253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1418 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1418  putative lactonase (box pathway)  100 
 
 
282 aa  580  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.104299  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2701  alpha/beta hydrolase fold  92.39 
 
 
284 aa  529  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832615  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0897  putative lactonase (box pathway)  72.46 
 
 
287 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0425746  normal  0.277892 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1544  alpha/beta hydrolase fold protein  67.77 
 
 
284 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1328  Alpha/beta hydrolase fold  57.03 
 
 
271 aa  308  5.9999999999999995e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2949  alpha/beta hydrolase fold  59.84 
 
 
271 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.545682  normal  0.28971 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1623  alpha/beta hydrolase fold  57.83 
 
 
280 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0882  hypothetical protein  57.26 
 
 
276 aa  297  1e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3654  alpha/beta hydrolase fold  57.26 
 
 
272 aa  291  1e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1225  alpha/beta hydrolase fold  53.99 
 
 
271 aa  285  8e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16662  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  51.98 
 
 
267 aa  278  7e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0215  alpha/beta hydrolase  54.44 
 
 
271 aa  278  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.296554  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2830  Alpha/beta hydrolase fold  47.58 
 
 
257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0879  alpha/beta hydrolase fold  46.99 
 
 
273 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.46004  normal  0.445527 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4655  Alpha/beta hydrolase  47.62 
 
 
273 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.875827 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0742  alpha/beta hydrolase fold  46.77 
 
 
273 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0748  alpha/beta family hydrolase  46.59 
 
 
267 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4372  alpha/beta family hydrolase  47.72 
 
 
270 aa  191  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.686172 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3026  hypothetical protein  44.92 
 
 
277 aa  186  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4734  alpha/beta hydrolase fold  42 
 
 
264 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.590817  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3398  Alpha/beta hydrolase fold  40.32 
 
 
255 aa  169  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2862  Alpha/beta hydrolase fold  41.6 
 
 
271 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0670  alpha/beta hydrolase  38.89 
 
 
258 aa  167  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3406  putative hydrolase-related protein  40.81 
 
 
266 aa  161  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1010  alpha/beta family hydrolase  52.07 
 
 
176 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5458  alpha/beta hydrolase fold  35.95 
 
 
285 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0554  lactonase  35.29 
 
 
390 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3602  alpha/beta hydrolase fold  34.91 
 
 
280 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.949623  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4220  alpha/beta hydrolase fold protein  33.74 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0377  alpha/beta fold family hydrolase  35.29 
 
 
277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4108  alpha/beta hydrolase fold  33.74 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.24138 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0322  lactonase  33.61 
 
 
277 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0364  alpha/beta fold family hydrolase  34.87 
 
 
277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2393  Alpha/beta hydrolase  35.08 
 
 
286 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.590588  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5009  alpha/beta hydrolase fold  33.89 
 
 
288 aa  125  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.97318  normal  0.569979 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1771  alpha/beta hydrolase fold protein  33.06 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4645  alpha/beta hydrolase fold  32.92 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.917363  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3718  alpha/beta hydrolase fold  32.92 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0380543 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3803  alpha/beta hydrolase fold  32.92 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.695303 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4964  alpha/beta hydrolase fold  31.89 
 
 
275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102964  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26310  Alpha/beta hydrolase fold protein  31.93 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.201822  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4621  alpha/beta hydrolase fold  34.43 
 
 
285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3299  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 
259 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4771  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 
278 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0144083  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  26 
 
 
276 aa  59.7  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  23.84 
 
 
299 aa  59.3  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  27.45 
 
 
300 aa  57.4  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  24.53 
 
 
297 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  27.27 
 
 
279 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  24.23 
 
 
285 aa  57  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  23.49 
 
 
302 aa  57  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1942  alpha/beta hydrolase fold  27.09 
 
 
266 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000178977  hitchhiker  0.00172948 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  22.71 
 
 
298 aa  56.2  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2136  alpha/beta hydrolase fold  27.09 
 
 
266 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000406984  decreased coverage  0.00000741326 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2333  alpha/beta fold family hydrolase  27.35 
 
 
280 aa  55.8  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 
293 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  32.06 
 
 
282 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  23.57 
 
 
295 aa  55.5  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  32.06 
 
 
282 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 
309 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2033  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 
266 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000295645  hitchhiker  0.000143979 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  23.26 
 
 
312 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3836  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
298 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.689035  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  22.84 
 
 
278 aa  53.5  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  25.36 
 
 
314 aa  53.9  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2194  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 
258 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000635452  unclonable  0.000004336 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4294  alpha/beta hydrolase fold protein  29.93 
 
 
286 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  26.47 
 
 
286 aa  53.1  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1166  alpha/beta hydrolase fold protein  20.96 
 
 
333 aa  53.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 
272 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4513  hypothetical protein  25.65 
 
 
258 aa  52.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0604  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 
297 aa  52.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.791043 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2227  alpha/beta hydrolase fold  25.65 
 
 
258 aa  52.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000690683  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  23.4 
 
 
296 aa  52.8  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4244  alpha/beta hydrolase fold  23.53 
 
 
331 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0679936  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2144  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 
258 aa  52.4  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412012  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 
271 aa  52.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1136  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 
308 aa  52.4  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  26.3 
 
 
270 aa  52.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1623  alpha/beta hydrolase fold  21.14 
 
 
291 aa  52.4  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  25.18 
 
 
275 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  25.48 
 
 
387 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  24.24 
 
 
275 aa  51.6  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2154  alpha/beta hydrolase fold protein  24.64 
 
 
257 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016859 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  24.29 
 
 
267 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  26.09 
 
 
278 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0774  esterase  38.53 
 
 
295 aa  51.2  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.391328  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  25.48 
 
 
363 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2240  alpha/beta hydrolase fold protein  25.28 
 
 
258 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000309374  hitchhiker  0.000000000781643 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  21.07 
 
 
258 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 
307 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5402  alpha/beta hydrolase fold protein  22.22 
 
 
234 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734063  normal  0.0675186 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  22.85 
 
 
270 aa  50.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2084  putative hydrolytic enzyme  24.58 
 
 
333 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  22.67 
 
 
285 aa  50.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  25.81 
 
 
387 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1880  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
258 aa  50.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000336147  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  24.07 
 
 
276 aa  50.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  23.57 
 
 
275 aa  50.1  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  24.19 
 
 
283 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.944451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>