122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene plpp0078 on replicon NC_006365
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006365  plpp0078  hypothetical protein  100 
 
 
526 aa  1084    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0137812  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1565  polysaccharide deacetylase  38.58 
 
 
322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252193  hitchhiker  0.00761587 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4040  hypothetical protein  45.74 
 
 
277 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253336  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0697  polysaccharide deacetylase-related protein  38.62 
 
 
314 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.418808  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1669  hypothetical protein  43.5 
 
 
281 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1229  hypothetical protein  47.09 
 
 
275 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116233 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3795  hypothetical protein  43.95 
 
 
277 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.394583 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4780  hypothetical protein  41.96 
 
 
295 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3331  hypothetical protein  43.75 
 
 
282 aa  183  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.400491  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2390  hypothetical protein  41.7 
 
 
277 aa  183  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.325647  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0391  polysaccharide deacetylase  33.99 
 
 
322 aa  182  9.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3061  hypothetical protein  40.81 
 
 
275 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3562  hypothetical protein  38.57 
 
 
275 aa  177  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.252373  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2916  putative hydrolase  42.6 
 
 
277 aa  173  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1120  hypothetical protein  36.04 
 
 
281 aa  155  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.381858  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1974  hypothetical protein  35.11 
 
 
286 aa  136  8e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1969  hypothetical protein  34.73 
 
 
286 aa  134  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4687  polysaccharide deacetylase  30.07 
 
 
331 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0682839  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1653  polysaccharide deacetylase family  31.37 
 
 
276 aa  110  8.000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0526  polysaccharide deacetylase family protein  30.98 
 
 
276 aa  109  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1846  polysaccharide deacetylase  28.11 
 
 
311 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0820159  normal  0.0289941 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0670  hypothetical protein  29.18 
 
 
286 aa  98.6  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0687  hypothetical protein  28.79 
 
 
286 aa  97.1  7e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0050  polysaccharide deacetylase  26.53 
 
 
310 aa  93.6  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2843  polysaccharide deacetylase  26.04 
 
 
307 aa  88.6  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0322  hypothetical protein  25.62 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  29.34 
 
 
600 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  29.34 
 
 
600 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  28.16 
 
 
373 aa  58.9  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  24.57 
 
 
273 aa  57.8  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  28.76 
 
 
275 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  28.1 
 
 
276 aa  57  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  27.54 
 
 
405 aa  57  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  28.76 
 
 
275 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  28.76 
 
 
275 aa  55.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  28.76 
 
 
275 aa  55.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  28.76 
 
 
275 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  28.76 
 
 
275 aa  55.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  25.64 
 
 
752 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  25.95 
 
 
569 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  28.76 
 
 
275 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  29.11 
 
 
605 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  33.8 
 
 
551 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  28.1 
 
 
275 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  25.84 
 
 
546 aa  53.5  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  30.88 
 
 
568 aa  53.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  30.4 
 
 
215 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0141  polysaccharide deacetylase  24.46 
 
 
216 aa  52.4  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  26.28 
 
 
1101 aa  52  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  26.98 
 
 
683 aa  52  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  28.1 
 
 
275 aa  52  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  27.74 
 
 
417 aa  51.2  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  25.97 
 
 
299 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  25.88 
 
 
601 aa  50.4  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  27.67 
 
 
1154 aa  50.1  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  27.56 
 
 
317 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  20.85 
 
 
267 aa  50.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  24.31 
 
 
1124 aa  49.7  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  34.72 
 
 
289 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0286  polysaccharide deacetylase  26.02 
 
 
308 aa  50.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.350747  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09380  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AQQ0]  25 
 
 
237 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.124183 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  36.67 
 
 
256 aa  49.3  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  27.34 
 
 
258 aa  48.9  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3135  hypothetical protein  26.45 
 
 
339 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222063  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2757  hypothetical protein  29.06 
 
 
348 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2934  hypothetical protein  29.06 
 
 
348 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3002  hypothetical protein  26.32 
 
 
346 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  27.59 
 
 
292 aa  47.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2434  polysaccharide deacetylase  25.91 
 
 
293 aa  47.8  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.591575  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  27.43 
 
 
465 aa  47.4  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 
284 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3218  polysaccharide deacetylase  24 
 
 
465 aa  47.4  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.578565  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  26.45 
 
 
199 aa  47.4  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  21.59 
 
 
287 aa  47.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  31.67 
 
 
279 aa  46.6  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1209  esterase/lipase  30.77 
 
 
311 aa  46.2  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  26.75 
 
 
1099 aa  46.2  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  25.62 
 
 
242 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4804  alpha/beta hydrolase fold  21.29 
 
 
325 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  25.99 
 
 
294 aa  46.2  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  25.66 
 
 
204 aa  46.6  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  34.55 
 
 
289 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  24.69 
 
 
545 aa  46.2  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2699  alpha/beta hydrolase  25.83 
 
 
299 aa  45.8  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002434  deacetylase DA1  25 
 
 
427 aa  45.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3558  xylanase/chitin deacetylase-like protein  22.88 
 
 
321 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00485145  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0405  polysaccharide deacetylase  31.11 
 
 
234 aa  45.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  56.76 
 
 
571 aa  45.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  22.75 
 
 
251 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  22.76 
 
 
1002 aa  45.1  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3251  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 
292 aa  45.1  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0874027  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  51.52 
 
 
341 aa  45.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2838  hypothetical protein  28.21 
 
 
348 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540199  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2329  hydrolase, alpha/beta fold family  45.45 
 
 
291 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000968473  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2607  hypothetical protein  24.31 
 
 
345 aa  44.7  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.313351 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  25.64 
 
 
301 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1476  polysaccharide deacetylase  28.18 
 
 
353 aa  45.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.412903  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 
309 aa  44.7  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2011  alpha/beta hydrolase fold  25.14 
 
 
296 aa  44.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000219515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  32.76 
 
 
572 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>