86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1988 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1988  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  769    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.872973  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1076  dienelactone hydrolase-like protein  44.66 
 
 		 476 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0630  hypothetical protein  44.71 
 
 		 410 aa  264  2e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2566  dienelactone hydrolase-like  38.99 
 
 		 439 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2607  hypothetical protein  33.45 
 
 		 345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313351 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3135  hypothetical protein  28.79 
 
 		 339 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222063  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3002  hypothetical protein  28.88 
 
 		 346 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2934  hypothetical protein  29.32 
 
 		 348 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2757  hypothetical protein  29.01 
 
 		 348 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2838  hypothetical protein  29.31 
 
 		 348 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540199  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0944  dienelactone hydrolase-like  30.34 
 
 		 318 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0593  hydrolase protein  30 
 
 		 320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  28.87 
 
 		 318 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  30.66 
 
 		 337 aa  109  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1024  hypothetical protein  29.84 
 
 		 330 aa  109  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.401843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  28.52 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  28.52 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  27.38 
 
 		 347 aa  97.1  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0800  putative lipoprotein signal peptide  27.53 
 
 		 373 aa  95.9  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  29.34 
 
 		 372 aa  94.7  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0076  hypothetical protein  28.62 
 
 		 341 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15541  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2487  putative lipoprotein signal peptide  27.46 
 
 		 334 aa  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4065  putative hydrolase, putative exported protein  28.9 
 
 		 336 aa  91.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263411  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  30.69 
 
 		 365 aa  90.1  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0009  hypothetical protein  27.27 
 
 		 298 aa  89.4  8e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5358  putative lipoprotein signal peptide  27.47 
 
 		 374 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  29.41 
 
 		 382 aa  86.3  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5444  hypothetical protein  25.59 
 
 		 327 aa  85.1  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0680915  normal  0.105622 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  28.62 
 
 		 380 aa  82  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1192  hypothetical protein  33.77 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  26.19 
 
 		 347 aa  79  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  26.3 
 
 		 338 aa  77.8  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  25.66 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3713  hypothetical protein  25.64 
 
 		 346 aa  73.2  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  27.11 
 
 		 607 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  27.35 
 
 		 543 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  27.71 
 
 		 545 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0331  putative lipoprotein signal peptide  27.81 
 
 		 343 aa  70.9  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  28.5 
 
 		 551 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  29.77 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  23.11 
 
 		 572 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3307  dienelactone hydrolase-like  25.73 
 
 		 449 aa  68.2  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5818  hypothetical protein  32.89 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  27.38 
 
 		 546 aa  67.4  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  26.21 
 
 		 410 aa  67  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2590  hypothetical protein  23.7 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  23.69 
 
 		 572 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  27.69 
 
 		 547 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  26.4 
 
 		 533 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  31.15 
 
 		 568 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1800  protein of unknown function DUF1400  26.8 
 
 		 542 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1764  hypothetical protein  26.3 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.49495  normal  0.0945387 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2145  protein of unknown function DUF1400  24.39 
 
 		 570 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  24.67 
 
 		 567 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  30.81 
 
 		 567 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  25.15 
 
 		 328 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  24.44 
 
 		 565 aa  57.4  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2723  protein of unknown function DUF1400  24.39 
 
 		 571 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128578  hitchhiker  0.00368016 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2316  hypothetical protein  28.42 
 
 		 498 aa  56.6  0.0000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  23.26 
 
 		 601 aa  56.2  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  24.18 
 
 		 568 aa  56.2  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001493  hypothetical protein  24.34 
 
 		 339 aa  54.7  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.271715  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  25 
 
 		 600 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  25 
 
 		 600 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1172  dienelactone hydrolase-like protein  25.98 
 
 		 449 aa  54.3  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  24.77 
 
 		 569 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  23.03 
 
 		 430 aa  53.5  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0127  putative signal peptide protein  30.66 
 
 		 311 aa  53.1  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.498965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0309  putative lipoprotein signal peptide  25.9 
 
 		 352 aa  52.4  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.45814 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3848  hypothetical protein  23.59 
 
 		 330 aa  50.4  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0787  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  26.26 
 
 		 382 aa  50.4  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0119  conserved hypothetical signal peptide protein  29.93 
 
 		 312 aa  50.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3493  dienelactone hydrolase-like protein  24.4 
 
 		 433 aa  50.1  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  24.76 
 
 		 605 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  23.89 
 
 		 464 aa  48.5  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0268  putative signal peptide protein  28.47 
 
 		 308 aa  48.9  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.412129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1306  hypothetical protein  27.82 
 
 		 339 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0371731 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6097  hypothetical protein  23.53 
 
 		 332 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1405  hypothetical protein  27.03 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30181  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.56 
 
 		 505 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.157772 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0036  TPR repeat-containing protein  29.36 
 
 		 514 aa  47  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83786  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1441  hypothetical protein  21.59 
 
 		 312 aa  46.2  0.0009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  24.09 
 
 		 259 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2690  hypothetical protein  24.52 
 
 		 498 aa  46.2  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  21.86 
 
 		 526 aa  43.9  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00990  platelet-activating factor acetylhydrolase 2, cytoplasmic, putative  33.33 
 
 		 417 aa  43.1  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>