89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0076 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0076  hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  691    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15541  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  50 
 
 
318 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  50 
 
 
318 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0944  dienelactone hydrolase-like  47.92 
 
 
318 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  50 
 
 
318 aa  289  6e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0593  hydrolase protein  43.81 
 
 
320 aa  261  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  45.89 
 
 
337 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4065  putative hydrolase, putative exported protein  44.69 
 
 
336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263411  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5444  hypothetical protein  43.04 
 
 
327 aa  230  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0680915  normal  0.105622 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1024  hypothetical protein  40 
 
 
330 aa  174  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.401843  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3135  hypothetical protein  33.13 
 
 
339 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222063  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3002  hypothetical protein  33.44 
 
 
346 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1076  dienelactone hydrolase-like protein  33.33 
 
 
476 aa  143  5e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2838  hypothetical protein  31.95 
 
 
348 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540199  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2934  hypothetical protein  32.11 
 
 
348 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2607  hypothetical protein  30.48 
 
 
345 aa  135  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.313351 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2757  hypothetical protein  32.1 
 
 
348 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0630  hypothetical protein  31.75 
 
 
410 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  28.09 
 
 
347 aa  105  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  26.91 
 
 
347 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  29.67 
 
 
338 aa  100  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2566  dienelactone hydrolase-like  31.53 
 
 
439 aa  97.1  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5358  putative lipoprotein signal peptide  27.9 
 
 
374 aa  95.9  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1988  hypothetical protein  28.86 
 
 
376 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.872973  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2487  putative lipoprotein signal peptide  28.16 
 
 
334 aa  93.6  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  31.32 
 
 
345 aa  93.2  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  26.88 
 
 
365 aa  92.4  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0009  hypothetical protein  29.23 
 
 
298 aa  92.4  9e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  29.49 
 
 
342 aa  92  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  27.9 
 
 
372 aa  90.5  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5818  hypothetical protein  29.84 
 
 
300 aa  88.2  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  31.2 
 
 
607 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0800  putative lipoprotein signal peptide  24.28 
 
 
373 aa  83.6  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0309  putative lipoprotein signal peptide  27.68 
 
 
352 aa  82.8  0.000000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.45814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  29.59 
 
 
543 aa  80.9  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  29.27 
 
 
572 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  32.24 
 
 
533 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2590  hypothetical protein  22.65 
 
 
341 aa  77  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  29.05 
 
 
572 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0331  putative lipoprotein signal peptide  28.63 
 
 
343 aa  75.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435973  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  31.63 
 
 
547 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1192  hypothetical protein  29.84 
 
 
316 aa  73.6  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  29.35 
 
 
569 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  29.15 
 
 
551 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  28.92 
 
 
567 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  27.93 
 
 
567 aa  70.5  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3713  hypothetical protein  27.69 
 
 
346 aa  67.8  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  28.63 
 
 
568 aa  67.8  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  29.23 
 
 
546 aa  67.4  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  26.77 
 
 
605 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  29.41 
 
 
568 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3848  hypothetical protein  26.2 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  25.1 
 
 
565 aa  65.9  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  27.6 
 
 
600 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  27.6 
 
 
600 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1764  hypothetical protein  36.94 
 
 
340 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.49495  normal  0.0945387 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  24.67 
 
 
601 aa  61.6  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  26.5 
 
 
545 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  26.45 
 
 
526 aa  60.5  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  36.81 
 
 
410 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  26.78 
 
 
382 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6097  hypothetical protein  26.81 
 
 
332 aa  57  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  30.65 
 
 
430 aa  56.2  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  23.79 
 
 
328 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1079  hypothetical protein  25 
 
 
369 aa  55.1  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000122089  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3307  dienelactone hydrolase-like  26.44 
 
 
449 aa  55.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1107  dienelactone hydrolase-like protein  24.45 
 
 
369 aa  53.9  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.12853  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  27.94 
 
 
380 aa  53.1  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1306  hypothetical protein  30.2 
 
 
339 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0371731 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2690  hypothetical protein  29.21 
 
 
498 aa  50.4  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165896  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1441  hypothetical protein  22.26 
 
 
312 aa  49.7  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3493  dienelactone hydrolase-like protein  28.5 
 
 
433 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44711  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1172  dienelactone hydrolase-like protein  27.95 
 
 
449 aa  48.9  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2316  hypothetical protein  27.68 
 
 
498 aa  48.5  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1800  protein of unknown function DUF1400  23.75 
 
 
542 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3164  hypothetical protein  33.61 
 
 
309 aa  47.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483676 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4877  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  29.89 
 
 
396 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1038  hypothetical protein  23.68 
 
 
468 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.059236  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1669  hypothetical protein  26.15 
 
 
281 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2145  protein of unknown function DUF1400  22.82 
 
 
570 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1117  dienelactone hydrolase-like protein  32.89 
 
 
313 aa  46.6  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.218404  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1229  hypothetical protein  22.59 
 
 
275 aa  46.2  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3378  hypothetical protein  38.98 
 
 
546 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127536  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39860  hypothetical protein  38.98 
 
 
546 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0371  putative lipoprotein signal peptide  27.21 
 
 
146 aa  44.3  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.797629 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5886  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  31.58 
 
 
361 aa  42.7  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.695825 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1405  hypothetical protein  26.85 
 
 
342 aa  43.1  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301855  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  31.19 
 
 
464 aa  42.7  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1021  hypothetical protein  34.31 
 
 
389 aa  42.7  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>