More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1903 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1903  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 245 aa  501  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0405  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 		 234 aa  149  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  41.51 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  38.61 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  40.18 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  39.09 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02423  acetylxylan esterase  30.2 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1775  polysaccharide deacetylase  30.84 
 
 		 192 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  34.58 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4727  polysaccharide deacetylase  40.91 
 
 		 357 aa  69.7  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000111297  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  40.19 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  36.11 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5017  polysaccharide deacetylase family protein  34.91 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1762  polysaccharide deacetylase  29.2 
 
 		 198 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  37.61 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6317  polysaccharide deacetylase  29.2 
 
 		 198 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  38.53 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  38.53 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  38.53 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5060  polysaccharide deacetylase  30.63 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  38.53 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  27.92 
 
 		 317 aa  65.5  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  34.29 
 
 		 542 aa  65.1  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  37.61 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1924  polysaccharide deacetylase, putative  37.38 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.267114  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1683  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  38.18 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.381461  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  33.6 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3369  polysaccharide deacetylase  26.35 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.792887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  33.86 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1959  putative polysaccharide deacetylase  36.45 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.29961  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  23.87 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  37.61 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  37.61 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1696  polysaccharide deacetylase  40 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.847499  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3411  polysaccharide deacetylase  33.96 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  37.61 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2571  polysaccharide deacetylase  40.19 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  31.43 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  36.79 
 
 		 368 aa  62.4  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1697  polysaccharide deacetylase  29.73 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.366713  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  34.86 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  29.73 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1702  polysaccharide deacetylase  37.38 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1658  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  36.45 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1836  polysaccharide deacetylase  37.38 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1880  putative polysaccharide deacetylase  37.38 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.725748 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  25.2 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  30.19 
 
 		 503 aa  60.8  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  31.86 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2699  polysaccharide deacetylase  26.05 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000565788  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0141  polysaccharide deacetylase  28.44 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  32.08 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1840  polysaccharide deacetylase  24.9 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000153578  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  36.11 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0475  polysaccharide deacetylase  32.8 
 
 		 336 aa  59.3  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0117021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  33.57 
 
 		 372 aa  59.3  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0135  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000210343  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  30.48 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1557  acetylxylan esterase  28.35 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.956674  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1497  polysaccharide deacetylase  28.35 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.507826  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3501  putative polysaccharide deacetylase  35.51 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1842  putative polysaccharide deacetylase  35.51 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1541  polysaccharide deacetylase  32.41 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0577624  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  30.19 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  30.84 
 
 		 468 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  38.68 
 
 		 264 aa  57  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2417  polysaccharide deacetylase  32.46 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  27.03 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  23.92 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1258  polysaccharide deacetylase  35.23 
 
 		 699 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0900  polysaccharide deacetylase  32.08 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.479614 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1863  polysaccharide deacetylase family protein  33.63 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00543619  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1582  polysaccharide deacetylase family protein  33.63 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00773707  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  33.33 
 
 		 373 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2145  polysaccharide deacetylase  28.3 
 
 		 201 aa  57  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1446  polysaccharide deacetylase  27.81 
 
 		 280 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.781341  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3669  polysaccharide deacetylase  24.55 
 
 		 250 aa  57  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  29.52 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  34.38 
 
 		 479 aa  56.6  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  32.43 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  28.72 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  36.79 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3360  polysaccharide deacetylase  28.97 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0110446 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  34.29 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3747  polysaccharide deacetylase  23.21 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000014318  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  35.42 
 
 		 479 aa  55.8  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0503  polysaccharide deacetylase  35.23 
 
 		 705 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  32.48 
 
 		 871 aa  55.8  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3350  putative polysaccharide deacetylase  23.65 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  hitchhiker  0.00000000000000655968 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1219  polysaccharide deacetylase  30.48 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000011337 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5592  polysaccharide deacetylase  26.34 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3817  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  28.06 
 
 		 344 aa  55.5  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0327337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  33.63 
 
 		 789 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  33.63 
 
 		 789 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  33.63 
 
 		 789 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  35.24 
 
 		 1115 aa  54.7  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4706  polysaccharide deacetylase  27.91 
 
 		 286 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0236101 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2378  polysaccharide deacetylase  27.18 
 
 		 265 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  0.428473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>