More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3398 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3398  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 255 aa  522  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3406  putative hydrolase-related protein  56 
 
 		 266 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0882  hypothetical protein  41.2 
 
 		 276 aa  191  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1623  alpha/beta hydrolase fold  39.38 
 
 		 280 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2862  Alpha/beta hydrolase fold  48.28 
 
 		 271 aa  186  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2830  Alpha/beta hydrolase fold  43.29 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1544  alpha/beta hydrolase fold protein  42.34 
 
 		 284 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2949  alpha/beta hydrolase fold  38.02 
 
 		 271 aa  180  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.545682  normal  0.28971 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  41.83 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3654  alpha/beta hydrolase fold  36.96 
 
 		 272 aa  175  5e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2701  alpha/beta hydrolase fold  40.24 
 
 		 284 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4372  alpha/beta family hydrolase  39.57 
 
 		 270 aa  172  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.686172 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1418  putative lactonase (box pathway)  40.32 
 
 		 282 aa  169  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.104299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1328  Alpha/beta hydrolase fold  37.4 
 
 		 271 aa  168  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0897  putative lactonase (box pathway)  40.43 
 
 		 287 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0425746  normal  0.277892 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4645  alpha/beta hydrolase fold  39.47 
 
 		 265 aa  165  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.917363  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3718  alpha/beta hydrolase fold  39.47 
 
 		 265 aa  165  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0380543 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3803  alpha/beta hydrolase fold  39.04 
 
 		 265 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.695303 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4220  alpha/beta hydrolase fold protein  38.79 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4108  alpha/beta hydrolase fold  38.79 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.24138 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0215  alpha/beta hydrolase  36.08 
 
 		 271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.296554  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2393  Alpha/beta hydrolase  38.6 
 
 		 286 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.590588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4734  alpha/beta hydrolase fold  41.8 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.590817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4655  Alpha/beta hydrolase  38.06 
 
 		 273 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.875827 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0670  alpha/beta hydrolase  44.73 
 
 		 258 aa  160  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5458  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 285 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5009  alpha/beta hydrolase fold  38.16 
 
 		 288 aa  159  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.97318  normal  0.569979 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3602  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 280 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.949623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0879  alpha/beta hydrolase fold  37.75 
 
 		 273 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.46004  normal  0.445527 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4964  alpha/beta hydrolase fold  36.6 
 
 		 275 aa  155  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1225  alpha/beta hydrolase fold  35.18 
 
 		 271 aa  155  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16662  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3026  hypothetical protein  36.44 
 
 		 277 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0742  alpha/beta hydrolase fold  37.25 
 
 		 273 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3299  alpha/beta hydrolase fold  33.47 
 
 		 259 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0322  lactonase  35.78 
 
 		 277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1771  alpha/beta hydrolase fold protein  37.71 
 
 		 279 aa  146  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0748  alpha/beta family hydrolase  39.13 
 
 		 267 aa  145  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26310  Alpha/beta hydrolase fold protein  36.84 
 
 		 275 aa  139  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.201822  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0377  alpha/beta fold family hydrolase  36.17 
 
 		 277 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0554  lactonase  36.17 
 
 		 390 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0364  alpha/beta fold family hydrolase  36.17 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4621  alpha/beta hydrolase fold  37.39 
 
 		 285 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1010  alpha/beta family hydrolase  34.15 
 
 		 176 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  27.55 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  27.76 
 
 		 387 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2777  proline-specific peptidase  26.37 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159674  decreased coverage  0.000853285 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  29.23 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  24.39 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  28.86 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  27.35 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2154  alpha/beta hydrolase fold protein  24.9 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016859 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  26.16 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6377  proline-specific peptidase  24.73 
 
 		 300 aa  58.9  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.843826  normal  0.494551 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1465  alpha/beta hydrolase fold protein  27.4 
 
 		 289 aa  58.9  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.647363  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  24.59 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29710  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  25.56 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.519861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  26.98 
 
 		 425 aa  57.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0843  alpha/beta hydrolase fold protein  22.97 
 
 		 333 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  24.45 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1136  alpha/beta hydrolase fold  24.49 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2379  alpha/beta hydrolase fold protein  26.17 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.173076  normal  0.904893 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4540  proline iminopeptidase, putative  24.25 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999347  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  25.46 
 
 		 275 aa  55.5  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  25.42 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  26.97 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2699  alpha/beta hydrolase  24.57 
 
 		 299 aa  54.3  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  25.59 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0956  hypothetical protein  30 
 
 		 249 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4804  alpha/beta hydrolase fold  23.43 
 
 		 325 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  26.85 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5402  alpha/beta hydrolase fold protein  25.71 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734063  normal  0.0675186 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 		 280 aa  53.9  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  25.61 
 
 		 278 aa  53.1  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5637  hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily)  24.03 
 
 		 297 aa  53.1  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0678785  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  21.23 
 
 		 331 aa  53.1  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1074  alpha/beta hydrolase fold  22.7 
 
 		 313 aa  53.1  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.605092 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0858  proline-specific peptidase  22.26 
 
 		 303 aa  52.8  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  30.57 
 
 		 282 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  30.57 
 
 		 282 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31408  predicted protein  37.08 
 
 		 386 aa  52.8  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  40.68 
 
 		 297 aa  52.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  24.15 
 
 		 271 aa  52.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  21.51 
 
 		 240 aa  52.4  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  23.81 
 
 		 305 aa  52.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.444129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 		 266 aa  52.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1797  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 		 280 aa  52.4  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.287372  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2178  hydrolase, putative  27.5 
 
 		 233 aa  52  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  25.21 
 
 		 285 aa  52.4  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1880  alpha/beta hydrolase fold  24.58 
 
 		 258 aa  52.4  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000336147  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6197  proline-specific peptidase  23.05 
 
 		 300 aa  52  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.941686 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1913  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 257 aa  52  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000359899  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2090  putative hydrolase  27.5 
 
 		 233 aa  52  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  24.77 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>