71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1686 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1686  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
255 aa  526  1e-148  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.0457798 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1536  polysaccharide deacetylase  42.4 
 
 
257 aa  178  7e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0390  polysaccharide deacetylase  34.45 
 
 
294 aa  153  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0673  polysaccharide deacetylase  33.89 
 
 
249 aa  148  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.250144  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2876  polysaccharide deacetylase  35.47 
 
 
257 aa  148  9e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4355  polysaccharide deacetylase  35.53 
 
 
251 aa  144  9e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.409612  normal  0.738025 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2795  polysaccharide deacetylase  30.17 
 
 
600 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0146758 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2794  polysaccharide deacetylase  27.07 
 
 
597 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0412434 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0880  polysaccharide deacetylase  27.6 
 
 
271 aa  60.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0615  polysaccharide deacetylase  31.03 
 
 
843 aa  55.8  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00286732 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2378  polysaccharide deacetylase  31.85 
 
 
265 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1454  polysaccharide deacetylase  28.12 
 
 
201 aa  53.9  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0891104  hitchhiker  0.0000678514 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3555  polysaccharide deacetylase  32.2 
 
 
487 aa  52.8  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  28.12 
 
 
322 aa  52.4  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3089  polysaccharide deacetylase  26.55 
 
 
239 aa  52.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3574  polysaccharide deacetylase  30.28 
 
 
267 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.845428  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3917  polysaccharide deacetylase  20.89 
 
 
259 aa  52  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0823  polysaccharide deacetylase family protein  24.46 
 
 
305 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000472378  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  25.99 
 
 
233 aa  50.4  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  25.99 
 
 
233 aa  50.4  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1231  polysaccharide deacetylase  30.84 
 
 
630 aa  50.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.534738  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3076  polysaccharide deacetylase  31.11 
 
 
265 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112381  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1639  polysaccharide deacetylase domain protein  31.3 
 
 
269 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0810  polysaccharide deacetylase family protein  24.46 
 
 
305 aa  49.7  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00210366  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1230  polysaccharide deacetylase  27.69 
 
 
482 aa  48.9  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1579  polysaccharide deacetylase  30.21 
 
 
262 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2337  polysaccharide deacetylase  28.36 
 
 
500 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00797389  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0440  polysaccharide deacetylase  28.68 
 
 
283 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5781  polysaccharide deacetylase  25.15 
 
 
244 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0900  polysaccharide deacetylase  26.83 
 
 
246 aa  46.6  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.479614 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2571  polysaccharide deacetylase  28.04 
 
 
235 aa  46.6  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5079  polysaccharide deacetylase  25.15 
 
 
244 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  27.22 
 
 
282 aa  46.6  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4792  putative polysaccharide deacetylase  28.22 
 
 
269 aa  46.2  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3126  polysaccharide deacetylase  26.21 
 
 
276 aa  46.2  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000165534  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3500  polysaccharide deacetylase family protein  29.38 
 
 
349 aa  45.8  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1476  polysaccharide deacetylase  44 
 
 
353 aa  45.8  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.412903  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4397  polysaccharide deacetylase  26.04 
 
 
244 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  29.57 
 
 
258 aa  45.4  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  24.39 
 
 
257 aa  45.4  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  26.21 
 
 
299 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  25.21 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1341  polysaccharide deacetylase  25 
 
 
379 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000820876  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5368  putative polysaccharide deacetylase  29.51 
 
 
245 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000675459  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0950  polysaccharide deacetylase  30.63 
 
 
331 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.942837  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3879  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 
289 aa  44.3  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5292  putative polysaccharide deacetylase  28.69 
 
 
245 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000730048 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  25.93 
 
 
352 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5436  polysaccharide deacetylase  28.69 
 
 
245 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4896  polysaccharide deacetylase  28.69 
 
 
245 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.434213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5051  polysaccharide deacetylase  28.69 
 
 
245 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5312  polysaccharide deacetylase, putative  28.69 
 
 
254 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  23.02 
 
 
291 aa  43.9  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24870  predicted xylanase/chitin deacetylase  27.4 
 
 
503 aa  43.9  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18670  predicted xylanase/chitin deacetylase  27.16 
 
 
289 aa  43.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  29.69 
 
 
417 aa  43.1  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5636  putative polysaccharide deacetylase  27.87 
 
 
245 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000255185 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1227  polysaccharide deacetylase  29.91 
 
 
657 aa  43.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4881  polysaccharide deacetylase  27.87 
 
 
245 aa  43.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5323  putative polysaccharide deacetylase  27.87 
 
 
245 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1846  polysaccharide deacetylase  34.02 
 
 
311 aa  42.7  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0820159  normal  0.0289941 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0248  polysaccharide deacetylase  32.62 
 
 
352 aa  42.7  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  35.44 
 
 
302 aa  42.7  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  31.3 
 
 
348 aa  42.7  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  23.39 
 
 
261 aa  42.7  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0050  polysaccharide deacetylase  30.58 
 
 
310 aa  42.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  24.79 
 
 
243 aa  42.4  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  24.17 
 
 
321 aa  42.4  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3066  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 
283 aa  42  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00688884  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  25.56 
 
 
244 aa  42  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4235  polysaccharide deacetylase  23.84 
 
 
349 aa  42  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>