18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3061 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3061  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2390  hypothetical protein  84.84 
 
 		 277 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.325647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3562  hypothetical protein  75.19 
 
 		 275 aa  427  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.252373  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3331  hypothetical protein  72.93 
 
 		 282 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.400491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4780  hypothetical protein  72.33 
 
 		 295 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3795  hypothetical protein  64.5 
 
 		 277 aa  357  8e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.394583 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4040  hypothetical protein  63.74 
 
 		 277 aa  348  5e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1669  hypothetical protein  61.45 
 
 		 281 aa  348  6e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1229  hypothetical protein  60.38 
 
 		 275 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116233 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2916  putative hydrolase  54.96 
 
 		 277 aa  313  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0078  hypothetical protein  40.81 
 
 		 526 aa  179  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0137812  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1120  hypothetical protein  36.22 
 
 		 281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.381858  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1098  Alpha/beta hydrolase fold  32.14 
 
 		 297 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2699  alpha/beta hydrolase  34.48 
 
 		 299 aa  44.3  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1153  alpha/beta hydrolase fold  47.06 
 
 		 307 aa  43.1  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 		 311 aa  43.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7209  hypothetical protein  27.37 
 
 		 373 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.082879 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1589  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 		 343 aa  42.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>