More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0503 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0503  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
705 aa  1390    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1258  polysaccharide deacetylase  72.95 
 
 
699 aa  918    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252566  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4011  polysaccharide deacetylase  40.73 
 
 
360 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243359  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0065  polysaccharide deacetylase  39.21 
 
 
365 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00184975  hitchhiker  0.0058603 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2099  polysaccharide deacetylase  38.85 
 
 
429 aa  159  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3179  polysaccharide deacetylase  32.66 
 
 
295 aa  115  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2167  polysaccharide deacetylase family protein  34.16 
 
 
258 aa  114  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000111858  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1878  polysaccharide deacetylase family protein  33.33 
 
 
261 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117322  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0341  polysaccharide deacetylase  39.8 
 
 
335 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  35.18 
 
 
258 aa  110  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  28.68 
 
 
368 aa  109  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  34.15 
 
 
251 aa  107  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  29.21 
 
 
238 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0908  xylanase/chitin deacetylase  27.55 
 
 
235 aa  104  7e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3669  polysaccharide deacetylase  30.2 
 
 
250 aa  103  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07960  polysaccharide deacetylase  32.47 
 
 
228 aa  103  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1162  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  33.33 
 
 
321 aa  103  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00597989  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2866  polysaccharide deacetylase  34.72 
 
 
382 aa  103  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2055  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  30.53 
 
 
327 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  31.91 
 
 
259 aa  102  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1655  polysaccharide deacetylase  35.57 
 
 
244 aa  102  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  31.38 
 
 
258 aa  101  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  34.01 
 
 
372 aa  100  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  28.87 
 
 
263 aa  98.6  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1057  polysaccharide deacetylase  32.65 
 
 
241 aa  96.7  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00359721  hitchhiker  0.000209945 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  31.35 
 
 
256 aa  96.7  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2458  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  28.94 
 
 
299 aa  96.7  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0476664  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  33.87 
 
 
199 aa  96.3  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3904  putative polysaccharide deacetylase  29.74 
 
 
299 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  30.26 
 
 
267 aa  95.5  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  42.5 
 
 
542 aa  95.5  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3565  polysaccharide deacetylase  29.74 
 
 
299 aa  95.5  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  32.8 
 
 
215 aa  95.1  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1340  putative polysaccharide deacetylase  29.74 
 
 
299 aa  95.1  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.236296 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3853  putative polysaccharide deacetylase  28.88 
 
 
299 aa  94.7  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114111  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3628  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  30 
 
 
299 aa  94.4  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3657  polysaccharide deacetylase  30 
 
 
299 aa  94  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3817  putative polysaccharide deacetylase  30 
 
 
299 aa  94  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.2968800000000001e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3943  polysaccharide deacetylase  30 
 
 
299 aa  94  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1948  polysaccharide deacetylase  27.69 
 
 
249 aa  94  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000715916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3547  polysaccharide deacetylase  30 
 
 
299 aa  94  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3844  polysaccharide deacetylase, putative  30 
 
 
299 aa  93.6  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  32.32 
 
 
250 aa  93.2  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0144  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  31.82 
 
 
258 aa  93.2  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00172673  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  34.33 
 
 
1120 aa  91.7  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  28.79 
 
 
255 aa  92  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  29.63 
 
 
275 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0411  polysaccharide deacetylase  30.5 
 
 
260 aa  91.3  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0402  polysaccharide deacetylase  30.5 
 
 
260 aa  91.3  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0424  polysaccharide deacetylase  30.5 
 
 
260 aa  91.3  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0398  polysaccharide deacetylase  30.5 
 
 
260 aa  90.9  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1847  polysaccharide deacetylase  30.9 
 
 
286 aa  90.9  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0540  polysaccharide deacetylase, putative  30.5 
 
 
260 aa  90.9  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  33.51 
 
 
373 aa  90.9  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0470  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  30.5 
 
 
260 aa  90.5  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  32.46 
 
 
251 aa  90.1  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4834  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  30.5 
 
 
260 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0540  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  30.5 
 
 
260 aa  90.5  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0217877  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0489  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  30.5 
 
 
260 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0410  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  30 
 
 
260 aa  90.1  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1443  polysaccharide deacetylase  31.63 
 
 
320 aa  90.1  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  30.58 
 
 
1115 aa  89.7  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  34.71 
 
 
217 aa  89.7  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  32.39 
 
 
292 aa  89.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1068  xylanase/chitin deacetylase-like protein  27.18 
 
 
244 aa  89.7  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.544039  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1306  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  30.96 
 
 
271 aa  89  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0152  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  28.5 
 
 
253 aa  89  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000120528  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  29.75 
 
 
1119 aa  88.6  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 
264 aa  88.6  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  29.75 
 
 
1115 aa  88.6  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0145  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  30.3 
 
 
254 aa  88.6  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.268152  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  30.09 
 
 
275 aa  88.2  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  31.05 
 
 
294 aa  88.2  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  29.75 
 
 
1115 aa  88.2  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  32.31 
 
 
404 aa  88.2  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  29.63 
 
 
275 aa  88.2  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0935  polysaccharide deacetylase  30.5 
 
 
281 aa  87.8  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0476216  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  29.05 
 
 
321 aa  87.8  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  29.75 
 
 
927 aa  87.8  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0404  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  30 
 
 
260 aa  87.8  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0150  polysaccharide deacetylase, putative  30.3 
 
 
254 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.647216  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0182  putative polysaccharide deacetylase  29.5 
 
 
254 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  29.63 
 
 
275 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  29.63 
 
 
275 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  34.03 
 
 
305 aa  87  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  29.63 
 
 
275 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  34.47 
 
 
1124 aa  87  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3012  polysaccharide deacetylase  27.96 
 
 
263 aa  87  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000529365  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 
302 aa  86.7  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0150  polysaccharide deacetylase  27.18 
 
 
254 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00655873  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 
275 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0143  xylanase/chitin deacetylase  26.4 
 
 
254 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  29.63 
 
 
275 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0150  polysaccharide deacetylase  27.18 
 
 
254 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  35.68 
 
 
244 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2122  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  28.06 
 
 
265 aa  86.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1836  polysaccharide deacetylase (nodulation protein NodB)  27.55 
 
 
265 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0269701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0163  putative polysaccharide deacetylase  26.4 
 
 
254 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000107726 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0145  xylanase/chitin deacetylase  26.4 
 
 
254 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  26.88 
 
 
405 aa  85.5  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>