46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4687 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4687  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 331 aa  693    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0682839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1565  polysaccharide deacetylase  31.06 
 
 		 322 aa  151  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252193  hitchhiker  0.00761587 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0391  polysaccharide deacetylase  30.32 
 
 		 322 aa  142  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0697  polysaccharide deacetylase-related protein  28.32 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.418808  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0078  hypothetical protein  30.07 
 
 		 526 aa  126  5e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0137812  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0050  polysaccharide deacetylase  27.53 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2843  polysaccharide deacetylase  25.29 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0526  polysaccharide deacetylase family protein  23.81 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1969  hypothetical protein  25.29 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1653  polysaccharide deacetylase family  23.41 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0687  hypothetical protein  26.03 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1974  hypothetical protein  25.82 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0322  hypothetical protein  23.67 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0670  hypothetical protein  25.62 
 
 		 286 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1846  polysaccharide deacetylase  21.4 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0820159  normal  0.0289941 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  26.25 
 
 		 275 aa  53.1  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  26.25 
 
 		 275 aa  53.1  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  26.25 
 
 		 275 aa  53.1  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  26.25 
 
 		 275 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  22.46 
 
 		 1124 aa  52.8  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  25.62 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  25.62 
 
 		 275 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  25.62 
 
 		 275 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2167  polysaccharide deacetylase family protein  25.71 
 
 		 258 aa  50.4  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000111858  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  25.62 
 
 		 275 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0405  polysaccharide deacetylase  27.56 
 
 		 234 aa  50.1  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1878  polysaccharide deacetylase family protein  25.71 
 
 		 261 aa  49.7  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117322  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  25 
 
 		 275 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 276 aa  49.7  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  23.6 
 
 		 368 aa  48.9  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1219  polysaccharide deacetylase  21.16 
 
 		 281 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000011337 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0503  polysaccharide deacetylase  31.37 
 
 		 705 aa  46.6  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1903  polysaccharide deacetylase  31.75 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1074  polysaccharide deacetylase  20.94 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000250549 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  18.8 
 
 		 503 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3669  polysaccharide deacetylase  23.53 
 
 		 250 aa  43.9  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  23.33 
 
 		 324 aa  43.9  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3179  polysaccharide deacetylase  23.95 
 
 		 295 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  25.86 
 
 		 256 aa  43.5  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1068  xylanase/chitin deacetylase-like protein  25 
 
 		 244 aa  43.5  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.544039  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  24.55 
 
 		 251 aa  43.1  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  22.31 
 
 		 522 aa  43.1  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  23.17 
 
 		 247 aa  43.1  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1762  polysaccharide deacetylase  26.87 
 
 		 198 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6317  polysaccharide deacetylase  26.87 
 
 		 198 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  22.18 
 
 		 242 aa  42.4  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>