More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2830 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2830  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
257 aa  528  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0882  hypothetical protein  49.8 
 
 
276 aa  239  4e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1328  Alpha/beta hydrolase fold  49.6 
 
 
271 aa  236  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1623  alpha/beta hydrolase fold  48.37 
 
 
280 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  50.43 
 
 
267 aa  229  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2949  alpha/beta hydrolase fold  46.18 
 
 
271 aa  228  9e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.545682  normal  0.28971 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1225  alpha/beta hydrolase fold  45.95 
 
 
271 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16662  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2701  alpha/beta hydrolase fold  47.62 
 
 
284 aa  226  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832615  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0879  alpha/beta hydrolase fold  46.61 
 
 
273 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.46004  normal  0.445527 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3654  alpha/beta hydrolase fold  48.1 
 
 
272 aa  223  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1418  putative lactonase (box pathway)  47.58 
 
 
282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.104299  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0215  alpha/beta hydrolase  45.6 
 
 
271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.296554  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1544  alpha/beta hydrolase fold protein  44.53 
 
 
284 aa  218  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4655  Alpha/beta hydrolase  45.02 
 
 
273 aa  214  7e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.875827 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0897  putative lactonase (box pathway)  46.81 
 
 
287 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0425746  normal  0.277892 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0742  alpha/beta hydrolase fold  42.8 
 
 
273 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0748  alpha/beta family hydrolase  42.57 
 
 
267 aa  201  9e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3406  putative hydrolase-related protein  46.52 
 
 
266 aa  195  6e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3026  hypothetical protein  45.89 
 
 
277 aa  195  6e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4372  alpha/beta family hydrolase  44.35 
 
 
270 aa  195  7e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.686172 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2862  Alpha/beta hydrolase fold  42.57 
 
 
271 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3398  Alpha/beta hydrolase fold  43.29 
 
 
255 aa  180  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4734  alpha/beta hydrolase fold  40.49 
 
 
264 aa  180  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.590817  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0670  alpha/beta hydrolase  42.97 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5009  alpha/beta hydrolase fold  41.48 
 
 
288 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.97318  normal  0.569979 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2393  Alpha/beta hydrolase  41.05 
 
 
286 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.590588  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4645  alpha/beta hydrolase fold  39.74 
 
 
265 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.917363  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3718  alpha/beta hydrolase fold  39.74 
 
 
265 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0380543 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3803  alpha/beta hydrolase fold  39.26 
 
 
265 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.695303 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4108  alpha/beta hydrolase fold  35.83 
 
 
270 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.24138 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4220  alpha/beta hydrolase fold protein  35.83 
 
 
270 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4964  alpha/beta hydrolase fold  38.43 
 
 
275 aa  162  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102964  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0322  lactonase  36.4 
 
 
277 aa  161  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26310  Alpha/beta hydrolase fold protein  38.27 
 
 
275 aa  159  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.201822  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3602  alpha/beta hydrolase fold  39.3 
 
 
280 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.949623  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5458  alpha/beta hydrolase fold  39.3 
 
 
285 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3299  alpha/beta hydrolase fold  37.02 
 
 
259 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0554  lactonase  37.28 
 
 
390 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0377  alpha/beta fold family hydrolase  37.12 
 
 
277 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0364  alpha/beta fold family hydrolase  37.12 
 
 
277 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1771  alpha/beta hydrolase fold protein  37.61 
 
 
279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1010  alpha/beta family hydrolase  43.64 
 
 
176 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4621  alpha/beta hydrolase fold  32.82 
 
 
285 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  26.41 
 
 
297 aa  93.6  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  23.78 
 
 
299 aa  75.9  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  24.65 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  24.9 
 
 
258 aa  74.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  23.94 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  29.31 
 
 
425 aa  72  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  27.95 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  23.49 
 
 
301 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  24.81 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 
312 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  25.53 
 
 
296 aa  66.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0978  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  28.86 
 
 
278 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  24.32 
 
 
296 aa  65.5  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  25.38 
 
 
286 aa  65.5  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  24.42 
 
 
296 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 
283 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  24.72 
 
 
296 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 
279 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  24.81 
 
 
312 aa  62.8  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2348  alpha/beta hydrolase fold protein  25.64 
 
 
275 aa  62.4  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  27.08 
 
 
270 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  27.88 
 
 
286 aa  62  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 
296 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
293 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4280  Alpha/beta hydrolase  26.83 
 
 
353 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1698  alpha/beta hydrolase fold  24.26 
 
 
397 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
285 aa  60.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 
267 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1144  alpha/beta hydrolase fold  25.44 
 
 
353 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  23.66 
 
 
295 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  27.85 
 
 
246 aa  60.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2137  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 
353 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.887771  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1168  alpha/beta hydrolase fold  25.44 
 
 
353 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  24.46 
 
 
279 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0689  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 
387 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4401  alpha/beta hydrolase fold  24.3 
 
 
275 aa  59.7  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  25.36 
 
 
312 aa  59.3  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
270 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6302  alpha/beta hydrolase fold  24.72 
 
 
266 aa  58.9  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  23.91 
 
 
282 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2132  hypothetical protein  24.89 
 
 
247 aa  58.2  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1796  alpha/beta hydrolase fold protein  25.26 
 
 
387 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.883295 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4279  alpha/beta hydrolase fold  25.75 
 
 
287 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52768  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  23.91 
 
 
282 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2800  alpha/beta fold family hydrolase  24.47 
 
 
404 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2740  alpha/beta fold family hydrolase  24.47 
 
 
404 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2856  alpha/beta fold family hydrolase  24.47 
 
 
441 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  24.51 
 
 
256 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.84 
 
 
374 aa  57.4  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1746  alpha/beta fold family hydrolase  24.47 
 
 
439 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.294927  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1050  alpha/beta hydrolase fold  24.74 
 
 
352 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  27.39 
 
 
279 aa  57.4  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  27.19 
 
 
270 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1047  alpha/beta hydrolase fold  24.13 
 
 
352 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0122  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 
268 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>