95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1407 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1407  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 320 aa  631  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0821941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3881  alpha/beta hydrolase fold  96.88 
 
 		 320 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00418628  normal  0.248118 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1829  alpha/beta fold family hydrolase  96.87 
 
 		 319 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.174462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1437  alpha/beta hydrolase fold  91.88 
 
 		 320 aa  588  1e-167  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.872938  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1721  Alpha/beta hydrolase fold  64.67 
 
 		 317 aa  391  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1852  hypothetical protein  64.98 
 
 		 343 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.613868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23740  hydrolase, alpha/beta fold family  63.9 
 
 		 317 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.582768  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2042  hypothetical protein  63.02 
 
 		 343 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.429785  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1881  lysophospholipase-like protein  63.04 
 
 		 330 aa  354  8.999999999999999e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.27985  normal  0.592044 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3592  hypothetical protein  62.62 
 
 		 323 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42770  hypothetical protein  62.3 
 
 		 327 aa  352  4e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0162  alpha/beta hydrolase fold  45.69 
 
 		 321 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04770  alpha/beta hydrolase fold protein  43.15 
 
 		 424 aa  231  9e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000317728  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1717  alpha/beta hydrolase fold  39.1 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1262  alpha/beta hydrolase fold  46.08 
 
 		 319 aa  221  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2298  alpha/beta hydrolase fold protein  41.18 
 
 		 322 aa  212  5.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.321032  decreased coverage  0.000193345 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1232  alpha/beta fold family hydrolase  38.54 
 
 		 305 aa  208  1e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0877  hypothetical protein  39.01 
 
 		 316 aa  204  1e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000690525  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1315  alpha/beta hydrolase fold  43.2 
 
 		 320 aa  194  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0924774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1501  Alpha/beta hydrolase  41.81 
 
 		 302 aa  186  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.568195  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6540  alpha/beta hydrolase fold  39.73 
 
 		 302 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300513  normal  0.534481 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07480  hypothetical protein  30.22 
 
 		 308 aa  135  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0299  hypothetical protein  35.48 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.261674 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2263  alpha/beta hydrolase  33.87 
 
 		 315 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3018  hypothetical protein  25.08 
 
 		 338 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.277726  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3348  hypothetical protein  25.08 
 
 		 339 aa  89  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.077916  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3329  hypothetical protein  27.22 
 
 		 362 aa  87.4  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3372  hypothetical protein  24.5 
 
 		 341 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3126  hypothetical protein  24.5 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1620  hypothetical protein  31.14 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1130  hypothetical protein  28.74 
 
 		 400 aa  83.2  0.000000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3325  hypothetical protein  25.67 
 
 		 317 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3112  hypothetical protein  24.83 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.200391  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3346  hypothetical protein  25.84 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3343  hypothetical protein  25.56 
 
 		 337 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.975652  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0583  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  27.13 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0597  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  27.13 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.458805  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0501  hypothetical protein  23.47 
 
 		 436 aa  76.3  0.0000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.672777  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1906  hypothetical protein  28.63 
 
 		 434 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.189773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  27.57 
 
 		 580 aa  73.2  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3820  PGAP1 family protein  26.72 
 
 		 485 aa  72.8  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.233276  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3539  alpha/beta hydrolase fold protein  31.62 
 
 		 309 aa  72.4  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02988  hypothetical protein  31.48 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0691  hypothetical protein  27.92 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2741  hypothetical protein  29.34 
 
 		 498 aa  65.1  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1419  hypothetical protein  27.53 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.692935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5342  hypothetical protein  29.96 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.764052  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0151  putative secreted protein  34.83 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0155783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2030  hypothetical protein  27.13 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.258009 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3509  Dienelactone hydrolase  29.55 
 
 		 438 aa  62  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2249  peptidase S15  27.38 
 
 		 474 aa  61.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000310265  normal  0.111012 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0131  putative secreted protein  28.06 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343092  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0141  putative secreted protein  28.35 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.402185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0150  putative secreted protein  28.35 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5534  hypothetical protein  36.54 
 
 		 390 aa  59.3  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.82646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  25.17 
 
 		 374 aa  59.3  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6145  peptidase S15  21.09 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000966122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0517  putative secreted protein  40 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5497  putative hydrolase  25.1 
 
 		 460 aa  56.6  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.134483 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  24.35 
 
 		 442 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20570  alpha/beta hydrolase fold protein  23.31 
 
 		 363 aa  53.1  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  24.14 
 
 		 259 aa  49.7  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  31.55 
 
 		 397 aa  49.3  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0541  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  21.53 
 
 		 518 aa  48.9  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.429802  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  23.41 
 
 		 281 aa  47.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01668  alpha/beta hydrolase  23.42 
 
 		 245 aa  48.1  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367344  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2079  putative hydrolase  24.18 
 
 		 512 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0807  hypothetical protein  32.14 
 
 		 277 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.552448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  24.51 
 
 		 260 aa  47.4  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1040  dienelactone hydrolase  25.26 
 
 		 333 aa  47.8  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6266  peptidase S15  20.38 
 
 		 465 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0476291  normal  0.558827 
 
 
-
 
NC_002950  PG1948  putative lipoprotein  31.51 
 
 		 473 aa  47.4  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1187  dienelactone hydrolase  26.48 
 
 		 333 aa  47  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0096  hydrolase  21.03 
 
 		 517 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1065  alpha/beta hydrolase fold  41.67 
 
 		 275 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.289777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1252  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  29.15 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696042  normal  0.518884 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2905  putative hydrolase  24.4 
 
 		 512 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.212149  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2137  alpha/beta hydrolase fold protein  44.23 
 
 		 363 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198184  normal  0.0171478 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3161  putative hydrolase  23.31 
 
 		 512 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  27.33 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5870  alpha/beta hydrolase-like protein  32.14 
 
 		 305 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4315  hypothetical protein  24.7 
 
 		 460 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2422  alpha/beta fold family hydrolase  22.52 
 
 		 343 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.157324  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3398  Alpha/beta hydrolase fold  29.22 
 
 		 255 aa  43.5  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0147  alpha/beta hydrolase  35.82 
 
 		 282 aa  43.1  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 260 aa  43.1  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1147  alpha/beta hydrolase fold  25.11 
 
 		 369 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255082  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0994  hypothetical protein  24.19 
 
 		 460 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1164  alpha/beta hydrolase fold  25.11 
 
 		 369 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.428268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1174  alpha/beta hydrolase fold  25.11 
 
 		 369 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326598  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2039  alpha/beta hydrolase fold protein  26.79 
 
 		 316 aa  42.7  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0973  alpha/beta hydrolase fold  27.45 
 
 		 347 aa  42.7  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000354687  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3473  proline iminopeptidase  51.22 
 
 		 329 aa  42.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.598272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1982  hypothetical protein  23.9 
 
 		 460 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.900389  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2598  KR domain protein  28.48 
 
 		 7149 aa  42.4  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>