20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2390 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2390  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  569  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.325647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3061  hypothetical protein  84.84 
 
 		 275 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3331  hypothetical protein  75.46 
 
 		 282 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.400491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3562  hypothetical protein  75.18 
 
 		 275 aa  441  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.252373  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4780  hypothetical protein  74.31 
 
 		 295 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1669  hypothetical protein  63.28 
 
 		 281 aa  351  7e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4040  hypothetical protein  63.91 
 
 		 277 aa  351  8.999999999999999e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3795  hypothetical protein  62.6 
 
 		 277 aa  345  5e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.394583 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1229  hypothetical protein  61.3 
 
 		 275 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116233 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2916  putative hydrolase  56.86 
 
 		 277 aa  310  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0078  hypothetical protein  41.7 
 
 		 526 aa  182  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0137812  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1120  hypothetical protein  36.22 
 
 		 281 aa  113  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.381858  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  27.52 
 
 		 600 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  27.52 
 
 		 600 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2699  alpha/beta hydrolase  36.21 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1589  alpha/beta hydrolase fold  36.21 
 
 		 343 aa  43.1  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  42 
 
 		 289 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 		 311 aa  42.4  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2607  hypothetical protein  24.85 
 
 		 345 aa  42.7  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313351 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1153  alpha/beta hydrolase fold  44.12 
 
 		 307 aa  42  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>