More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1697 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_1697  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
191 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.366713  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5060  polysaccharide deacetylase  86.6 
 
 
194 aa  335  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1762  polysaccharide deacetylase  83.25 
 
 
198 aa  327  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6317  polysaccharide deacetylase  83.25 
 
 
198 aa  327  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1775  polysaccharide deacetylase  83.25 
 
 
192 aa  323  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  31.09 
 
 
301 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  30.89 
 
 
299 aa  85.1  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4996  polysaccharide deacetylase  28.26 
 
 
245 aa  84  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5636  putative polysaccharide deacetylase  27.03 
 
 
245 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000255185 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2948  polysaccharide deacetylase  31.32 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000275955  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2008  polysaccharide deacetylase  31.87 
 
 
275 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000244714  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5312  polysaccharide deacetylase, putative  27.03 
 
 
254 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  40.3 
 
 
242 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2734  polysaccharide deacetylase  31.32 
 
 
275 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000154127  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5368  putative polysaccharide deacetylase  26.49 
 
 
245 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000675459  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2685  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  31.32 
 
 
275 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.97841e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2661  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  31.32 
 
 
275 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000138252  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2944  polysaccharide deacetylase  31.32 
 
 
275 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000517931  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2736  polysaccharide deacetylase  31.32 
 
 
275 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000182255  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2294  polysaccharide deacetylase  31.32 
 
 
260 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000000923024  unclonable  2.97243e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2990  polysaccharide deacetylase  31.32 
 
 
275 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000426534  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2943  polysaccharide deacetylase  31.32 
 
 
275 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.02279e-62 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  34.72 
 
 
320 aa  82  0.000000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5323  putative polysaccharide deacetylase  26.49 
 
 
245 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2979  hypothetical protein  30.77 
 
 
275 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000165918  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5292  putative polysaccharide deacetylase  26.49 
 
 
245 aa  81.3  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000730048 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4896  polysaccharide deacetylase  26.49 
 
 
245 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.434213  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  35.64 
 
 
503 aa  80.1  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5051  polysaccharide deacetylase  26.49 
 
 
245 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5436  polysaccharide deacetylase  26.49 
 
 
245 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  30.9 
 
 
247 aa  80.1  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  30.72 
 
 
292 aa  79  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  30.6 
 
 
279 aa  78.6  0.00000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  33.88 
 
 
364 aa  78.6  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4661  polysaccharide deacetylase  30.22 
 
 
273 aa  79  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.708136  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  33.16 
 
 
251 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  33.09 
 
 
258 aa  78.6  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4881  polysaccharide deacetylase  25.95 
 
 
245 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  36.65 
 
 
259 aa  77.8  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  36.63 
 
 
217 aa  77.8  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1500  polysaccharide deacetylase  30.22 
 
 
273 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000768102  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3501  putative polysaccharide deacetylase  40.38 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2699  polysaccharide deacetylase  26.98 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000565788  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  31.41 
 
 
373 aa  77.4  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3747  polysaccharide deacetylase  25.41 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000014318  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  36.57 
 
 
275 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2061  polysaccharide deacetylase, putative  29.12 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219038  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  33.58 
 
 
417 aa  77  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  30.65 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2833  polysaccharide deacetylase  29.94 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120678  hitchhiker  0.0000000454714 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1834  polysaccharide deacetylase  29.12 
 
 
273 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000185073  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1808  polysaccharide deacetylase  29.12 
 
 
273 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000183162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1791  polysaccharide deacetylase  29.12 
 
 
273 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000907429  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2080  putative polysaccharide deacetylase  29.12 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000146273  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2012  putative polysaccharide deacetylase  29.12 
 
 
273 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.46073e-43 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1977  polysaccharide deacetylase  29.12 
 
 
273 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000478204  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2175  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  36.36 
 
 
221 aa  75.9  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  32.09 
 
 
264 aa  75.9  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  28.95 
 
 
522 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1840  polysaccharide deacetylase  30.22 
 
 
273 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000153578  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1959  putative polysaccharide deacetylase  37.04 
 
 
234 aa  74.7  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.29961  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  42.99 
 
 
275 aa  74.3  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  42.86 
 
 
275 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  35.82 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1979  putative polysaccharide deacetylase  29.12 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00191884  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1306  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  29.95 
 
 
271 aa  74.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  41.82 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  41.82 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  41.82 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  41.82 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3350  putative polysaccharide deacetylase  29.12 
 
 
273 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  hitchhiker  0.00000000000000655968 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1842  putative polysaccharide deacetylase  37.96 
 
 
234 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1488  polysaccharide deacetylase  29.78 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.373553  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3931  polysaccharide deacetylase  29.63 
 
 
224 aa  73.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1924  polysaccharide deacetylase, putative  34.82 
 
 
234 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.267114  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2571  polysaccharide deacetylase  35.19 
 
 
235 aa  73.6  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1683  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  42.17 
 
 
234 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.381461  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1625  polysaccharide deacetylase  24.72 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.679944  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl558  putative chitin deacetylase  33.64 
 
 
247 aa  73.2  0.000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1074  polysaccharide deacetylase  31.85 
 
 
320 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0121745  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  41.82 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2789  xylanase/chitin deacetylase  37.59 
 
 
244 aa  72.4  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
352 aa  72.4  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5592  polysaccharide deacetylase  29.67 
 
 
272 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  37.68 
 
 
212 aa  72  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  30.21 
 
 
244 aa  72  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  26.7 
 
 
300 aa  72  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1658  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  40.96 
 
 
234 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7722  polysaccharide deacetylase  33.71 
 
 
232 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47977  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  36.03 
 
 
276 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3558  xylanase/chitin deacetylase-like protein  33.51 
 
 
321 aa  71.2  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00485145  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1696  polysaccharide deacetylase  36.54 
 
 
234 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.847499  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  33.08 
 
 
372 aa  70.9  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0410  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  30.37 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  39.42 
 
 
468 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  32.64 
 
 
1115 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4026  polysaccharide deacetylase  30.98 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0950  polysaccharide deacetylase  27.46 
 
 
331 aa  70.1  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.942837  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  32.59 
 
 
267 aa  70.1  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>