26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4040 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4040  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  569  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3795  hypothetical protein  87.36 
 
 		 277 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.394583 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1669  hypothetical protein  80.07 
 
 		 281 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1229  hypothetical protein  73.45 
 
 		 275 aa  411  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116233 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3562  hypothetical protein  64.89 
 
 		 275 aa  352  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.252373  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2390  hypothetical protein  63.91 
 
 		 277 aa  351  8.999999999999999e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.325647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3061  hypothetical protein  63.74 
 
 		 275 aa  348  5e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2916  putative hydrolase  61.19 
 
 		 277 aa  341  7e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3331  hypothetical protein  61.42 
 
 		 282 aa  340  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.400491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4780  hypothetical protein  60.22 
 
 		 295 aa  334  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0078  hypothetical protein  45.74 
 
 		 526 aa  201  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0137812  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1120  hypothetical protein  39.21 
 
 		 281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.381858  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2047  alpha/beta hydrolase fold  42.03 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.939702  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  29.8 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.444129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  27.97 
 
 		 551 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0978  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 		 305 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  32.74 
 
 		 382 aa  46.6  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3591  hypothetical protein  27.92 
 
 		 269 aa  45.8  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  26.6 
 
 		 380 aa  44.3  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3002  hypothetical protein  23.45 
 
 		 346 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3135  hypothetical protein  23.45 
 
 		 339 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222063  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1357  hypothetical protein  29.86 
 
 		 283 aa  42.7  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0861154 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  42 
 
 		 289 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2607  hypothetical protein  24.39 
 
 		 345 aa  42.7  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313351 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  40.98 
 
 		 281 aa  42.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  36.54 
 
 		 341 aa  42.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>