More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6317 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_6317  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
198 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1762  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
198 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1775  polysaccharide deacetylase  91.67 
 
 
192 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1697  polysaccharide deacetylase  83.25 
 
 
191 aa  327  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.366713  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5060  polysaccharide deacetylase  82.47 
 
 
194 aa  326  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  35.64 
 
 
503 aa  84.7  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  30.37 
 
 
299 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  34.07 
 
 
373 aa  82.4  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  30.05 
 
 
301 aa  82  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  39.71 
 
 
242 aa  81.3  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  31.65 
 
 
258 aa  80.9  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5368  putative polysaccharide deacetylase  26.9 
 
 
245 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000675459  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3879  polysaccharide deacetylase  44.71 
 
 
289 aa  80.1  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4996  polysaccharide deacetylase  26.9 
 
 
245 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5292  putative polysaccharide deacetylase  26.9 
 
 
245 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000730048 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4896  polysaccharide deacetylase  26.9 
 
 
245 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.434213  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5312  polysaccharide deacetylase, putative  26.4 
 
 
254 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5323  putative polysaccharide deacetylase  26.4 
 
 
245 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5051  polysaccharide deacetylase  26.9 
 
 
245 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5436  polysaccharide deacetylase  26.9 
 
 
245 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  42.16 
 
 
352 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5636  putative polysaccharide deacetylase  25.89 
 
 
245 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000255185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  30.54 
 
 
292 aa  77.4  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  35.68 
 
 
259 aa  76.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4881  polysaccharide deacetylase  26.4 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3574  polysaccharide deacetylase  40.38 
 
 
267 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.845428  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  31.43 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  30.65 
 
 
251 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  31.44 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  37.33 
 
 
307 aa  75.1  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3501  putative polysaccharide deacetylase  39.81 
 
 
234 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  31.25 
 
 
364 aa  74.7  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  29.74 
 
 
244 aa  74.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1959  putative polysaccharide deacetylase  38.46 
 
 
234 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.29961  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  35.51 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  35.51 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  35.51 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  35.51 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3931  polysaccharide deacetylase  28.65 
 
 
224 aa  73.2  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  33.81 
 
 
542 aa  72.8  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07960  polysaccharide deacetylase  34.75 
 
 
228 aa  72.4  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  32.94 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3747  polysaccharide deacetylase  25.41 
 
 
245 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000014318  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2699  polysaccharide deacetylase  24.47 
 
 
274 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000565788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1658  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  37.5 
 
 
234 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  38.89 
 
 
275 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  32.35 
 
 
264 aa  72  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1842  putative polysaccharide deacetylase  38.39 
 
 
234 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  39.62 
 
 
275 aa  72  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  26.78 
 
 
279 aa  71.6  0.000000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1924  polysaccharide deacetylase, putative  37.5 
 
 
234 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.267114  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  34.06 
 
 
275 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3076  polysaccharide deacetylase  30.21 
 
 
265 aa  71.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112381  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2571  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 
235 aa  71.6  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4661  polysaccharide deacetylase  27.87 
 
 
273 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.708136  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  30.89 
 
 
229 aa  71.2  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  32.84 
 
 
417 aa  70.5  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  34.06 
 
 
276 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1683  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  37.5 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.381461  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
261 aa  71.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  34.06 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  36.64 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  24.32 
 
 
372 aa  70.1  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  40.48 
 
 
221 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  34.78 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5017  polysaccharide deacetylase family protein  33.33 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1702  polysaccharide deacetylase  36.61 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1880  putative polysaccharide deacetylase  36.61 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.725748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  36.54 
 
 
468 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2789  xylanase/chitin deacetylase  31.96 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  26.42 
 
 
522 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1836  polysaccharide deacetylase  36.61 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  33.72 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.98 
 
 
1115 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  26.94 
 
 
872 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  27.46 
 
 
927 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  27.46 
 
 
1115 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  27.46 
 
 
1119 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1696  polysaccharide deacetylase  37.04 
 
 
234 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.847499  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  30.1 
 
 
353 aa  68.9  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1551  polysaccharide deacetylase  35.14 
 
 
243 aa  68.9  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  33.53 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.46 
 
 
1115 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  30.88 
 
 
267 aa  68.9  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1500  polysaccharide deacetylase  27.47 
 
 
273 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000768102  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  28.8 
 
 
302 aa  68.6  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2378  polysaccharide deacetylase  36.54 
 
 
265 aa  68.2  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1625  polysaccharide deacetylase  26.39 
 
 
212 aa  68.2  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.679944  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  28.65 
 
 
387 aa  67.8  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1579  polysaccharide deacetylase  31.75 
 
 
262 aa  67.8  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  39.29 
 
 
258 aa  68.2  0.00000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5592  polysaccharide deacetylase  33.96 
 
 
272 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3360  polysaccharide deacetylase  34.38 
 
 
202 aa  68.2  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0110446 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4026  polysaccharide deacetylase  30.11 
 
 
219 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  32.84 
 
 
372 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 
1002 aa  67.8  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3196  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase A  28.86 
 
 
280 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.220844  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  26.9 
 
 
1115 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2833  polysaccharide deacetylase  31.34 
 
 
273 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120678  hitchhiker  0.0000000454714 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2736  polysaccharide deacetylase  29.85 
 
 
275 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000182255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>