180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0135 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0135  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
250 aa  516  1.0000000000000001e-145  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000210343  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  25.79 
 
 
199 aa  67  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0141  polysaccharide deacetylase  24.64 
 
 
216 aa  64.7  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1974  hypothetical protein  27.73 
 
 
286 aa  62  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1969  hypothetical protein  27.73 
 
 
286 aa  61.6  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07960  polysaccharide deacetylase  26.54 
 
 
228 aa  60.8  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  27.75 
 
 
368 aa  59.7  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1903  polysaccharide deacetylase  28.15 
 
 
245 aa  59.3  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  27.34 
 
 
522 aa  58.9  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  31.21 
 
 
261 aa  57.4  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  24.29 
 
 
215 aa  56.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  29.2 
 
 
255 aa  56.2  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  25 
 
 
404 aa  55.5  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1959  putative polysaccharide deacetylase  25.12 
 
 
234 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.29961  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  26.21 
 
 
285 aa  55.5  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1658  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  25.12 
 
 
234 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1880  putative polysaccharide deacetylase  24.65 
 
 
234 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.725748 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1702  polysaccharide deacetylase  24.65 
 
 
234 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1683  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  25.12 
 
 
234 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.381461  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  26.62 
 
 
488 aa  54.3  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1836  polysaccharide deacetylase  24.65 
 
 
234 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  28.26 
 
 
258 aa  53.9  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  24.81 
 
 
1002 aa  53.9  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1728  polysaccharide deacetylase family protein  30.63 
 
 
238 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000179283  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3179  polysaccharide deacetylase  25 
 
 
295 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1696  polysaccharide deacetylase  25.35 
 
 
234 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.847499  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  24 
 
 
1099 aa  53.9  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  26.57 
 
 
221 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  28.67 
 
 
291 aa  53.5  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3501  putative polysaccharide deacetylase  27.31 
 
 
234 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1924  polysaccharide deacetylase, putative  24.65 
 
 
234 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.267114  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  22.22 
 
 
273 aa  52.8  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  25.35 
 
 
324 aa  52.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1842  putative polysaccharide deacetylase  26.03 
 
 
234 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  25.12 
 
 
465 aa  52.4  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1456  polysaccharide deacetylase family protein  30 
 
 
238 aa  52.4  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0998463  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  30.22 
 
 
213 aa  52  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  28.47 
 
 
251 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  24.53 
 
 
352 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  25.62 
 
 
752 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  26.09 
 
 
317 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  24.3 
 
 
294 aa  51.6  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  30.22 
 
 
213 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  30.22 
 
 
213 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4026  polysaccharide deacetylase  26.02 
 
 
219 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  30.22 
 
 
213 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  23.49 
 
 
240 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  30.22 
 
 
241 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43807  Chitin deacetylase 2 precursor  24.81 
 
 
269 aa  50.4  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0156185  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3747  polysaccharide deacetylase  26.22 
 
 
245 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000014318  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  29.5 
 
 
241 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7722  polysaccharide deacetylase  28.28 
 
 
232 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47977  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  25.86 
 
 
364 aa  50.4  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  23.78 
 
 
542 aa  50.4  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5323  putative polysaccharide deacetylase  25.79 
 
 
245 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  29.5 
 
 
220 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  29.5 
 
 
241 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  27.62 
 
 
217 aa  50.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1847  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 
286 aa  50.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  21.85 
 
 
258 aa  49.7  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0503  polysaccharide deacetylase  25 
 
 
705 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  35.38 
 
 
247 aa  49.3  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01375  polysaccharide deacetylase  31.85 
 
 
218 aa  49.3  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2571  polysaccharide deacetylase  29.79 
 
 
235 aa  48.9  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  33.65 
 
 
279 aa  48.5  0.00009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2151  polysaccharide deacetylase  26.63 
 
 
294 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342073  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2765  polysaccharide deacetylase  26.63 
 
 
294 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.468013  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1978  polysaccharide deacetylase  27.18 
 
 
229 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  27.34 
 
 
241 aa  48.5  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5368  putative polysaccharide deacetylase  25.79 
 
 
245 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000675459  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  27.48 
 
 
405 aa  48.9  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1515  polysaccharide deacetylase  24.22 
 
 
222 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.416831  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6095  polysaccharide deacetylase  26.04 
 
 
297 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233371  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1068  xylanase/chitin deacetylase-like protein  28.79 
 
 
244 aa  48.5  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.544039  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6465  polysaccharide deacetylase  24.63 
 
 
219 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0526  polysaccharide deacetylase family protein  26.38 
 
 
276 aa  48.5  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  23.08 
 
 
320 aa  48.5  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4881  polysaccharide deacetylase  24.9 
 
 
245 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0050  polysaccharide deacetylase  25.66 
 
 
310 aa  47.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  30.56 
 
 
256 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1653  polysaccharide deacetylase family  25.96 
 
 
276 aa  47.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  27.62 
 
 
1124 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10670  predicted xylanase/chitin deacetylase  29.57 
 
 
440 aa  47.8  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2684  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 
294 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.569149 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  28.06 
 
 
217 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  28.06 
 
 
244 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3218  polysaccharide deacetylase  23.66 
 
 
465 aa  47  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.578565  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  22.6 
 
 
238 aa  47  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1228  polysaccharide deacetylase  25.79 
 
 
327 aa  46.6  0.0004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1834  polysaccharide deacetylase  24.89 
 
 
397 aa  46.6  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.309085  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  23.66 
 
 
299 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3077  polysaccharide deacetylase  24.09 
 
 
440 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00148769  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  26.85 
 
 
307 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5312  polysaccharide deacetylase, putative  25 
 
 
254 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5636  putative polysaccharide deacetylase  25.4 
 
 
245 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000255185 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1081  polysaccharide deacetylase  39.34 
 
 
242 aa  46.2  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  26.62 
 
 
321 aa  46.2  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2908  polysaccharide deacetylase  26.44 
 
 
280 aa  46.2  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.850515  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5051  polysaccharide deacetylase  24.5 
 
 
245 aa  45.8  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5436  polysaccharide deacetylase  24.5 
 
 
245 aa  45.8  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>