281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2047 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2047  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 261 aa  544  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.939702  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4105  hypothetical protein  53.21 
 
 		 301 aa  283  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.710482  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02422  acyltransferase 3  43.02 
 
 		 267 aa  236  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2933  alpha/beta hydrolase fold  43.58 
 
 		 279 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0612634  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4203  Alpha/beta hydrolase fold  38.55 
 
 		 268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1702  hypothetical protein  37.11 
 
 		 287 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0351534  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4165  hypothetical protein  36.72 
 
 		 287 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2460  alpha/beta hydrolase fold  36.02 
 
 		 267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3737  alpha/beta fold family hydrolase  35.94 
 
 		 262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3490  alpha/beta fold family hydrolase  35.94 
 
 		 262 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43550  putative hydrolase  35.69 
 
 		 270 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1692  hypothetical protein  35.66 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1691  hypothetical protein  34.88 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3652  putative hydrolase  34.9 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.681326  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2217  hypothetical protein  34.78 
 
 		 269 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105926  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2026  hypothetical protein  33.72 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.852935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1154  alpha/beta hydrolase fold  34 
 
 		 271 aa  166  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  34 
 
 		 271 aa  166  4e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.722843  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1087  alpha/beta fold hydrolase  32.83 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1064  alpha/beta hydrolase fold protein  32.69 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0968  putative hydrolase protein  32.28 
 
 		 273 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1891  hypothetical protein  33.33 
 
 		 275 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2844  hypothetical protein  33.71 
 
 		 280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2563  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 		 267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19966  normal  0.119166 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1570  putative hydrolase  31.82 
 
 		 267 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2580  hypothetical protein  32.95 
 
 		 275 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3591  hypothetical protein  32.28 
 
 		 269 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2714  hydrolase  32.95 
 
 		 275 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2635  hypothetical protein  32.95 
 
 		 275 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348998  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1692  hypothetical protein  32.58 
 
 		 275 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.959069  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1469  hypothetical protein  32.58 
 
 		 275 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.816074  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2196  hypothetical protein  32.58 
 
 		 275 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.446951  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3122  hypothetical protein  32.58 
 
 		 275 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.798487  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1125  putative hydrolase protein  32.28 
 
 		 273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2045  alpha/beta hydrolase fold  33.84 
 
 		 275 aa  145  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5967  hypothetical protein  30.68 
 
 		 281 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.895466  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1160  hypothetical protein  30.68 
 
 		 309 aa  145  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485022 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2128  hypothetical protein  30.3 
 
 		 281 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00833807  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1830  alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2147  hypothetical protein  30.68 
 
 		 281 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0977369  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2110  hypothetical protein  30.3 
 
 		 281 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0833306  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2020  hypothetical protein  31.06 
 
 		 281 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0898087 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5416  hypothetical protein  29.92 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1051  alpha/beta hydrolase fold  32.18 
 
 		 273 aa  143  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1357  hypothetical protein  33.21 
 
 		 283 aa  142  8e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0861154 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1442  alpha/beta hydrolase fold protein  32.95 
 
 		 264 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3339  hypothetical protein  32.44 
 
 		 289 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2272  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 		 286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0854176 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0787  hydrolase  33.09 
 
 		 296 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0793  putative hydrolase  32.35 
 
 		 296 aa  131  9e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72750  hypothetical protein  28.52 
 
 		 292 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6315  hypothetical protein  27.38 
 
 		 292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1736  hypothetical protein  29.52 
 
 		 293 aa  115  5e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000795767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4532  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0479  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4240  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.033675  hitchhiker  0.000000334465 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2358  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2542  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 294 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897918 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2452  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 		 290 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3404  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 290 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.375307 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1678  alpha/beta hydrolase fold protein  23.79 
 
 		 294 aa  93.6  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0849008  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2106  alpha/beta hydrolase fold  23.81 
 
 		 292 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1872  alpha/beta hydrolase fold  23.35 
 
 		 292 aa  90.5  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2333  alpha/beta hydrolase fold  22.57 
 
 		 289 aa  89  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2013  alpha/beta hydrolase fold protein  22.96 
 
 		 289 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.096927  hitchhiker  0.0025286 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  22.69 
 
 		 279 aa  87.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2450  alpha/beta hydrolase fold  22.57 
 
 		 289 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0252  alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 		 305 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0880  alpha/beta hydrolase fold  25.48 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1673  alpha/beta hydrolase fold  22.05 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478799  normal  0.0522844 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0592  alpha/beta hydrolase fold  23.66 
 
 		 300 aa  78.6  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0107  alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0430682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0430  alpha/beta hydrolase fold  22.14 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0089  alpha/beta hydrolase fold  25.5 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1534  alpha/beta hydrolase fold  23.26 
 
 		 285 aa  72  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0162186  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1750  alpha/beta hydrolase fold  23.97 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99004  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0998  alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.461316  hitchhiker  0.000000131083 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2705  alpha/beta hydrolase fold  23.16 
 
 		 305 aa  65.5  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4676  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  27.24 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318593  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  27.36 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  24.52 
 
 		 456 aa  60.1  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  25.35 
 
 		 345 aa  59.3  0.00000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  22.3 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  22.06 
 
 		 363 aa  58.9  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  19.69 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.252363  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  23.88 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  23.97 
 
 		 275 aa  55.5  0.0000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  21.22 
 
 		 294 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0937  alpha/beta hydrolase fold protein  24.26 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  23.95 
 
 		 248 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  23.35 
 
 		 296 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3663  alpha/beta hydrolase fold  26.26 
 
 		 304 aa  53.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30576  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1152  alpha/beta hydrolase fold protein  23.64 
 
 		 239 aa  53.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 		 322 aa  52.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4100  alpha/beta hydrolase fold  20.83 
 
 		 303 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1990  alpha/beta hydrolase fold protein  25.67 
 
 		 308 aa  52.4  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000207277 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0318  alpha/beta hydrolase fold  23.08 
 
 		 308 aa  52.4  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0446  alpha/beta hydrolase fold protein  25.7 
 
 		 318 aa  52  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>