97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2042 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2042  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  676    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.429785  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1852  hypothetical protein  88.72 
 
 		 343 aa  569  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.613868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1721  Alpha/beta hydrolase fold  66.24 
 
 		 317 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1437  alpha/beta hydrolase fold  64.63 
 
 		 320 aa  394  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.872938  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1829  alpha/beta fold family hydrolase  63.99 
 
 		 319 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.174462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3881  alpha/beta hydrolase fold  63.99 
 
 		 320 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00418628  normal  0.248118 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1407  alpha/beta hydrolase fold  63.02 
 
 		 320 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0821941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23740  hydrolase, alpha/beta fold family  62.26 
 
 		 317 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.582768  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1881  lysophospholipase-like protein  58.47 
 
 		 330 aa  351  1e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.27985  normal  0.592044 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42770  hypothetical protein  57.24 
 
 		 327 aa  334  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3592  hypothetical protein  56.25 
 
 		 323 aa  331  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0162  alpha/beta hydrolase fold  47.13 
 
 		 321 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04770  alpha/beta hydrolase fold protein  43.3 
 
 		 424 aa  246  3e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000317728  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1717  alpha/beta hydrolase fold  40.13 
 
 		 315 aa  242  7e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1262  alpha/beta hydrolase fold  45.73 
 
 		 319 aa  233  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0877  hypothetical protein  38.72 
 
 		 316 aa  218  2e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000690525  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2298  alpha/beta hydrolase fold protein  40.85 
 
 		 322 aa  202  8e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.321032  decreased coverage  0.000193345 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1501  Alpha/beta hydrolase  44.06 
 
 		 302 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.568195  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6540  alpha/beta hydrolase fold  43.15 
 
 		 302 aa  198  9e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300513  normal  0.534481 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1232  alpha/beta fold family hydrolase  37.13 
 
 		 305 aa  195  8.000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1315  alpha/beta hydrolase fold  39.66 
 
 		 320 aa  195  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0924774  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07480  hypothetical protein  32.01 
 
 		 308 aa  144  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2263  alpha/beta hydrolase  32.23 
 
 		 315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0299  hypothetical protein  34.16 
 
 		 307 aa  119  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.261674 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  29.02 
 
 		 580 aa  87.4  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0597  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28.85 
 
 		 412 aa  85.9  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.458805  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0583  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28.85 
 
 		 412 aa  85.9  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3018  hypothetical protein  24.91 
 
 		 338 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.277726  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3348  hypothetical protein  23.53 
 
 		 339 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.077916  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2741  hypothetical protein  29.79 
 
 		 498 aa  80.9  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1130  hypothetical protein  28.52 
 
 		 400 aa  80.5  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0501  hypothetical protein  25.27 
 
 		 436 aa  80.5  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.672777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3346  hypothetical protein  24.28 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3112  hypothetical protein  24.54 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.200391  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3325  hypothetical protein  24.91 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3343  hypothetical protein  24.72 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.975652  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3126  hypothetical protein  23.38 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3372  hypothetical protein  23.38 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1620  hypothetical protein  28.04 
 
 		 309 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1906  hypothetical protein  28.24 
 
 		 434 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.189773  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3539  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3329  hypothetical protein  26.11 
 
 		 362 aa  72.4  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3820  PGAP1 family protein  27.63 
 
 		 485 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.233276  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  24.67 
 
 		 442 aa  70.5  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2030  hypothetical protein  26.67 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.258009 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1419  hypothetical protein  26.67 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.692935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6145  peptidase S15  29.41 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000966122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2079  putative hydrolase  27.18 
 
 		 512 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0691  hypothetical protein  26.6 
 
 		 319 aa  67  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2249  peptidase S15  28.62 
 
 		 474 aa  66.6  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000310265  normal  0.111012 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2905  putative hydrolase  27.18 
 
 		 512 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.212149  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5342  hypothetical protein  29.62 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.764052  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5534  hypothetical protein  35.51 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.82646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3509  Dienelactone hydrolase  28.06 
 
 		 438 aa  63.5  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0131  putative secreted protein  27.97 
 
 		 337 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343092  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3161  putative hydrolase  26.01 
 
 		 512 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  21.94 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5497  putative hydrolase  26.76 
 
 		 460 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.134483 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1040  dienelactone hydrolase  22.99 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0141  putative secreted protein  27.62 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.402185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0150  putative secreted protein  27.62 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0541  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  23.3 
 
 		 518 aa  58.5  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.429802  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02988  hypothetical protein  29.63 
 
 		 112 aa  58.5  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1187  dienelactone hydrolase  22.09 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  25.66 
 
 		 259 aa  57  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0151  putative secreted protein  34.41 
 
 		 331 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0155783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0517  putative secreted protein  25.52 
 
 		 332 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0096  hydrolase  24.14 
 
 		 517 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0994  hypothetical protein  24.47 
 
 		 460 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  26.59 
 
 		 281 aa  50.8  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4315  hypothetical protein  24.91 
 
 		 460 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  25.94 
 
 		 302 aa  50.4  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1866  hypothetical protein  27.17 
 
 		 362 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  31.75 
 
 		 246 aa  48.9  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1730  hypothetical protein  27.17 
 
 		 362 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6266  peptidase S15  25.1 
 
 		 465 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0476291  normal  0.558827 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1904  hypothetical protein  26.95 
 
 		 460 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1953  hypothetical protein  25.08 
 
 		 460 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1682  hydrolase  26.95 
 
 		 460 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.35711  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1708  hydrolase  26.95 
 
 		 460 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1982  hypothetical protein  26.56 
 
 		 460 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.900389  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1948  putative lipoprotein  28.89 
 
 		 473 aa  47  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2409  hydrolase, alpha/beta fold family  29.07 
 
 		 343 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2164  alpha/beta hydrolase  29.07 
 
 		 343 aa  46.2  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.808057  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  32.47 
 
 		 260 aa  46.2  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20570  alpha/beta hydrolase fold protein  29.69 
 
 		 363 aa  45.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  25.47 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  26.51 
 
 		 397 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2237  hypothetical protein  24.52 
 
 		 269 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0117  alpha/beta hydrolase  30.99 
 
 		 276 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0807  hypothetical protein  31.53 
 
 		 277 aa  44.3  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.552448  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2226  alpha/beta fold family hydrolase  28.49 
 
 		 343 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519915  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2392  alpha/beta fold family hydrolase  28.49 
 
 		 343 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0864957  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0470  hypothetical protein  41.25 
 
 		 294 aa  43.5  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.739112 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2039  alpha/beta hydrolase fold protein  25.45 
 
 		 316 aa  43.5  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4242  hypothetical protein  31.54 
 
 		 306 aa  43.1  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00328451 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2148  alpha/beta fold family hydrolase  27.33 
 
 		 343 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.014973  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>