97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2298 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2298  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
322 aa  652    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.321032  decreased coverage  0.000193345 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0162  alpha/beta hydrolase fold  45.22 
 
 
321 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04770  alpha/beta hydrolase fold protein  49.47 
 
 
424 aa  252  6e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000317728  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1717  alpha/beta hydrolase fold  44.73 
 
 
315 aa  249  5e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23740  hydrolase, alpha/beta fold family  43.04 
 
 
317 aa  229  6e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.582768  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3592  hypothetical protein  42.96 
 
 
323 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1437  alpha/beta hydrolase fold  41.51 
 
 
320 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.872938  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1407  alpha/beta hydrolase fold  41.1 
 
 
320 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0821941  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1232  alpha/beta fold family hydrolase  40.95 
 
 
305 aa  217  2e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3881  alpha/beta hydrolase fold  41.1 
 
 
320 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00418628  normal  0.248118 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42770  hypothetical protein  42.61 
 
 
327 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1829  alpha/beta fold family hydrolase  41.1 
 
 
319 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.174462  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1721  Alpha/beta hydrolase fold  41.4 
 
 
317 aa  212  7e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1881  lysophospholipase-like protein  41.23 
 
 
330 aa  209  6e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.27985  normal  0.592044 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0877  hypothetical protein  40.4 
 
 
316 aa  202  5e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000690525  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1262  alpha/beta hydrolase fold  42.62 
 
 
319 aa  201  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1852  hypothetical protein  41.55 
 
 
343 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.613868  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2042  hypothetical protein  39.81 
 
 
343 aa  196  6e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.429785  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1501  Alpha/beta hydrolase  39.4 
 
 
302 aa  189  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.568195  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6540  alpha/beta hydrolase fold  39.2 
 
 
302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300513  normal  0.534481 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07480  hypothetical protein  39.65 
 
 
308 aa  181  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1315  alpha/beta hydrolase fold  38.11 
 
 
320 aa  176  4e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0924774  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0299  hypothetical protein  37.74 
 
 
307 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.261674 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2263  alpha/beta hydrolase  34.38 
 
 
315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3329  hypothetical protein  29.02 
 
 
362 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0583  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  32.03 
 
 
412 aa  95.9  8e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0597  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  32.03 
 
 
412 aa  95.9  8e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.458805  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  32.33 
 
 
374 aa  87.8  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  26.98 
 
 
580 aa  88.2  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2079  putative hydrolase  28.93 
 
 
512 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3018  hypothetical protein  27.9 
 
 
338 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.277726  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3348  hypothetical protein  27.4 
 
 
339 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.077916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3112  hypothetical protein  26.92 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.200391  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3343  hypothetical protein  27.27 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.975652  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1419  hypothetical protein  25.88 
 
 
328 aa  83.2  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.692935  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3346  hypothetical protein  27.27 
 
 
320 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2030  hypothetical protein  26.05 
 
 
328 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.258009 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3126  hypothetical protein  26.33 
 
 
342 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3372  hypothetical protein  26.33 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2905  putative hydrolase  27.19 
 
 
512 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.212149  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3325  hypothetical protein  26.95 
 
 
317 aa  79  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2741  hypothetical protein  26.89 
 
 
498 aa  78.6  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3820  PGAP1 family protein  31.62 
 
 
485 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.233276  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3161  putative hydrolase  28.29 
 
 
512 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1620  hypothetical protein  26.79 
 
 
309 aa  77  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0691  hypothetical protein  25.47 
 
 
319 aa  76.6  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1130  hypothetical protein  32.02 
 
 
400 aa  76.3  0.0000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2249  peptidase S15  29.04 
 
 
474 aa  75.1  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000310265  normal  0.111012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5534  hypothetical protein  26.91 
 
 
390 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.82646  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0501  hypothetical protein  28.85 
 
 
436 aa  73.2  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.672777  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3539  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5497  putative hydrolase  29.51 
 
 
460 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.134483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0131  putative secreted protein  25.68 
 
 
337 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343092  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0151  putative secreted protein  27.27 
 
 
331 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0155783  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0517  putative secreted protein  27.74 
 
 
332 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1948  putative lipoprotein  31.32 
 
 
473 aa  62  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0141  putative secreted protein  25.68 
 
 
337 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.402185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0150  putative secreted protein  25.68 
 
 
337 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0096  hydrolase  27.56 
 
 
517 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  24.93 
 
 
442 aa  60.1  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1730  hypothetical protein  27.43 
 
 
362 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1866  hypothetical protein  27.43 
 
 
362 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1904  hypothetical protein  28.87 
 
 
460 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1682  hydrolase  28.87 
 
 
460 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.35711  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1953  hypothetical protein  28.22 
 
 
460 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1708  hydrolase  28.87 
 
 
460 aa  57.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6145  peptidase S15  32.79 
 
 
380 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000966122  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1982  hypothetical protein  27.73 
 
 
460 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.900389  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0541  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28.37 
 
 
518 aa  56.2  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.429802  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6266  peptidase S15  21.6 
 
 
465 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0476291  normal  0.558827 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1187  dienelactone hydrolase  25.09 
 
 
333 aa  54.7  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3509  Dienelactone hydrolase  27.99 
 
 
438 aa  54.3  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4315  hypothetical protein  27.98 
 
 
460 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0994  hypothetical protein  28.03 
 
 
460 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02988  hypothetical protein  28.85 
 
 
112 aa  52.8  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1906  hypothetical protein  25.6 
 
 
434 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.189773  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  26.14 
 
 
259 aa  50.8  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  23 
 
 
274 aa  49.7  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  26.18 
 
 
277 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4544  hypothetical protein  27.36 
 
 
490 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0186679  normal  0.180104 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0807  hypothetical protein  37.68 
 
 
277 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.552448  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1040  dienelactone hydrolase  29.03 
 
 
333 aa  47.4  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  24.78 
 
 
277 aa  46.6  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3398  Alpha/beta hydrolase fold  24.57 
 
 
255 aa  46.6  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  26.15 
 
 
276 aa  46.6  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0367  alpha/beta hydrolase fold  23.95 
 
 
306 aa  46.2  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00100514  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0632  putative hydrolse  33.82 
 
 
273 aa  45.8  0.0009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0784217  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2658  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.42 
 
 
642 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55127  normal  0.367777 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3714  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.31 
 
 
650 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  26.13 
 
 
283 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0051  lysophospholipase  29.27 
 
 
333 aa  43.5  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.18197 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1200  alpha/beta hydrolase fold  25.73 
 
 
364 aa  43.5  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  24.38 
 
 
425 aa  43.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 
283 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 
273 aa  42.7  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  25.49 
 
 
311 aa  42.7  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  26.03 
 
 
396 aa  42.4  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>