More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2478 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  100 
 
 		 442 aa  900    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  43.02 
 
 		 580 aa  319  7.999999999999999e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  45.58 
 
 		 374 aa  311  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2249  peptidase S15  39.41 
 
 		 474 aa  296  4e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000310265  normal  0.111012 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6266  peptidase S15  34.83 
 
 		 465 aa  251  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0476291  normal  0.558827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6145  peptidase S15  37.76 
 
 		 380 aa  236  9e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000966122  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1948  putative lipoprotein  37 
 
 		 473 aa  235  1.0000000000000001e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0501  hypothetical protein  30.19 
 
 		 436 aa  126  6e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.672777  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4484  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  29.32 
 
 		 477 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.061544  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3126  hypothetical protein  28.62 
 
 		 342 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3372  hypothetical protein  28.62 
 
 		 341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3346  hypothetical protein  27.86 
 
 		 320 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3112  hypothetical protein  27.06 
 
 		 337 aa  117  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.200391  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3343  hypothetical protein  27.83 
 
 		 337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.975652  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3325  hypothetical protein  27.05 
 
 		 317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3348  hypothetical protein  27.33 
 
 		 339 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.077916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3018  hypothetical protein  26.85 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.277726  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1620  hypothetical protein  27.19 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3539  alpha/beta hydrolase fold protein  32.51 
 
 		 309 aa  109  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0691  hypothetical protein  29.2 
 
 		 319 aa  104  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2741  hypothetical protein  27.59 
 
 		 498 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2905  putative hydrolase  27.67 
 
 		 512 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.212149  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3161  putative hydrolase  27.71 
 
 		 512 aa  102  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2079  putative hydrolase  27.71 
 
 		 512 aa  101  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4544  hypothetical protein  26.06 
 
 		 490 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0186679  normal  0.180104 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1262  alpha/beta hydrolase fold  31.02 
 
 		 319 aa  99  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1906  hypothetical protein  28.65 
 
 		 434 aa  97.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.189773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0162  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 		 321 aa  96.7  7e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3820  PGAP1 family protein  27.9 
 
 		 485 aa  96.7  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.233276  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6453  hypothetical protein  27.62 
 
 		 496 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.73648  normal  0.0509113 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04770  alpha/beta hydrolase fold protein  26.6 
 
 		 424 aa  95.1  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000317728  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0541  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28.42 
 
 		 518 aa  87  6e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.429802  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2168  hypothetical protein  25.71 
 
 		 498 aa  86.7  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.79256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1717  alpha/beta hydrolase fold  25.76 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5342  hypothetical protein  24.78 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.764052  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3783  hypothetical protein  24.75 
 
 		 354 aa  77  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1501  Alpha/beta hydrolase  25.83 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.568195  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0096  hydrolase  32.24 
 
 		 517 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1130  hypothetical protein  26.21 
 
 		 400 aa  76.3  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6540  alpha/beta hydrolase fold  25.32 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300513  normal  0.534481 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1475  hydrolase family protein  28.7 
 
 		 335 aa  75.5  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1232  alpha/beta fold family hydrolase  25.71 
 
 		 305 aa  75.9  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0583  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28.79 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5497  putative hydrolase  24.75 
 
 		 460 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.134483 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0597  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28.79 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.458805  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1881  lysophospholipase-like protein  26.64 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.27985  normal  0.592044 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1315  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0924774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2030  hypothetical protein  24.3 
 
 		 328 aa  72  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.258009 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42770  hypothetical protein  24.37 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1419  hypothetical protein  24.02 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.692935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  31.21 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1187  dienelactone hydrolase  24.84 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3509  Dienelactone hydrolase  25.86 
 
 		 438 aa  69.7  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1004  prolyl oligopeptidase family protein  40.21 
 
 		 759 aa  68.9  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0877  hypothetical protein  26.71 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000690525  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  26.82 
 
 		 259 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23740  hydrolase, alpha/beta fold family  27.27 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.582768  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0299  hypothetical protein  35.11 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.261674 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3592  hypothetical protein  23.25 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07480  hypothetical protein  22.67 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2042  hypothetical protein  24.67 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.429785  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.19 
 
 		 662 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0293  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  32.21 
 
 		 321 aa  62.8  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.744416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1721  Alpha/beta hydrolase fold  22.4 
 
 		 317 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0373  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.71 
 
 		 662 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.265704  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0384  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.19 
 
 		 662 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.290431  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1702  hypothetical protein  24.33 
 
 		 334 aa  62.8  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.412108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0994  hypothetical protein  23.28 
 
 		 460 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1040  dienelactone hydrolase  24.17 
 
 		 333 aa  62.4  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1852  hypothetical protein  22.81 
 
 		 343 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.613868  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1953  hypothetical protein  22.45 
 
 		 460 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  34.17 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2298  alpha/beta hydrolase fold protein  25.07 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.321032  decreased coverage  0.000193345 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1829  alpha/beta fold family hydrolase  24.58 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.174462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3881  alpha/beta hydrolase fold  24.58 
 
 		 320 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00418628  normal  0.248118 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0398  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.71 
 
 		 662 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000316056 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0890  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  23.86 
 
 		 357 aa  59.7  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.712139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1437  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 		 320 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.872938  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  34.07 
 
 		 258 aa  58.9  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0642  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.68 
 
 		 826 aa  58.2  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.224163  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.07 
 
 		 660 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3700  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.57 
 
 		 826 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000363184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3757  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.57 
 
 		 826 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000738695  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0568  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.57 
 
 		 823 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000257692  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3832  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.98 
 
 		 659 aa  57.8  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  29.08 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3883  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.57 
 
 		 826 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0168383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  27.4 
 
 		 292 aa  57  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2263  alpha/beta hydrolase  25.1 
 
 		 315 aa  57  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1904  hypothetical protein  27.05 
 
 		 460 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1682  hydrolase  27.05 
 
 		 460 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.35711  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1708  hydrolase  27.05 
 
 		 460 aa  56.6  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4315  hypothetical protein  26.29 
 
 		 460 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8503  putative lipoprotein  28.86 
 
 		 276 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1407  alpha/beta hydrolase fold  24.35 
 
 		 320 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0821941  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1730  hypothetical protein  27.32 
 
 		 362 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  24.82 
 
 		 286 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3412  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  32.33 
 
 		 381 aa  55.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0456561 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1866  hypothetical protein  27.32 
 
 		 362 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  24.82 
 
 		 286 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>