23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0391 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0391  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 322 aa  659    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1565  polysaccharide deacetylase  39.66 
 
 		 322 aa  215  8e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252193  hitchhiker  0.00761587 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0697  polysaccharide deacetylase-related protein  30.55 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.418808  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0078  hypothetical protein  33.99 
 
 		 526 aa  172  5e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0137812  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4687  polysaccharide deacetylase  30.32 
 
 		 331 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0682839  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1969  hypothetical protein  30.22 
 
 		 286 aa  132  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1846  polysaccharide deacetylase  32.81 
 
 		 311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0820159  normal  0.0289941 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1974  hypothetical protein  29.85 
 
 		 286 aa  129  8.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1653  polysaccharide deacetylase family  29.34 
 
 		 276 aa  120  3.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0526  polysaccharide deacetylase family protein  28.96 
 
 		 276 aa  119  4.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0670  hypothetical protein  29.1 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0687  hypothetical protein  28.73 
 
 		 286 aa  112  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0050  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 		 310 aa  106  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2843  polysaccharide deacetylase  26.44 
 
 		 307 aa  103  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0322  hypothetical protein  25.47 
 
 		 314 aa  89.4  8e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  24.59 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09380  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AQQ0]  27.84 
 
 		 237 aa  47  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.124183 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  23.92 
 
 		 479 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1402  polysaccharide deacetylase  30.19 
 
 		 375 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1411  polysaccharide deacetylase  30.19 
 
 		 375 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1438  polysaccharide deacetylase  30.19 
 
 		 375 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2943  polysaccharide deacetylase  30.19 
 
 		 375 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.567771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 890 aa  42.4  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>