More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1623 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1623  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
280 aa  576  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2949  alpha/beta hydrolase fold  67.67 
 
 
271 aa  380  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.545682  normal  0.28971 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3654  alpha/beta hydrolase fold  67.3 
 
 
272 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0215  alpha/beta hydrolase  66.92 
 
 
271 aa  365  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.296554  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0882  hypothetical protein  65.89 
 
 
276 aa  355  5.999999999999999e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  64.48 
 
 
267 aa  349  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1328  Alpha/beta hydrolase fold  60.98 
 
 
271 aa  341  8e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1225  alpha/beta hydrolase fold  59.85 
 
 
271 aa  330  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16662  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0897  putative lactonase (box pathway)  59.04 
 
 
287 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0425746  normal  0.277892 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1544  alpha/beta hydrolase fold protein  55.16 
 
 
284 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1418  putative lactonase (box pathway)  57.83 
 
 
282 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.104299  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2701  alpha/beta hydrolase fold  54.55 
 
 
284 aa  300  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832615  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2830  Alpha/beta hydrolase fold  48.37 
 
 
257 aa  236  4e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0879  alpha/beta hydrolase fold  44.53 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.46004  normal  0.445527 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0742  alpha/beta hydrolase fold  45.16 
 
 
273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4655  Alpha/beta hydrolase  42.91 
 
 
273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.875827 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4372  alpha/beta family hydrolase  48.31 
 
 
270 aa  194  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.686172 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0748  alpha/beta family hydrolase  41.38 
 
 
267 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3026  hypothetical protein  42.42 
 
 
277 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3398  Alpha/beta hydrolase fold  39.38 
 
 
255 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4734  alpha/beta hydrolase fold  41.7 
 
 
264 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.590817  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3406  putative hydrolase-related protein  42.17 
 
 
266 aa  176  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0670  alpha/beta hydrolase  39.36 
 
 
258 aa  167  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2862  Alpha/beta hydrolase fold  40.15 
 
 
271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2393  Alpha/beta hydrolase  38.26 
 
 
286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.590588  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4220  alpha/beta hydrolase fold protein  35.34 
 
 
270 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4108  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 
270 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.24138 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3803  alpha/beta hydrolase fold  36.68 
 
 
265 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.695303 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4645  alpha/beta hydrolase fold  36.24 
 
 
265 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.917363  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3718  alpha/beta hydrolase fold  36.24 
 
 
265 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0380543 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5009  alpha/beta hydrolase fold  35.22 
 
 
288 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.97318  normal  0.569979 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4964  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 
275 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102964  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26310  Alpha/beta hydrolase fold protein  34.32 
 
 
275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.201822  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0377  alpha/beta fold family hydrolase  35.86 
 
 
277 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4621  alpha/beta hydrolase fold  38.84 
 
 
285 aa  136  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0554  lactonase  35.44 
 
 
390 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3602  alpha/beta hydrolase fold  36.32 
 
 
280 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.949623  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5458  alpha/beta hydrolase fold  36.32 
 
 
285 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0364  alpha/beta fold family hydrolase  35.44 
 
 
277 aa  135  9e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1771  alpha/beta hydrolase fold protein  35.65 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1010  alpha/beta family hydrolase  43.56 
 
 
176 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3299  alpha/beta hydrolase fold  33.47 
 
 
259 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0322  lactonase  32.77 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 
296 aa  85.5  9e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  23.19 
 
 
295 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
302 aa  74.3  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
297 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  24.06 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1136  alpha/beta hydrolase fold  24.66 
 
 
308 aa  70.1  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 
271 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2144  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412012  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  22.43 
 
 
298 aa  67  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  23.69 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  27.95 
 
 
283 aa  65.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1942  alpha/beta hydrolase fold  27.06 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000178977  hitchhiker  0.00172948 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  24.8 
 
 
257 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4513  hypothetical protein  27.73 
 
 
258 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  24.8 
 
 
257 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  24.8 
 
 
257 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2227  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 
258 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000690683  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2033  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
266 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000295645  hitchhiker  0.000143979 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2194  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
258 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000635452  unclonable  0.000004336 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2136  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
266 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000406984  decreased coverage  0.00000741326 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  30.74 
 
 
279 aa  63.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  24.33 
 
 
296 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
270 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  24.69 
 
 
258 aa  63.5  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4401  alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 
275 aa  63.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  27.65 
 
 
286 aa  62.8  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  32 
 
 
282 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  32 
 
 
282 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  24.33 
 
 
296 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  24.33 
 
 
296 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 
270 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 
270 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  27.27 
 
 
270 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  24.33 
 
 
296 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2240  alpha/beta hydrolase fold protein  26.95 
 
 
258 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000309374  hitchhiker  0.000000000781643 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 
267 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 
272 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1990  alpha/beta hydrolase fold protein  25.51 
 
 
308 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000207277 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  28.81 
 
 
285 aa  59.7  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  29 
 
 
302 aa  59.7  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 
264 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1253  alpha/beta hydrolase fold  23.41 
 
 
336 aa  58.9  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  24.34 
 
 
289 aa  58.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  27.2 
 
 
276 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3121  hypothetical protein  23.02 
 
 
259 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000331929  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  22.98 
 
 
257 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5637  hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily)  23.91 
 
 
297 aa  57.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0678785  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5402  alpha/beta hydrolase fold protein  23.08 
 
 
234 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734063  normal  0.0675186 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  27.07 
 
 
263 aa  57.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  27.06 
 
 
270 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1880  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 
258 aa  56.6  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000336147  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1210  hypothetical protein  22.66 
 
 
259 aa  57  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000115762  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4466  alpha/beta hydrolase fold protein  27.48 
 
 
290 aa  56.6  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.911408  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2933  alpha/beta hydrolase fold protein  24.8 
 
 
260 aa  56.6  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  hitchhiker  0.000486055 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  24.34 
 
 
278 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 
283 aa  56.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  27.88 
 
 
268 aa  56.2  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>