More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0405 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0405  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 234 aa  485  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1903  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 		 245 aa  149  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  31.73 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  31.55 
 
 		 299 aa  81.6  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  41.75 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  41.18 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  40.2 
 
 		 275 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  40.2 
 
 		 275 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  40.2 
 
 		 275 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  37.25 
 
 		 352 aa  68.6  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  40.2 
 
 		 275 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  39.22 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5060  polysaccharide deacetylase  33.64 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5017  polysaccharide deacetylase family protein  35.92 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  39.22 
 
 		 275 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  39.22 
 
 		 275 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1775  polysaccharide deacetylase  30.1 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  38.24 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  32.33 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  37.25 
 
 		 522 aa  64.3  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  32.35 
 
 		 503 aa  63.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  33.98 
 
 		 542 aa  64.3  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6317  polysaccharide deacetylase  30.1 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1697  polysaccharide deacetylase  32.71 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.366713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1762  polysaccharide deacetylase  30.1 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  39.81 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  34.21 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  30 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 		 321 aa  62.4  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  25.82 
 
 		 273 aa  62  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3341  polysaccharide deacetylase  22.08 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  39.81 
 
 		 465 aa  61.2  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2167  polysaccharide deacetylase family protein  40.82 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000111858  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0810  polysaccharide deacetylase family protein  30.85 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00210366  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1878  polysaccharide deacetylase family protein  39.8 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117322  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4792  putative polysaccharide deacetylase  23.87 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  28.89 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0823  polysaccharide deacetylase family protein  36.84 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000472378  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  31.68 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4727  polysaccharide deacetylase  40.38 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000111297  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3411  polysaccharide deacetylase  37.86 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2699  polysaccharide deacetylase  33.96 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000565788  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3178  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  35.51 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03580  chitin deacetylase, putative  32.08 
 
 		 410 aa  59.3  0.00000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.322784  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  31.37 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10670  predicted xylanase/chitin deacetylase  24.88 
 
 		 440 aa  58.9  0.00000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0475  polysaccharide deacetylase  36.27 
 
 		 336 aa  58.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0117021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  27.97 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01375  polysaccharide deacetylase  35.9 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  34.29 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0503  polysaccharide deacetylase  34.31 
 
 		 705 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1863  polysaccharide deacetylase family protein  31.41 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00543619  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1582  polysaccharide deacetylase family protein  31.41 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00773707  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  36.27 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3196  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase A  26.34 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.220844  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2908  polysaccharide deacetylase  34.58 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.850515  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  32.08 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  34.26 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1576  polysaccharide deacetylase  32.52 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0080  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  34.58 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  35 
 
 		 277 aa  57  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  39.22 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1924  polysaccharide deacetylase, putative  34.55 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.267114  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  33.86 
 
 		 372 aa  56.2  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 871 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1658  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  33.98 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01800  chitin deacetylase, putative  28.07 
 
 		 470 aa  55.8  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.61842  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  36.54 
 
 		 300 aa  55.5  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  24.72 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1880  putative polysaccharide deacetylase  33.96 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.725748 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1702  polysaccharide deacetylase  33.96 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1836  polysaccharide deacetylase  33.96 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1557  acetylxylan esterase  25.17 
 
 		 275 aa  55.5  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.956674  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02423  acetylxylan esterase  26.04 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1497  polysaccharide deacetylase  25.17 
 
 		 275 aa  55.5  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.507826  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4083  polysaccharide deacetylase  26.09 
 
 		 270 aa  55.1  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.32938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2070  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  34.58 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  30.39 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  29.41 
 
 		 468 aa  55.1  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2055  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  34.44 
 
 		 327 aa  55.1  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1959  putative polysaccharide deacetylase  35.37 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.29961  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5636  putative polysaccharide deacetylase  25.11 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000255185 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  33.33 
 
 		 927 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1683  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  33.98 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.381461  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  34.95 
 
 		 1115 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1696  polysaccharide deacetylase  33.98 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.847499  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  31.76 
 
 		 353 aa  54.3  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  29.7 
 
 		 1124 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2833  polysaccharide deacetylase  27.7 
 
 		 273 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120678  hitchhiker  0.0000000454714 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1579  polysaccharide deacetylase  24.55 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  30.58 
 
 		 1101 aa  53.9  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  34.95 
 
 		 1115 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2434  polysaccharide deacetylase  23.18 
 
 		 293 aa  53.9  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.591575  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3747  polysaccharide deacetylase  24.14 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000014318  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0540  polysaccharide deacetylase, putative  33.61 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  32.5 
 
 		 872 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5312  polysaccharide deacetylase, putative  24.66 
 
 		 254 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0402  polysaccharide deacetylase  33.61 
 
 		 260 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0424  polysaccharide deacetylase  33.61 
 
 		 260 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>