73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5534 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5534  hypothetical protein  100 
 
 
390 aa  773    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.82646  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3329  hypothetical protein  31.64 
 
 
362 aa  158  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0131  putative secreted protein  29.18 
 
 
337 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343092  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0150  putative secreted protein  29.44 
 
 
337 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0141  putative secreted protein  29.44 
 
 
337 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.402185  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1315  alpha/beta hydrolase fold  30.57 
 
 
320 aa  85.9  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0924774  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1717  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 
315 aa  84.7  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2298  alpha/beta hydrolase fold protein  27.96 
 
 
322 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.321032  decreased coverage  0.000193345 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1721  Alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 
317 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1829  alpha/beta fold family hydrolase  29.02 
 
 
319 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.174462  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3881  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 
320 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00418628  normal  0.248118 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1407  alpha/beta hydrolase fold  28.71 
 
 
320 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0821941  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0151  putative secreted protein  28.4 
 
 
331 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0155783  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6540  alpha/beta hydrolase fold  28.05 
 
 
302 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300513  normal  0.534481 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0517  putative secreted protein  27.51 
 
 
332 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42770  hypothetical protein  26.43 
 
 
327 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1437  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 
320 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.872938  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0162  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3592  hypothetical protein  26.67 
 
 
323 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2042  hypothetical protein  26.09 
 
 
343 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.429785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3346  hypothetical protein  43.27 
 
 
320 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1501  Alpha/beta hydrolase  28.8 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.568195  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3343  hypothetical protein  27.14 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.975652  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1881  lysophospholipase-like protein  27.33 
 
 
330 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.27985  normal  0.592044 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3018  hypothetical protein  42.31 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.277726  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3112  hypothetical protein  42.31 
 
 
337 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.200391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3372  hypothetical protein  41.35 
 
 
341 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3126  hypothetical protein  41.35 
 
 
342 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1262  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 
319 aa  66.2  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3348  hypothetical protein  25.78 
 
 
339 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.077916  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07480  hypothetical protein  25.53 
 
 
308 aa  66.2  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04770  alpha/beta hydrolase fold protein  25.15 
 
 
424 aa  65.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000317728  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1852  hypothetical protein  33.33 
 
 
343 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.613868  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3325  hypothetical protein  42.31 
 
 
317 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2263  alpha/beta hydrolase  27.39 
 
 
315 aa  64.3  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0877  hypothetical protein  25 
 
 
316 aa  62.4  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000690525  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1906  hypothetical protein  27.33 
 
 
434 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.189773  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1232  alpha/beta fold family hydrolase  34.11 
 
 
305 aa  61.6  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23740  hydrolase, alpha/beta fold family  27.36 
 
 
317 aa  61.6  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.582768  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1040  dienelactone hydrolase  28.26 
 
 
333 aa  60.1  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0299  hypothetical protein  39.29 
 
 
307 aa  57.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.261674 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2741  hypothetical protein  26.17 
 
 
498 aa  57.4  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1187  dienelactone hydrolase  27.34 
 
 
333 aa  56.6  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6145  peptidase S15  32.69 
 
 
380 aa  56.6  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000966122  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5342  hypothetical protein  30.13 
 
 
423 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.764052  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3539  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 
309 aa  54.3  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5497  putative hydrolase  26.28 
 
 
460 aa  53.9  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.134483 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2030  hypothetical protein  27.46 
 
 
328 aa  53.5  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.258009 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1419  hypothetical protein  27.46 
 
 
328 aa  53.1  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.692935  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2249  peptidase S15  26.67 
 
 
474 aa  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000310265  normal  0.111012 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1043  hydrolase  31.33 
 
 
337 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.374742  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2905  putative hydrolase  30.71 
 
 
512 aa  51.2  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.212149  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2079  putative hydrolase  30.83 
 
 
512 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  37.96 
 
 
259 aa  49.7  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0501  hypothetical protein  23.1 
 
 
436 aa  48.9  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.672777  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3161  putative hydrolase  31.37 
 
 
512 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4544  hypothetical protein  33.96 
 
 
490 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0186679  normal  0.180104 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0096  hydrolase  32 
 
 
517 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0583  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  22.56 
 
 
412 aa  47.4  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0597  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  22.56 
 
 
412 aa  47.4  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.458805  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  31.75 
 
 
246 aa  46.6  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  34.29 
 
 
580 aa  45.8  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0541  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28.83 
 
 
518 aa  45.1  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.429802  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1620  hypothetical protein  26.5 
 
 
309 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0072  dienelactone hydrolase  31.91 
 
 
365 aa  44.3  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.885053  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  24.15 
 
 
374 aa  43.5  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0994  hypothetical protein  30.93 
 
 
460 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1904  hypothetical protein  29.59 
 
 
460 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1982  hypothetical protein  29.59 
 
 
460 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.900389  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1682  hydrolase  29.59 
 
 
460 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.35711  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1866  hypothetical protein  29.59 
 
 
362 aa  43.1  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1730  hypothetical protein  29.59 
 
 
362 aa  43.1  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1953  hypothetical protein  29.59 
 
 
460 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>