30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1229 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1229  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116233 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4040  hypothetical protein  73.45 
 
 		 277 aa  411  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1669  hypothetical protein  72.24 
 
 		 281 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3795  hypothetical protein  71.64 
 
 		 277 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.394583 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4780  hypothetical protein  63.54 
 
 		 295 aa  350  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2390  hypothetical protein  61.3 
 
 		 277 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.325647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3331  hypothetical protein  63.95 
 
 		 282 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.400491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3562  hypothetical protein  60.55 
 
 		 275 aa  335  5e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.252373  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2916  putative hydrolase  60.22 
 
 		 277 aa  335  5.999999999999999e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3061  hypothetical protein  60.38 
 
 		 275 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0078  hypothetical protein  47.09 
 
 		 526 aa  198  7.999999999999999e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0137812  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1120  hypothetical protein  39.13 
 
 		 281 aa  152  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.381858  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 		 305 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.444129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0978  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 305 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_93787  predicted protein  30.3 
 
 		 346 aa  47.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0770884  normal  0.222874 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3557  putative acyltransferase  29.59 
 
 		 326 aa  45.8  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.554768  normal  0.229359 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  33.33 
 
 		 380 aa  45.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0076  hypothetical protein  22.71 
 
 		 341 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15541  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  26.43 
 
 		 547 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0231  esterase/lipase/thioesterase  24.46 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.272912  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  44 
 
 		 289 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0091  hypothetical protein  23.56 
 
 		 303 aa  43.9  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000240765  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  31 
 
 		 382 aa  43.5  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  32.88 
 
 		 601 aa  43.1  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1095  hypothetical protein  25.93 
 
 		 253 aa  43.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.103267 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2699  alpha/beta hydrolase  24.81 
 
 		 299 aa  42.4  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1148  phospholipase/Carboxylesterase  26.15 
 
 		 239 aa  42.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  27.27 
 
 		 546 aa  42.4  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3339  hypothetical protein  28.69 
 
 		 289 aa  42.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1830  alpha/beta hydrolase  26.96 
 
 		 270 aa  42.4  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>