  27.61 
 
 		 270 aa  54.3  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1686  polysaccharide deacetylase  32.2 
 
 		 255 aa  52.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.0457798 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0232  polysaccharide deacetylase  27.45 
 
 		 265 aa  53.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.621532  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3200  polysaccharide deacetylase  24.66 
 
 		 594 aa  51.2  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000473135  hitchhiker  0.00151321 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3339  polysaccharide deacetylase  27.01 
 
 		 434 aa  51.2  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00946214 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  27.13 
 
 		 319 aa  50.1  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2876  polysaccharide deacetylase  25.93 
 
 		 257 aa  50.1  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2728  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 		 400 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2730  polysaccharide deacetylase  23.33 
 
 		 274 aa  47.8  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0390  polysaccharide deacetylase  23.04 
 
 		 294 aa  47.4  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  28.82 
 
 		 251 aa  47  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  28.36 
 
 		 279 aa  47  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  28.89 
 
 		 255 aa  46.6  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  29.23 
 
 		 322 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  25.15 
 
 		 282 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0175  polysaccharide deacetylase  29.29 
 
 		 378 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.122625  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  27.83 
 
 		 291 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5797  polysaccharide deacetylase  31.06 
 
 		 289 aa  46.6  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  29.01 
 
 		 253 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0924  polysaccharide deacetylase  27.07 
 
 		 173 aa  45.8  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  29.51 
 
 		 752 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2794  polysaccharide deacetylase  23.86 
 
 		 597 aa  44.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0412434 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4026  polysaccharide deacetylase  30.69 
 
 		 219 aa  45.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2823  polysaccharide deacetylase  30.91 
 
 		 400 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.42622  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1907  polysaccharide deacetylase  24.1 
 
 		 282 aa  44.7  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0250  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 398 aa  44.3  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  24.26 
 
 		 271 aa  44.7  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0900  polysaccharide deacetylase  27.34 
 
 		 246 aa  43.9  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.479614 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>