More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5060 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5060  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
194 aa  393  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1697  polysaccharide deacetylase  86.6 
 
 
191 aa  335  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.366713  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6317  polysaccharide deacetylase  82.47 
 
 
198 aa  326  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1762  polysaccharide deacetylase  82.47 
 
 
198 aa  326  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1775  polysaccharide deacetylase  79.38 
 
 
192 aa  310  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  30.89 
 
 
299 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  30.57 
 
 
301 aa  84.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  36.61 
 
 
503 aa  82.4  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  39.85 
 
 
242 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 
292 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  33.15 
 
 
247 aa  80.9  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  32.32 
 
 
204 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  32.79 
 
 
364 aa  78.6  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  30.65 
 
 
251 aa  77  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5312  polysaccharide deacetylase, putative  28.26 
 
 
254 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  29.51 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  32.37 
 
 
258 aa  76.6  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5636  putative polysaccharide deacetylase  27.72 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000255185 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  34.33 
 
 
417 aa  75.5  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4996  polysaccharide deacetylase  28.42 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3879  polysaccharide deacetylase  44.74 
 
 
289 aa  75.5  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  32.24 
 
 
373 aa  75.5  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2948  polysaccharide deacetylase  30.39 
 
 
275 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000275955  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5292  putative polysaccharide deacetylase  27.72 
 
 
245 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000730048 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2008  polysaccharide deacetylase  29.84 
 
 
275 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000244714  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5368  putative polysaccharide deacetylase  27.17 
 
 
245 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000675459  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5323  putative polysaccharide deacetylase  27.17 
 
 
245 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5051  polysaccharide deacetylase  28.26 
 
 
245 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5436  polysaccharide deacetylase  28.26 
 
 
245 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4896  polysaccharide deacetylase  27.72 
 
 
245 aa  74.3  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.434213  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3931  polysaccharide deacetylase  30.1 
 
 
224 aa  74.7  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2990  polysaccharide deacetylase  30.39 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000426534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2734  polysaccharide deacetylase  30.39 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000154127  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2685  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  30.39 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.97841e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3501  putative polysaccharide deacetylase  38.46 
 
 
234 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2661  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  30.39 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000138252  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  32.12 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2944  polysaccharide deacetylase  30.39 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000517931  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2736  polysaccharide deacetylase  30.39 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000182255  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4661  polysaccharide deacetylase  30.21 
 
 
273 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.708136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2943  polysaccharide deacetylase  30.39 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.02279e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4881  polysaccharide deacetylase  27.72 
 
 
245 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2294  polysaccharide deacetylase  30.39 
 
 
260 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000000923024  unclonable  2.97243e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2979  hypothetical protein  29.83 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000165918  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  34.02 
 
 
259 aa  72  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  32.34 
 
 
352 aa  72  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2789  xylanase/chitin deacetylase  37.59 
 
 
244 aa  72  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  36.23 
 
 
307 aa  71.6  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1959  putative polysaccharide deacetylase  38.82 
 
 
234 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.29961  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  40 
 
 
275 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.86 
 
 
1115 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  33.85 
 
 
259 aa  71.2  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.36 
 
 
1115 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2061  polysaccharide deacetylase, putative  28.8 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219038  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  27.36 
 
 
927 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  27.36 
 
 
1115 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  27.36 
 
 
1119 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  26.87 
 
 
872 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  37.72 
 
 
488 aa  70.9  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1842  putative polysaccharide deacetylase  40 
 
 
234 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  29.02 
 
 
302 aa  70.9  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  34.03 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1924  polysaccharide deacetylase, putative  37.65 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.267114  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2571  polysaccharide deacetylase  36.47 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  39.09 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  38.74 
 
 
275 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl558  putative chitin deacetylase  36.61 
 
 
247 aa  70.1  0.00000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  39.09 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  34.33 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  34.88 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  39.09 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2175  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  34.82 
 
 
221 aa  70.5  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  36.79 
 
 
243 aa  70.1  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1488  polysaccharide deacetylase  29.83 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.373553  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  31.63 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1658  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  38.55 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  30.54 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0950  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 
331 aa  69.3  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.942837  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  33.7 
 
 
353 aa  69.7  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2080  putative polysaccharide deacetylase  28.27 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000146273  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  32.81 
 
 
229 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  34.12 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1834  polysaccharide deacetylase  28.27 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000185073  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  40.57 
 
 
522 aa  68.9  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1808  polysaccharide deacetylase  28.27 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000183162  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2012  putative polysaccharide deacetylase  28.27 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.46073e-43 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1791  polysaccharide deacetylase  28.27 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000907429  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  38.46 
 
 
468 aa  68.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1977  polysaccharide deacetylase  28.27 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000478204  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1500  polysaccharide deacetylase  28.8 
 
 
273 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000768102  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  39.05 
 
 
275 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  39.25 
 
 
275 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1625  polysaccharide deacetylase  24.03 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.679944  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2833  polysaccharide deacetylase  29.52 
 
 
273 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120678  hitchhiker  0.0000000454714 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1840  polysaccharide deacetylase  30.21 
 
 
273 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000153578  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  39.53 
 
 
258 aa  68.6  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  39.09 
 
 
275 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07960  polysaccharide deacetylase  33.09 
 
 
228 aa  68.2  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3574  polysaccharide deacetylase  35.92 
 
 
267 aa  68.2  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.845428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>