23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1846 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1846  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 311 aa  634    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0820159  normal  0.0289941 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0391  polysaccharide deacetylase  31.9 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1565  polysaccharide deacetylase  33.86 
 
 		 322 aa  125  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252193  hitchhiker  0.00761587 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0050  polysaccharide deacetylase  31.56 
 
 		 310 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0078  hypothetical protein  28.11 
 
 		 526 aa  99.8  5e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0137812  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1974  hypothetical protein  27.69 
 
 		 286 aa  95.1  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1969  hypothetical protein  27.69 
 
 		 286 aa  94.7  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0526  polysaccharide deacetylase family protein  26.95 
 
 		 276 aa  85.5  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1653  polysaccharide deacetylase family  27.34 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0322  hypothetical protein  25.85 
 
 		 314 aa  82.8  0.000000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2843  polysaccharide deacetylase  25.19 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0697  polysaccharide deacetylase-related protein  25.3 
 
 		 314 aa  82.4  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.418808  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0687  hypothetical protein  26.14 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0670  hypothetical protein  26.14 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4687  polysaccharide deacetylase  22.46 
 
 		 331 aa  65.9  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0682839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  27.68 
 
 		 372 aa  50.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  23.92 
 
 		 273 aa  45.8  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  26.92 
 
 		 1124 aa  43.5  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1686  polysaccharide deacetylase  34.02 
 
 		 255 aa  43.5  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.0457798 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2331  polysaccharide deacetylase  31.78 
 
 		 293 aa  43.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  31.43 
 
 		 199 aa  43.1  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  26.47 
 
 		 405 aa  42.4  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  24.79 
 
 		 1101 aa  42.4  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>