74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5886 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5886  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  100 
 
 
361 aa  712    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.695825 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1126  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  68.62 
 
 
350 aa  429  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1237  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  68.31 
 
 
350 aa  424  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136395  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  31.39 
 
 
568 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2163  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  32.18 
 
 
330 aa  107  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0271635  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1117  dienelactone hydrolase-like protein  29.97 
 
 
313 aa  106  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.218404  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  29.87 
 
 
526 aa  102  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  27.03 
 
 
545 aa  94.4  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  26.3 
 
 
605 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  26.35 
 
 
546 aa  84.7  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  22.59 
 
 
565 aa  82.8  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  27.12 
 
 
569 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  25.5 
 
 
600 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  25.5 
 
 
600 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  31.16 
 
 
567 aa  72.4  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  26.69 
 
 
551 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  24.45 
 
 
543 aa  70.5  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  30.63 
 
 
547 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3164  hypothetical protein  30.77 
 
 
309 aa  69.3  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483676 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  31.13 
 
 
568 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4327  hypothetical protein  32.67 
 
 
319 aa  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  35.29 
 
 
607 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2943  hypothetical protein  33.57 
 
 
309 aa  63.9  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000846327  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2969  hypothetical protein  31.13 
 
 
324 aa  63.5  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4670  hypothetical protein  35.37 
 
 
297 aa  62.8  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610067  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0331  putative lipoprotein signal peptide  37.93 
 
 
343 aa  62.4  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435973  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3190  hypothetical protein  29.33 
 
 
324 aa  62.4  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525581 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2145  protein of unknown function DUF1400  22.7 
 
 
570 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  23.16 
 
 
601 aa  61.2  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1800  protein of unknown function DUF1400  25.47 
 
 
542 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1295  hypothetical protein  27.7 
 
 
369 aa  58.9  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.103756  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1107  dienelactone hydrolase-like protein  26.98 
 
 
369 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.12853  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  25.52 
 
 
430 aa  58.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2084  hypothetical protein  30.29 
 
 
322 aa  57.4  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  28.97 
 
 
533 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3288  hypothetical protein  31.8 
 
 
308 aa  56.6  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350396  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  28.21 
 
 
572 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2723  protein of unknown function DUF1400  22.3 
 
 
571 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128578  hitchhiker  0.00368016 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0800  putative lipoprotein signal peptide  34.51 
 
 
373 aa  56.2  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  27.46 
 
 
567 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  31.9 
 
 
328 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  29.06 
 
 
572 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1079  hypothetical protein  27.34 
 
 
369 aa  53.1  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000122089  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1811  hypothetical protein  26.88 
 
 
642 aa  52.8  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.185715  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3287  hypothetical protein  29.41 
 
 
322 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0787  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  25.59 
 
 
382 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1883  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  29.33 
 
 
393 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2206  hypothetical protein  30.14 
 
 
336 aa  51.2  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  26.67 
 
 
382 aa  50.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2487  putative lipoprotein signal peptide  26.3 
 
 
334 aa  49.7  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1888  carboxylic ester hydrolase  25.99 
 
 
456 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1306  hypothetical protein  37.39 
 
 
339 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0371731 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  35 
 
 
365 aa  49.3  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  25 
 
 
464 aa  49.3  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2227  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  28.29 
 
 
488 aa  48.9  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0390  hypothetical protein  24.85 
 
 
318 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.752733 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.08 
 
 
652 aa  47.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.164406 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2228  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  24.37 
 
 
406 aa  47.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  31.72 
 
 
318 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0448  peptidase  40 
 
 
678 aa  46.6  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2512  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.86 
 
 
317 aa  46.2  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.119667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  31.72 
 
 
318 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  31.72 
 
 
318 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1405  hypothetical protein  31.76 
 
 
342 aa  46.2  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301855  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3758  secreted protein  26.85 
 
 
911 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2596  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  31.29 
 
 
426 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.073568  normal  0.0520068 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0944  dienelactone hydrolase-like  31.15 
 
 
318 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3511  prolyl oligopeptidase family protein  29.45 
 
 
638 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3459  carboxylic ester hydrolase  27.04 
 
 
456 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.675018  hitchhiker  1.26241e-19 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5818  hypothetical protein  35.34 
 
 
300 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.39 
 
 
653 aa  44.3  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  25.78 
 
 
281 aa  43.5  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0309  putative lipoprotein signal peptide  29.71 
 
 
352 aa  43.1  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.45814 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0076  hypothetical protein  31.58 
 
 
341 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>