86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_24520 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_24520  predicted xylanase/chitin deacetylase  100 
 
 		 292 aa  578  1e-164  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.417407 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2055  polysaccharide deacetylase  59.66 
 
 		 341 aa  326  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0154503  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0063  hypothetical protein  50.72 
 
 		 363 aa  262  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3510  polysaccharide deacetylase  47.93 
 
 		 348 aa  259  3e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1476  polysaccharide deacetylase  46.15 
 
 		 353 aa  256  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.412903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2851  polysaccharide deacetylase  50.54 
 
 		 371 aa  255  7e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000258612  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2967  hypothetical protein  44.96 
 
 		 363 aa  236  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0434  polysaccharide deacetylase  38.59 
 
 		 382 aa  178  9e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1341  polysaccharide deacetylase  34.74 
 
 		 379 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000820876  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0175  polysaccharide deacetylase  31.29 
 
 		 378 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.122625  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0080  polysaccharide deacetylase  33.69 
 
 		 379 aa  132  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0248  polysaccharide deacetylase  27.18 
 
 		 352 aa  58.9  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 		 598 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  36.71 
 
 		 645 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  29.95 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0181  polysaccharide deacetylase  31.72 
 
 		 353 aa  55.8  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  30.2 
 
 		 1001 aa  55.8  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  26.77 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  28.44 
 
 		 289 aa  55.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  32.63 
 
 		 321 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  24.12 
 
 		 282 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  26.26 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0883  polysaccharide deacetylase  25.77 
 
 		 298 aa  52.8  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000351632  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1639  polysaccharide deacetylase domain protein  36.69 
 
 		 269 aa  52.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0273  polysaccharide deacetylase  34.52 
 
 		 627 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  28.67 
 
 		 348 aa  52  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  28.33 
 
 		 319 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0161  polysaccharide deacetylase  28.97 
 
 		 342 aa  51.2  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0171  polysaccharide deacetylase  23.4 
 
 		 259 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0521886  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  25.52 
 
 		 279 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4617  polysaccharide deacetylase  31.61 
 
 		 266 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0110578 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  28.24 
 
 		 276 aa  49.3  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  32.28 
 
 		 299 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  30.41 
 
 		 348 aa  49.3  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  30.41 
 
 		 348 aa  49.3  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  29.9 
 
 		 348 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  31.33 
 
 		 348 aa  48.5  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  42.03 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  32.67 
 
 		 348 aa  48.1  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  29.9 
 
 		 348 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  31.97 
 
 		 348 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0363  polysaccharide deacetylase  26.46 
 
 		 367 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0331  polysaccharide deacetylase-like protein  26.46 
 
 		 367 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0316  polysaccharide deacetylase-like protein  26.46 
 
 		 367 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1565  polysaccharide deacetylase  32.04 
 
 		 322 aa  47  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252193  hitchhiker  0.00761587 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  32 
 
 		 348 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  32 
 
 		 348 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0303  polysaccharide deacetylase-like protein  25.93 
 
 		 367 aa  47  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  27.04 
 
 		 253 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  30.87 
 
 		 417 aa  46.6  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0476  NhaD  35.29 
 
 		 256 aa  46.2  0.0007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.336062  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  28.04 
 
 		 264 aa  45.8  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  27.06 
 
 		 322 aa  45.8  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  27.12 
 
 		 275 aa  45.8  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  27.12 
 
 		 275 aa  45.8  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  26.34 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3500  polysaccharide deacetylase family protein  29.86 
 
 		 349 aa  45.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  27.11 
 
 		 275 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  27.6 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  29.23 
 
 		 1119 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  30 
 
 		 1115 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  24.74 
 
 		 291 aa  44.3  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  29.23 
 
 		 1115 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0895  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 615 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0313662  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  29.23 
 
 		 927 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6317  polysaccharide deacetylase  31.33 
 
 		 198 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0869  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 615 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1762  polysaccharide deacetylase  31.33 
 
 		 198 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  29.23 
 
 		 1115 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  28.46 
 
 		 872 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  26.51 
 
 		 275 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2571  polysaccharide deacetylase  29.81 
 
 		 235 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  23.78 
 
 		 275 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  23.78 
 
 		 275 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  26.55 
 
 		 275 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  26.55 
 
 		 275 aa  43.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0298  polysaccharide deacetylase  25.81 
 
 		 360 aa  43.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5060  polysaccharide deacetylase  31.55 
 
 		 194 aa  43.1  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1457  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  29.74 
 
 		 237 aa  42.7  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.46 
 
 		 1115 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0722  polysaccharide deacetylase  33.85 
 
 		 284 aa  42.7  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0811  Shf protein  33.85 
 
 		 284 aa  42.7  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0360  polysaccharide deacetylase-like protein  25.27 
 
 		 360 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  26.18 
 
 		 233 aa  42.4  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 242 aa  42.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1775  polysaccharide deacetylase  30.36 
 
 		 192 aa  42.4  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>