37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0141 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0131  putative secreted protein  97.92 
 
 
337 aa  662    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343092  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0150  putative secreted protein  100 
 
 
337 aa  672    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0141  putative secreted protein  100 
 
 
337 aa  672    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.402185  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0517  putative secreted protein  70.4 
 
 
332 aa  428  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0151  putative secreted protein  69.69 
 
 
331 aa  397  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0155783  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3329  hypothetical protein  32.66 
 
 
362 aa  123  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1315  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 
320 aa  87  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0924774  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1262  alpha/beta hydrolase fold  30.52 
 
 
319 aa  82.4  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42770  hypothetical protein  28.52 
 
 
327 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04770  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
424 aa  79.7  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000317728  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3592  hypothetical protein  28.52 
 
 
323 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23740  hydrolase, alpha/beta fold family  32.62 
 
 
317 aa  74.3  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.582768  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5534  hypothetical protein  26.84 
 
 
390 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.82646  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0162  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1721  Alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 
317 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1717  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 
315 aa  67  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1437  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 
320 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.872938  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1881  lysophospholipase-like protein  27.61 
 
 
330 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.27985  normal  0.592044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2298  alpha/beta hydrolase fold protein  25.68 
 
 
322 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.321032  decreased coverage  0.000193345 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3881  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 
320 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00418628  normal  0.248118 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1829  alpha/beta fold family hydrolase  28.74 
 
 
319 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.174462  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1407  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 
320 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0821941  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0299  hypothetical protein  28.83 
 
 
307 aa  60.5  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.261674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1906  hypothetical protein  31.09 
 
 
434 aa  57  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.189773  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2042  hypothetical protein  27.72 
 
 
343 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.429785  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0877  hypothetical protein  21.69 
 
 
316 aa  55.8  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000690525  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  28.13 
 
 
580 aa  54.7  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1852  hypothetical protein  26.28 
 
 
343 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.613868  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1232  alpha/beta fold family hydrolase  24.39 
 
 
305 aa  49.3  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6540  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 
302 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300513  normal  0.534481 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1419  hypothetical protein  25.1 
 
 
328 aa  47  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.692935  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  23.32 
 
 
442 aa  46.2  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2030  hypothetical protein  24.7 
 
 
328 aa  45.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.258009 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1501  Alpha/beta hydrolase  27.7 
 
 
302 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.568195  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0096  hydrolase  31.25 
 
 
517 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2263  alpha/beta hydrolase  26.53 
 
 
315 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2203  hypothetical protein  32.88 
 
 
281 aa  43.1  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.629011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>