135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3406 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3406  putative hydrolase-related protein  100 
 
 		 266 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3398  Alpha/beta hydrolase fold  56 
 
 		 255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2862  Alpha/beta hydrolase fold  53.74 
 
 		 271 aa  211  7e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2830  Alpha/beta hydrolase fold  46.52 
 
 		 257 aa  195  6e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4372  alpha/beta family hydrolase  47.5 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.686172 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0882  hypothetical protein  45.26 
 
 		 276 aa  192  6e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2949  alpha/beta hydrolase fold  45.34 
 
 		 271 aa  191  8e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.545682  normal  0.28971 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3654  alpha/beta hydrolase fold  45.96 
 
 		 272 aa  185  8e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1544  alpha/beta hydrolase fold protein  45.99 
 
 		 284 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  41.95 
 
 		 267 aa  178  8e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0897  putative lactonase (box pathway)  44.77 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0425746  normal  0.277892 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0215  alpha/beta hydrolase  44.12 
 
 		 271 aa  176  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.296554  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1328  Alpha/beta hydrolase fold  41.8 
 
 		 271 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1623  alpha/beta hydrolase fold  42.17 
 
 		 280 aa  176  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4655  Alpha/beta hydrolase  44.21 
 
 		 273 aa  175  6e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.875827 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3803  alpha/beta hydrolase fold  41.77 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.695303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2393  Alpha/beta hydrolase  41.41 
 
 		 286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.590588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0879  alpha/beta hydrolase fold  44.39 
 
 		 273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.46004  normal  0.445527 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4645  alpha/beta hydrolase fold  41.35 
 
 		 265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.917363  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3718  alpha/beta hydrolase fold  41.35 
 
 		 265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0380543 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5009  alpha/beta hydrolase fold  41.26 
 
 		 288 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.97318  normal  0.569979 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3602  alpha/beta hydrolase fold  42.73 
 
 		 280 aa  168  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.949623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1225  alpha/beta hydrolase fold  41.41 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16662  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5458  alpha/beta hydrolase fold  42.27 
 
 		 285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2701  alpha/beta hydrolase fold  43.1 
 
 		 284 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3299  alpha/beta hydrolase fold  38.33 
 
 		 259 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0554  lactonase  38.96 
 
 		 390 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1418  putative lactonase (box pathway)  40.81 
 
 		 282 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.104299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0377  alpha/beta fold family hydrolase  39.39 
 
 		 277 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0364  alpha/beta fold family hydrolase  38.96 
 
 		 277 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4734  alpha/beta hydrolase fold  44.44 
 
 		 264 aa  159  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.590817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1771  alpha/beta hydrolase fold protein  38.53 
 
 		 279 aa  158  7e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4964  alpha/beta hydrolase fold  36.43 
 
 		 275 aa  158  9e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0322  lactonase  38.2 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0742  alpha/beta hydrolase fold  41.28 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4220  alpha/beta hydrolase fold protein  37.86 
 
 		 270 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4108  alpha/beta hydrolase fold  37.86 
 
 		 270 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.24138 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26310  Alpha/beta hydrolase fold protein  36.8 
 
 		 275 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.201822  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3026  hypothetical protein  40.24 
 
 		 277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0670  alpha/beta hydrolase  43.04 
 
 		 258 aa  151  8.999999999999999e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0748  alpha/beta family hydrolase  41.77 
 
 		 267 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4621  alpha/beta hydrolase fold  40.18 
 
 		 285 aa  139  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1010  alpha/beta family hydrolase  42.55 
 
 		 176 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2777  proline-specific peptidase  28.73 
 
 		 306 aa  62  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159674  decreased coverage  0.000853285 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4217  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  26.71 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2180  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  26.43 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0351  alpha/beta hydrolase fold  31.68 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1477  proline iminopeptidase like protein  26.13 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.140845 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6197  proline-specific peptidase  24.67 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.941686 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6377  proline-specific peptidase  24.33 
 
 		 300 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.843826  normal  0.494551 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 300 aa  53.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5637  hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily)  25.89 
 
 		 297 aa  53.1  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0678785  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  23.95 
 
 		 302 aa  53.1  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  27.83 
 
 		 283 aa  52.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3972  alpha/beta hydrolase fold  32.19 
 
 		 261 aa  52.8  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3309  alpha/beta hydrolase fold  35.58 
 
 		 343 aa  52.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.911918  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 271 aa  52  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  26.81 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  28.82 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  28.63 
 
 		 270 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3643  alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 		 284 aa  49.7  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  24.82 
 
 		 299 aa  49.3  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  25.2 
 
 		 285 aa  49.3  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4154  alpha/beta hydrolase  28.25 
 
 		 249 aa  49.3  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4804  alpha/beta hydrolase fold  32.77 
 
 		 325 aa  48.9  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0775  alpha/beta hydrolase fold  24.37 
 
 		 247 aa  48.9  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.841147 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4540  proline iminopeptidase, putative  24.72 
 
 		 316 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999347  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  25.5 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  25.75 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3956  alpha/beta hydrolase fold  37.21 
 
 		 334 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00786101  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  23.99 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  23.44 
 
 		 290 aa  47  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1797  alpha/beta hydrolase fold protein  26.59 
 
 		 280 aa  47  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.287372  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  23.9 
 
 		 297 aa  47  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7352  Alpha/beta hydrolase  26.69 
 
 		 291 aa  46.6  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1720  thioesterase, menaquinone synthesis protein  25.27 
 
 		 265 aa  46.6  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0409  Alpha/beta hydrolase  26.88 
 
 		 287 aa  47  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2772  putative hydrolase protein  33.94 
 
 		 312 aa  46.6  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 		 278 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  26.02 
 
 		 309 aa  46.2  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2813  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  29.94 
 
 		 258 aa  46.2  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.921733 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3282  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  25.19 
 
 		 255 aa  46.2  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1623  alpha/beta hydrolase fold  19.51 
 
 		 291 aa  45.8  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03205  Alpha/beta superfamily hydrolase  24.63 
 
 		 281 aa  45.8  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  24.64 
 
 		 283 aa  45.8  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1699  putative hydrolase  26.15 
 
 		 312 aa  44.7  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0604  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.791043 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3851  alpha/beta hydrolase fold protein  25.87 
 
 		 272 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.827885  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3126  hydrolase, alpha/beta fold family  26.32 
 
 		 301 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.83373  normal  0.0124269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4494  alpha/beta family hydrolase  37.17 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  25.99 
 
 		 271 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0853  alpha/beta hydrolase fold protein  41.98 
 
 		 454 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.577102  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2854  alpha/beta hydrolase fold protein  26.36 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  28.07 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3029  alpha/beta hydrolase fold protein  30.95 
 
 		 305 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  21.92 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  22.14 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>