33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0371 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0371  putative lipoprotein signal peptide  100 
 
 
146 aa  299  9e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.797629 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  66.13 
 
 
365 aa  164  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0800  putative lipoprotein signal peptide  40.48 
 
 
373 aa  93.2  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  38.1 
 
 
372 aa  91.7  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5358  putative lipoprotein signal peptide  38.64 
 
 
374 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2487  putative lipoprotein signal peptide  37.5 
 
 
334 aa  82.8  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1306  hypothetical protein  38.79 
 
 
339 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0371731 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1405  hypothetical protein  36.7 
 
 
342 aa  74.3  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301855  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3002  hypothetical protein  33.33 
 
 
346 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3135  hypothetical protein  33.33 
 
 
339 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222063  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2607  hypothetical protein  32.11 
 
 
345 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.313351 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1441  hypothetical protein  30.91 
 
 
312 aa  59.7  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1024  hypothetical protein  28.18 
 
 
330 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.401843  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  30.56 
 
 
328 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3848  hypothetical protein  29.2 
 
 
330 aa  57.4  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1076  dienelactone hydrolase-like protein  31.62 
 
 
476 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0309  putative lipoprotein signal peptide  40.28 
 
 
352 aa  55.5  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.45814 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0331  putative lipoprotein signal peptide  40.91 
 
 
343 aa  54.7  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435973  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2838  hypothetical protein  31.19 
 
 
348 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540199  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  29.32 
 
 
347 aa  53.9  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5444  hypothetical protein  29.75 
 
 
327 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0680915  normal  0.105622 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2757  hypothetical protein  29.36 
 
 
348 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2934  hypothetical protein  29.36 
 
 
348 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0990  hypothetical protein  37.5 
 
 
278 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  27.97 
 
 
347 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2590  hypothetical protein  21.01 
 
 
341 aa  47  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0076  hypothetical protein  27.82 
 
 
341 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15541  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  25.56 
 
 
318 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  28.44 
 
 
337 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  25.56 
 
 
318 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  25.56 
 
 
318 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0009  hypothetical protein  23.68 
 
 
298 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  29.37 
 
 
601 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>