More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1775 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1775  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 192 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1762  polysaccharide deacetylase  91.67 
 
 		 198 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6317  polysaccharide deacetylase  91.67 
 
 		 198 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1697  polysaccharide deacetylase  83.25 
 
 		 191 aa  323  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.366713  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5060  polysaccharide deacetylase  79.38 
 
 		 194 aa  310  7.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  34.18 
 
 		 258 aa  90.9  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  30.32 
 
 		 251 aa  86.3  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  40.3 
 
 		 242 aa  85.5  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  34.54 
 
 		 503 aa  85.1  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  31.66 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  34.44 
 
 		 373 aa  84  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  30.89 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5368  putative polysaccharide deacetylase  27.57 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000675459  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3879  polysaccharide deacetylase  45.88 
 
 		 289 aa  82  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  30.57 
 
 		 301 aa  81.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5292  putative polysaccharide deacetylase  27.57 
 
 		 245 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000730048 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  31.41 
 
 		 364 aa  81.6  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4896  polysaccharide deacetylase  27.57 
 
 		 245 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.434213  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4996  polysaccharide deacetylase  28.02 
 
 		 245 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  37.17 
 
 		 259 aa  81.3  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3747  polysaccharide deacetylase  27.57 
 
 		 245 aa  80.9  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000014318  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5323  putative polysaccharide deacetylase  27.03 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5312  polysaccharide deacetylase, putative  27.03 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  29.94 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5051  polysaccharide deacetylase  27.57 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4881  polysaccharide deacetylase  27.57 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5436  polysaccharide deacetylase  27.57 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  42.16 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  34.12 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  29.7 
 
 		 1002 aa  80.5  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5636  putative polysaccharide deacetylase  26.49 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000255185 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2175  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  36.94 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  36.05 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  38.41 
 
 		 307 aa  79  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3931  polysaccharide deacetylase  30.05 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  42.86 
 
 		 221 aa  78.2  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3558  xylanase/chitin deacetylase-like protein  36.17 
 
 		 321 aa  78.2  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00485145  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3574  polysaccharide deacetylase  39.42 
 
 		 267 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.845428  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  30.73 
 
 		 244 aa  78.2  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  32.35 
 
 		 267 aa  77.8  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  40.48 
 
 		 258 aa  77.8  0.00000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  28.19 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1306  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  28.34 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  40.18 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  40.18 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  40.18 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  40.18 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  33.59 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 405 aa  76.3  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  36.05 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  39.39 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  40.57 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2699  polysaccharide deacetylase  25.4 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000565788  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1963  polysaccharide deacetylase  30.41 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1579  polysaccharide deacetylase  33.86 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  38.53 
 
 		 287 aa  75.5  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  39.62 
 
 		 275 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4661  polysaccharide deacetylase  28.42 
 
 		 273 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.708136  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07960  polysaccharide deacetylase  33.55 
 
 		 228 aa  74.7  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  30.29 
 
 		 247 aa  74.7  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  39.62 
 
 		 276 aa  74.3  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  27.69 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  38.68 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  39.29 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  39.62 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3076  polysaccharide deacetylase  34.03 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112381  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1074  polysaccharide deacetylase  30.27 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0121745  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  34.07 
 
 		 372 aa  73.6  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1162  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  32.8 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00597989  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  39.53 
 
 		 542 aa  73.6  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  28.8 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2378  polysaccharide deacetylase  34.03 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  31.91 
 
 		 1101 aa  73.6  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  31.51 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1488  polysaccharide deacetylase  28.33 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.373553  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  27.98 
 
 		 927 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  26.6 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.98 
 
 		 1115 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  27.98 
 
 		 1115 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  27.98 
 
 		 1119 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2789  xylanase/chitin deacetylase  34.75 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5592  polysaccharide deacetylase  34.91 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  29.26 
 
 		 387 aa  72.8  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  37.21 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  27.37 
 
 		 522 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2948  polysaccharide deacetylase  28.65 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000275955  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1758  polysaccharide deacetylase family protein  29.44 
 
 		 320 aa  72.4  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00010235  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  28.88 
 
 		 220 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2736  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 275 aa  72  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000182255  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3360  polysaccharide deacetylase  35.68 
 
 		 202 aa  72  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0110446 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  28.34 
 
 		 213 aa  72  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  28.34 
 
 		 213 aa  72  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  33.72 
 
 		 212 aa  72  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  44.44 
 
 		 752 aa  72  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  28.34 
 
 		 213 aa  72  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4026  polysaccharide deacetylase  31.02 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0080  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  30.46 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  28.34 
 
 		 241 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  32.59 
 
 		 259 aa  72  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>