35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1669 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1669  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  580  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3795  hypothetical protein  83.63 
 
 		 277 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.394583 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4040  hypothetical protein  80.07 
 
 		 277 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1229  hypothetical protein  72.24 
 
 		 275 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116233 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3331  hypothetical protein  63.16 
 
 		 282 aa  352  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.400491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2390  hypothetical protein  63.28 
 
 		 277 aa  351  7e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.325647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3061  hypothetical protein  61.45 
 
 		 275 aa  348  6e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3562  hypothetical protein  61.8 
 
 		 275 aa  345  3e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.252373  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2916  putative hydrolase  62.5 
 
 		 277 aa  343  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4780  hypothetical protein  63.64 
 
 		 295 aa  337  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0078  hypothetical protein  43.5 
 
 		 526 aa  199  5e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0137812  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1120  hypothetical protein  37.89 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.381858  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  30.99 
 
 		 551 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2047  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 		 261 aa  47.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.939702  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  33.91 
 
 		 382 aa  46.6  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0076  hypothetical protein  25.13 
 
 		 341 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15541  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  24.83 
 
 		 600 aa  45.4  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3002  hypothetical protein  26.63 
 
 		 346 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  24.83 
 
 		 600 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  27.14 
 
 		 546 aa  45.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3135  hypothetical protein  24.59 
 
 		 339 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222063  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  45.83 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3339  hypothetical protein  32.77 
 
 		 289 aa  44.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3591  hypothetical protein  27.27 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  35.06 
 
 		 281 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  28.45 
 
 		 380 aa  43.9  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1357  hypothetical protein  32.12 
 
 		 283 aa  43.5  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0861154 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1914  alpha/beta fold family hydrolase  30.53 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  27.15 
 
 		 569 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2607  hypothetical protein  25 
 
 		 345 aa  43.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313351 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  25.35 
 
 		 605 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2699  alpha/beta hydrolase  27.87 
 
 		 299 aa  42.7  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 		 340 aa  42.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  30.17 
 
 		 271 aa  42.4  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.722843  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04154  conserved hypothetical protein  30.86 
 
 		 531 aa  42  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>