87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1405 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1405  hypothetical protein  100 
 
 
342 aa  685    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301855  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1306  hypothetical protein  87.83 
 
 
339 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0371731 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3848  hypothetical protein  48.2 
 
 
330 aa  318  9e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  45.81 
 
 
328 aa  280  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6097  hypothetical protein  48.01 
 
 
332 aa  278  8e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0800  putative lipoprotein signal peptide  34.93 
 
 
373 aa  182  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2487  putative lipoprotein signal peptide  36.28 
 
 
334 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  35.28 
 
 
365 aa  160  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  34.31 
 
 
372 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5358  putative lipoprotein signal peptide  32.27 
 
 
374 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0331  putative lipoprotein signal peptide  31.19 
 
 
343 aa  120  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435973  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0990  hypothetical protein  30.88 
 
 
278 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3315  lipoprotein signal peptide  31.63 
 
 
302 aa  99  9e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222705  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0309  putative lipoprotein signal peptide  31.77 
 
 
352 aa  97.8  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.45814 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  29.51 
 
 
345 aa  90.9  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  27.92 
 
 
347 aa  89.4  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  28.96 
 
 
347 aa  87.4  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  29.93 
 
 
338 aa  87  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2838  hypothetical protein  25.95 
 
 
348 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540199  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2934  hypothetical protein  25.95 
 
 
348 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2757  hypothetical protein  25.32 
 
 
348 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0371  putative lipoprotein signal peptide  36.7 
 
 
146 aa  74.3  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.797629 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  26.89 
 
 
546 aa  73.9  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2566  dienelactone hydrolase-like  27.72 
 
 
439 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  28.12 
 
 
342 aa  73.2  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2590  hypothetical protein  23.6 
 
 
341 aa  72.8  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1441  hypothetical protein  24.57 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2607  hypothetical protein  26.69 
 
 
345 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.313351 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  26.36 
 
 
545 aa  70.1  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  25.79 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3307  dienelactone hydrolase-like  26.46 
 
 
449 aa  67.4  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  25.86 
 
 
318 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  25.86 
 
 
318 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0944  dienelactone hydrolase-like  27.16 
 
 
318 aa  67  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  25.39 
 
 
430 aa  67  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3002  hypothetical protein  25.87 
 
 
346 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3135  hypothetical protein  25.35 
 
 
339 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222063  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  26.1 
 
 
607 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1024  hypothetical protein  26.93 
 
 
330 aa  62.4  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.401843  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  24.06 
 
 
601 aa  62  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0593  hydrolase protein  26.07 
 
 
320 aa  60.8  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3713  hypothetical protein  25.53 
 
 
346 aa  60.5  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  25.57 
 
 
337 aa  59.7  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0009  hypothetical protein  24.76 
 
 
298 aa  58.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  26.02 
 
 
543 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  25.5 
 
 
569 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  24.73 
 
 
572 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1800  protein of unknown function DUF1400  24.22 
 
 
542 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  28.14 
 
 
464 aa  56.6  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  24.82 
 
 
572 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  25.12 
 
 
533 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5444  hypothetical protein  23.44 
 
 
327 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0680915  normal  0.105622 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3493  dienelactone hydrolase-like protein  28.2 
 
 
433 aa  53.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44711  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1172  dienelactone hydrolase-like protein  22.01 
 
 
449 aa  53.5  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0630  hypothetical protein  30.99 
 
 
410 aa  53.1  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1237  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  30.56 
 
 
350 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136395  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1126  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  30.56 
 
 
350 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  26.21 
 
 
568 aa  51.6  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  22.66 
 
 
547 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  22.4 
 
 
565 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  26.69 
 
 
382 aa  50.8  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  25.7 
 
 
568 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  22.93 
 
 
605 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  25.69 
 
 
410 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2163  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  22.84 
 
 
330 aa  49.3  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0271635  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1988  hypothetical protein  27.03 
 
 
376 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.872973  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  25.23 
 
 
567 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  23.39 
 
 
600 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  25.71 
 
 
551 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  23.29 
 
 
600 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5886  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  31.76 
 
 
361 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.695825 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  23.95 
 
 
526 aa  46.6  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  22.79 
 
 
567 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3287  hypothetical protein  33.88 
 
 
322 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001493  hypothetical protein  25.52 
 
 
339 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.271715  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27760  Platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  30.16 
 
 
474 aa  45.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0623515  normal  0.667788 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4783  hypothetical protein  32.04 
 
 
253 aa  44.3  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1794  hypothetical protein  32.14 
 
 
306 aa  44.3  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  25 
 
 
380 aa  44.3  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4065  putative hydrolase, putative exported protein  26.21 
 
 
336 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263411  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0076  hypothetical protein  26.71 
 
 
341 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15541  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4327  hypothetical protein  35.45 
 
 
319 aa  43.5  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2297  peptidase S15  32.14 
 
 
306 aa  42.7  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2969  hypothetical protein  24.6 
 
 
324 aa  42.7  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  26.63 
 
 
303 aa  43.1  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1975  hypothetical protein  32.14 
 
 
306 aa  42.7  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0078  prolyl oligopeptidase family protein  22.39 
 
 
665 aa  42.7  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>