110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3249 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3572  dienelactone hydrolase  98.28 
 
 		 349 aa  714    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.660184 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3249  dienelactone hydrolase  100 
 
 		 349 aa  724    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5814  hypothetical protein  73.74 
 
 		 208 aa  299  6e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.482605  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2757  hypothetical protein  32.85 
 
 		 351 aa  136  7.000000000000001e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.140498 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5026  hypothetical protein  33.33 
 
 		 326 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5282  hypothetical protein  38.25 
 
 		 334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7027  hypothetical protein  33.74 
 
 		 321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00368212  normal  0.0842851 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0851  dienelactone hydrolase  30 
 
 		 281 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4564  dienelactone hydrolase  31.62 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7213  putative dienelactone hydrolase  32.81 
 
 		 284 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.125525  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4797  hypothetical protein  29.01 
 
 		 297 aa  97.4  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252351  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0723  dienelactone hydrolase  28.08 
 
 		 281 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0227  dienelactone hydrolase  34.13 
 
 		 283 aa  92  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.771569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4585  dienelactone hydrolase  31.88 
 
 		 275 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0150817  normal  0.0493147 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2873  hypothetical protein  27.64 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4308  putative dienelactone hydrolase family protein, putative signal peptide  29.22 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3626  dienelactone hydrolase  34.52 
 
 		 301 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2471  dienelactone hydrolase  31.09 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164719  normal  0.138775 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4291  dienelactone hydrolase  29.91 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3371  dienelactone hydrolase  30.14 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3694  dienelactone hydrolase  30.3 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0047  dienelactone hydrolase  33.89 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  30.58 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4106  dienelactone hydrolase  29.22 
 
 		 275 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  28.7 
 
 		 261 aa  72.4  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  26.46 
 
 		 254 aa  67  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1694  putative dienelactone hydrolase family protein  25.91 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  26.15 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0072  dienelactone hydrolase  28.16 
 
 		 365 aa  62  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.885053  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4783  hypothetical protein  29.58 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4702  dienelactone hydrolase  27.67 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0055  putative signal peptide protein  33.33 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.250308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  30.77 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0643  dienelactone hydrolase  29.13 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.424944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  27.27 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1104  dipeptidyl peptidase IV  27.07 
 
 		 752 aa  57.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  27.5 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1858  dienelactone hydrolase  29.95 
 
 		 275 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0385469 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3656  dienelactone hydrolase  25.58 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4157  dienelactone hydrolase  22.93 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138582  normal  0.0101627 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2536  dienelactone hydrolase family protein  27.94 
 
 		 270 aa  55.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4947  dienelactone hydrolase  28.91 
 
 		 241 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.316291  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0597  dienelactone hydrolase family protein  27.94 
 
 		 243 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3175  dienelactone hydrolase  24.42 
 
 		 272 aa  53.1  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.391894  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1217  dienelactone hydrolase domain-containing protein  27.31 
 
 		 310 aa  52.8  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  25.5 
 
 		 298 aa  52.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0787  dienelactone hydrolase family protein  28.11 
 
 		 356 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307266  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0612  dienelactone hydrolase family protein  27.45 
 
 		 243 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1677  dienelactone hydrolase family protein  25.48 
 
 		 262 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3711  dienelactone hydrolase  25.96 
 
 		 262 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138504 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  28.45 
 
 		 292 aa  50.8  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  28.23 
 
 		 296 aa  50.4  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1803  dienelactone hydrolase family protein  25.74 
 
 		 239 aa  49.7  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.100178  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4116  dienelactone hydrolase  28.93 
 
 		 335 aa  49.3  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0198407  normal  0.0302336 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  26.51 
 
 		 291 aa  49.3  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14490  putative hydrolase  28.12 
 
 		 307 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49330  hypothetical protein  25.37 
 
 		 262 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.295044  normal  0.0937035 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  25.86 
 
 		 261 aa  49.3  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24560  dienelactone hydrolase-like enzyme  25.59 
 
 		 249 aa  48.9  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.278572  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4242  dienelactone hydrolase  26.79 
 
 		 263 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0790  dienelactone hydrolase  24.5 
 
 		 269 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  25.49 
 
 		 292 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0293  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  24.37 
 
 		 321 aa  48.5  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.744416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  27.69 
 
 		 299 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  27.59 
 
 		 296 aa  47.8  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  29.36 
 
 		 309 aa  47.8  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4214  hypothetical protein  24.39 
 
 		 262 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  25.16 
 
 		 451 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3045  dienelactone hydrolase  27.51 
 
 		 249 aa  47  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1620  hypothetical protein  32.8 
 
 		 309 aa  47  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  25 
 
 		 291 aa  47  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  27.18 
 
 		 324 aa  46.6  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2979  hypothetical protein  31.25 
 
 		 300 aa  46.6  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  28.35 
 
 		 317 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  30.19 
 
 		 297 aa  46.2  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0914  dienelactone hydrolase  23.81 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3329  hypothetical protein  26.02 
 
 		 362 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0551  carboxylesterase protein  33.07 
 
 		 226 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315382  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  26.55 
 
 		 259 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4918  putative esterase/lipase precursor  24.68 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.220535  normal  0.753644 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  32.41 
 
 		 442 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3968  peptidase S9B, dipeptidylpeptidase IV-like  29.69 
 
 		 735 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.507879  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  26.96 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3216  hypothetical protein  26.49 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.476052  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0717  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  30.66 
 
 		 362 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1963  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.31 
 
 		 669 aa  44.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.159211  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1043  hydrolase  30.88 
 
 		 337 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.374742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  33.02 
 
 		 580 aa  44.3  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2038  peptidase S15  25.23 
 
 		 306 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907978  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3085  peptidase S15  24.89 
 
 		 287 aa  44.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  33.94 
 
 		 258 aa  44.3  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6867  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  34.96 
 
 		 304 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0501  dienelactone hydrolase family protein  27.57 
 
 		 242 aa  44.3  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.821381  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2526  carboxymethylenebutenolidase  27.78 
 
 		 294 aa  43.9  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6185  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  29.73 
 
 		 733 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2670  Alpha/beta hydrolase  29.17 
 
 		 304 aa  43.9  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5622  Acetyl xylan esterase  28.33 
 
 		 407 aa  43.5  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.951758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4244  peptidase S15  25.89 
 
 		 256 aa  43.5  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  26.5 
 
 		 295 aa  43.5  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5412  Carboxymethylenebutenolidase  26.13 
 
 		 233 aa  43.1  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>