59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1565 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1565  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 322 aa  670    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252193  hitchhiker  0.00761587 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0391  polysaccharide deacetylase  39.37 
 
 		 322 aa  221  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0078  hypothetical protein  37.54 
 
 		 526 aa  193  3e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0137812  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0697  polysaccharide deacetylase-related protein  32.47 
 
 		 314 aa  181  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.418808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4687  polysaccharide deacetylase  31.03 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0682839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1846  polysaccharide deacetylase  33.86 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0820159  normal  0.0289941 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1974  hypothetical protein  31.44 
 
 		 286 aa  117  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1969  hypothetical protein  31.44 
 
 		 286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0670  hypothetical protein  28.84 
 
 		 286 aa  114  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0687  hypothetical protein  28.46 
 
 		 286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0050  polysaccharide deacetylase  27.82 
 
 		 310 aa  99.8  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2843  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 307 aa  98.2  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0322  hypothetical protein  27.76 
 
 		 314 aa  93.6  4e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1653  polysaccharide deacetylase family  30.8 
 
 		 276 aa  91.7  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0526  polysaccharide deacetylase family protein  30.4 
 
 		 276 aa  91.7  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  24.69 
 
 		 1101 aa  55.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  24.8 
 
 		 221 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  24.4 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  22.22 
 
 		 264 aa  50.8  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  29.56 
 
 		 242 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1306  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  26.48 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0410  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  27.31 
 
 		 260 aa  48.9  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24520  predicted xylanase/chitin deacetylase  31.82 
 
 		 292 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.417407 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  26.75 
 
 		 215 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  27.56 
 
 		 199 aa  48.1  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  22.82 
 
 		 1124 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  24.38 
 
 		 251 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  22.75 
 
 		 368 aa  47.8  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1728  polysaccharide deacetylase family protein  22.53 
 
 		 238 aa  47  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000179283  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  21.69 
 
 		 275 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  22.49 
 
 		 275 aa  46.6  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  22.49 
 
 		 275 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  21.95 
 
 		 275 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  22.49 
 
 		 275 aa  46.2  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  22.49 
 
 		 275 aa  46.2  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  22.09 
 
 		 275 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1324  polysaccharide deacetylase  24.65 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.116073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  24.52 
 
 		 258 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0286  polysaccharide deacetylase  21.58 
 
 		 308 aa  45.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.350747  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  21.54 
 
 		 275 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  21.83 
 
 		 247 aa  44.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0811  polysaccharide deacetylase  24.81 
 
 		 239 aa  45.1  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.636434  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  33.33 
 
 		 373 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1219  polysaccharide deacetylase  24.61 
 
 		 281 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000011337 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3669  polysaccharide deacetylase  21.3 
 
 		 250 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0834  polysaccharide deacetylase  24.81 
 
 		 239 aa  45.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  23.36 
 
 		 503 aa  44.3  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  24.17 
 
 		 1120 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1456  polysaccharide deacetylase family protein  22.13 
 
 		 238 aa  44.3  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0998463  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  25.62 
 
 		 204 aa  43.5  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2434  polysaccharide deacetylase  28.46 
 
 		 293 aa  43.5  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.591575  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  22.83 
 
 		 251 aa  43.5  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  22.55 
 
 		 267 aa  43.5  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  33.73 
 
 		 1002 aa  43.1  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  22.49 
 
 		 275 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1402  polysaccharide deacetylase  30.91 
 
 		 375 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1579  polysaccharide deacetylase  25.85 
 
 		 262 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  26.79 
 
 		 752 aa  42.4  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>