More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0358 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  100 
 
 
281 aa  571  1.0000000000000001e-162  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25940  hypothetical protein  42.5 
 
 
214 aa  162  7e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.375139 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1684  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  32.81 
 
 
248 aa  115  7.999999999999999e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  31.73 
 
 
258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  31.3 
 
 
260 aa  107  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  29.41 
 
 
261 aa  99.4  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  28.69 
 
 
259 aa  88.2  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  28.7 
 
 
246 aa  86.7  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  30.53 
 
 
274 aa  86.3  5e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0929  putative hydrolase  31.4 
 
 
252 aa  85.1  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  26.48 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17390  hypothetical protein  27.31 
 
 
268 aa  82.4  0.000000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2237  hypothetical protein  28.23 
 
 
269 aa  79  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166589  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 
274 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0322  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  25.9 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000337661  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 
273 aa  72.4  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  29.02 
 
 
279 aa  65.1  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1717  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
315 aa  65.1  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42770  hypothetical protein  25.1 
 
 
327 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0700  hypothetical protein  28.24 
 
 
276 aa  62.8  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000140392  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0544  hypothetical protein  28.24 
 
 
276 aa  62.8  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00193081  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  25.57 
 
 
246 aa  62.4  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1721  Alpha/beta hydrolase fold  23.18 
 
 
317 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4571  PGAP1 family protein  24.67 
 
 
260 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644055  normal  0.28491 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  28.49 
 
 
321 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2236  prolyl oligopeptidase family protein  23.98 
 
 
270 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.99651  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  24.68 
 
 
257 aa  58.5  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1829  alpha/beta fold family hydrolase  24.91 
 
 
319 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.174462  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3592  hypothetical protein  24.19 
 
 
323 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3249  dienelactone hydrolase  27.5 
 
 
349 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3881  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
320 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00418628  normal  0.248118 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1859  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  24.38 
 
 
256 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1475  hydrolase family protein  28.14 
 
 
335 aa  57.4  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2005  hypothetical protein  25 
 
 
259 aa  57  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.878418  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23740  hydrolase, alpha/beta fold family  25.3 
 
 
317 aa  57.4  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.582768  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3504  hypothetical protein  24.07 
 
 
256 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.705316  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  32.52 
 
 
317 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3572  dienelactone hydrolase  26.67 
 
 
349 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.660184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8386  hydrolase, alpha  22.13 
 
 
304 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139718  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1158  phospholipase/carboxylesterase  24.76 
 
 
221 aa  56.6  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0188854 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00330  hypothetical protein  25.1 
 
 
248 aa  56.2  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0293  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  25.53 
 
 
321 aa  55.8  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.744416  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4562  alpha/beta hydrolase fold protein  24.58 
 
 
260 aa  55.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  27.81 
 
 
253 aa  55.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1437  alpha/beta hydrolase fold  24.6 
 
 
320 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.872938  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3871  alpha/beta hydrolase fold protein  30.22 
 
 
313 aa  55.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1881  lysophospholipase-like protein  25.56 
 
 
330 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.27985  normal  0.592044 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  24.34 
 
 
405 aa  55.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04770  alpha/beta hydrolase fold protein  26.22 
 
 
424 aa  55.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000317728  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2202  dienelactone hydrolase  25.23 
 
 
528 aa  55.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.413126  decreased coverage  0.0031404 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3105  alpha/beta hydrolase fold  32.14 
 
 
257 aa  55.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0635693  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1347  putative lipase  23.25 
 
 
278 aa  54.3  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2702  hypothetical protein  25.87 
 
 
292 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0546858  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5814  hypothetical protein  30.19 
 
 
208 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.482605  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5039  hypothetical protein  26.36 
 
 
252 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00504479 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2747  hypothetical protein  25.87 
 
 
292 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2809  hypothetical protein  25.87 
 
 
292 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522883  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6158  peptidase S15  28.1 
 
 
295 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 
271 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2291  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  26.87 
 
 
256 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155063  hitchhiker  0.0000115938 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  27.05 
 
 
295 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4026  hypothetical protein  28.18 
 
 
278 aa  53.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.381754  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  29.17 
 
 
278 aa  53.1  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3437  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  25.1 
 
 
256 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.431978 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 
297 aa  52.4  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3671  alpha/beta hydrolase fold  24.14 
 
 
314 aa  52.8  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.416177 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3638  alpha/beta hydrolase fold  27.67 
 
 
290 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3712  alpha/beta hydrolase fold protein  27.67 
 
 
290 aa  52.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  25.91 
 
 
290 aa  52.4  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5227  hypothetical protein  29.51 
 
 
315 aa  52.4  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.335555 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0877  hypothetical protein  26.83 
 
 
316 aa  52  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000690525  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1801  alpha/beta hydrolase fold  23.27 
 
 
254 aa  52  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1551  putative esterase/lipase  25.2 
 
 
271 aa  52  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.152669 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2325  hypothetical protein  28.28 
 
 
279 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00039839  decreased coverage  0.00000132224 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6845  hypothetical protein  28.04 
 
 
306 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2224  hypothetical protein  25.11 
 
 
267 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3244  phospholipase/carboxylesterase  26.23 
 
 
245 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2042  hypothetical protein  25.78 
 
 
343 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.429785  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1202  hypothetical protein  28.97 
 
 
306 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  24.39 
 
 
277 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  23.73 
 
 
425 aa  51.2  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2532  hypothetical protein  25.22 
 
 
292 aa  51.2  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  30.17 
 
 
282 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5537  Lysophospholipase-like protein  30.71 
 
 
266 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.738502  normal  0.85419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  22.83 
 
 
264 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  26.55 
 
 
415 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  24.31 
 
 
284 aa  51.2  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7068  hypothetical protein  25.85 
 
 
267 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  27.56 
 
 
294 aa  50.4  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2785  peptidase S15  28.15 
 
 
668 aa  50.4  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  25.1 
 
 
292 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4367  Acylglycerol lipase  29.44 
 
 
265 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  27.51 
 
 
309 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0831  alpha/beta hydrolase fold protein  22.71 
 
 
344 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3601  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.68 
 
 
661 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0494  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.61 
 
 
685 aa  50.4  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0656758  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4098  protein of unknown function UPF0227  25.24 
 
 
222 aa  50.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1407  alpha/beta hydrolase fold  24.56 
 
 
320 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0821941  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  25.12 
 
 
311 aa  50.4  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
284 aa  50.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>